seq1 = pF1KE3216.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KE3216/gi568815580f_24043115.tfa (gi568815580f:24043115_24256980), 213866 bp

>pF1KE3216 1479
>gi568815580f:24043115_24256980 (Chr18)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-199  (100246-100299)   100% ->
200-1479  (112587-113866)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTCTTCAAAGCCCAGACTTGTCGTACCCTATGGCCTCAAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTCTTCAAAGCCCAGACTTGTCGTACCCTATGGCCTCAAGACTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCGAGGGAATTAGCAGAGCTGTTCTCAAAACCAACCCATCAAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCGAGGGAATTAGCAGAGCTGTTCTCAAAACCAACCCATCAAACATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAGTTTGCAGCAGCTTATTTTCAAGAACTTACTATGTATAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 ACCAGTTTGCAGCAGCTTATTTTCAAGAACTTACTATGTATAGAGGTT..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GGAATACTACTATGGATATAAAAGATCTGGTTAAACAATTTCATCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGGGAATACTACTATGGATATAAAAGATCTGGTTAAACAATTTCATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATTAAAG         TAGAGAAATGGTCAGAAGGAACGACACCACAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100292 GATTAAAGGTA...CAGTAGAGAAATGGTCAGAAGGAACGACACCACAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAATTAGAATGTTTAAAAGAACCAGGAAAAACATCTGTAGAATCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112620 AGAAATTAGAATGTTTAAAAGAACCAGGAAAAACATCTGTAGAATCTAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTACCTACCCAGATGGAAAAATCTACAGACACAGACGAGGACAATGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112670 GTACCTACCCAGATGGAAAAATCTACAGACACAGACGAGGACAATGTAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGAACAGAATATAGTGACAAAACCACCCAGTTTCCATCAGTTTATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112720 CAGAACAGAATATAGTGACAAAACCACCCAGTTTCCATCAGTTTATGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCAGGCACTGAGCAAACGGAAGCAGTTGGTGGTCTTTCTTCCAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112770 TGCCAGGCACTGAGCAAACGGAAGCAGTTGGTGGTCTTTCTTCCAAACCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCACCCCTAAGACTACTACCCCACCCTCATCACCACCTCCAACAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112820 GCCACCCCTAAGACTACTACCCCACCCTCATCACCACCTCCAACAGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCACCAGAGTTTGCCTACGTCCCAGCTGACCCAGCTCAGCTTGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112870 CTCACCAGAGTTTGCCTACGTCCCAGCTGACCCAGCTCAGCTTGCTGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATGTTAGGTAAAGTTTCATCTATTCATTCTGATCAATCTGATGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112920 AGATGTTAGGTAAAGTTTCATCTATTCATTCTGATCAATCTGATGTGTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATGGTGGATGTGGCAACCAGTATGCCTGTTGTTATCAAGGAGGTGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112970 ATGGTGGATGTGGCAACCAGTATGCCTGTTGTTATCAAGGAGGTGCCAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTCAGAGGCTGCTGAAGATGTCATGGTGGCTGCTCCTCTTGTGTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113020 CTCAGAGGCTGCTGAAGATGTCATGGTGGCTGCTCCTCTTGTGTGTTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GAAAGGTGCTAGAAGTGCAGGTTGTGAACCAAACATCTGTCCATGTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113070 GAAAGGTGCTAGAAGTGCAGGTTGTGAACCAAACATCTGTCCATGTAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TTGGGTTCTCAACCTAAAGAAAATGAGGCTGAACCATCAACGGCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113120 TTGGGTTCTCAACCTAAAGAAAATGAGGCTGAACCATCAACGGCTTCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGTCCCCTTGCAGGATGAACAAGAACCTCCTGCTTATGATCAAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113170 AGTCCCCTTGCAGGATGAACAAGAACCTCCTGCTTATGATCAAGCTCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGGTCACTTTGCAGGCTGATATTGAGGTTATGTCAACTGTTCATATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113220 AGGTCACTTTGCAGGCTGATATTGAGGTTATGTCAACTGTTCATATATCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCTGTCTATAACGATGTGCCTGTGACTGAAGGAGTTGTTTATATCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113270 TCTGTCTATAACGATGTGCCTGTGACTGAAGGAGTTGTTTATATCGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ACTGCCAGAACAAATAGTTATCCCTTTTACTGATCAAGTTGCTTGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113320 ACTGCCAGAACAAATAGTTATCCCTTTTACTGATCAAGTTGCTTGTCTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AAGAAAATGAGCAGTCAAAAGAAAATGAGCAGTCACCACGAGTTAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113370 AAGAAAATGAGCAGTCAAAAGAAAATGAGCAGTCACCACGAGTTAGTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAATCTGTAGTAGAAAAGACCACCTCTGGCATGTCTAAAAAATCTGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113420 AAATCTGTAGTAGAAAAGACCACCTCTGGCATGTCTAAAAAATCTGTAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GTCTGTAAAACTTGCACAGTTGGAGGAGAATGCAAAATATTCCTCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113470 GTCTGTAAAACTTGCACAGTTGGAGGAGAATGCAAAATATTCCTCAGTAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATATGGAGGCAGAAGCAACAGCTCTGCTCTCTGACACATCTTTGAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113520 ATATGGAGGCAGAAGCAACAGCTCTGCTCTCTGACACATCTTTGAAAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CAGCCTGAGGTACCTGCACAACTCCTGGATGCAGAAGGTGCTATCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113570 CAGCCTGAGGTACCTGCACAACTCCTGGATGCAGAAGGTGCTATCAAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AGGCTCTGAAAAATCTCTGCACCTTGAAGTGGAGATCACTTCAATAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113620 AGGCTCTGAAAAATCTCTGCACCTTGAAGTGGAGATCACTTCAATAGTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CTGACAATACTGGGCAGGAGGAGTCTGGGGAAAACTCTGTACCCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113670 CTGACAATACTGGGCAGGAGGAGTCTGGGGAAAACTCTGTACCCCAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ATGGAAGGCAAACCTGTGCTCTCTGGGGAAGCTGCAGAAGCAGTGCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113720 ATGGAAGGCAAACCTGTGCTCTCTGGGGAAGCTGCAGAAGCAGTGCACTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AGGTACATCTGTAAAGTCATCTAGTGGCCCCTTCCCTCCTGCTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113770 AGGTACATCTGTAAAGTCATCTAGTGGCCCCTTCCCTCCTGCTCCAGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1433 GCCTTACTGCACCAGAAATTGAACCAGAAGGGGAATCAACAGCTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113820 GCCTTACTGCACCAGAAATTGAACCAGAAGGGGAATCAACAGCTGAA