seq1 = pF1KE3209.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KE3209/gi568815588f_47200652.tfa (gi568815588f:47200652_47412789), 212138 bp

>pF1KE3209 1434
>gi568815588f:47200652_47412789 (Chr10)

1-319  (100001-100319)   100% ->
320-1245  (109145-110070)   100% ->
1246-1434  (111950-112138)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCATGTCCCCGCTCGGACCAGCCCGGGACCCGGGCCCCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCATGTCCCCGCTCGGACCAGCCCGGGACCCGGGCCCCAGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGCTGCCGTTGTTTCTGCTGTTGCTCCGGGATGTGGCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTGCTGCCGTTGTTTCTGCTGTTGCTCCGGGATGTGGCCGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACAGGGCCCCCGCCTGGTCCGCACTGCCCGCGGCCGCCGACGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACAGGGCCCCCGCCTGGTCCGCACTGCCCGCGGCCGCCGACGGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGGGGACAGGGATCTCCAGCGGCACCCTGGGGACGCGGCCGCCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGGGGACAGGGATCTCCAGCGGCACCCTGGGGACGCGGCCGCCACGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCCCCAGCGCCCAGGACATGGTCGCTGTCCACATGCACAGGCTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCCCCAGCGCCCAGGACATGGTCGCTGTCCACATGCACAGGCTCTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGTACAGCCGGCAGGGCGCGCGGCCGGGAGGGGGCAACACGGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGTACAGCCGGCAGGGCGCGCGGCCGGGAGGGGGCAACACGGTCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTTCAGGGCCAGGCTGG         AAGTGGTCGACCAGAAGGCCGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTTCAGGGCCAGGCTGGGTA...CAGAAGTGGTCGACCAGAAGGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTATTTCTTCAACCTGACTTCCATGCAAGACTCGGAAATGATCCTTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109167 GTATTTCTTCAACCTGACTTCCATGCAAGACTCGGAAATGATCCTTACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCACTTTCCACTTCTACTCAGAGCCGCCTCGGTGGCCTCGAGCGCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109217 CCACTTTCCACTTCTACTCAGAGCCGCCTCGGTGGCCTCGAGCGCTCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGCTATGCAAGCCGCGGGCCAAGAACGCTTCAGGCCGCCCGCTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109267 GTGCTATGCAAGCCGCGGGCCAAGAACGCTTCAGGCCGCCCGCTGCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCCCGCCCACACGCCAGCACCTGCTCTTCCGCAGCCTCTCGCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109317 GGGCCCGCCCACACGCCAGCACCTGCTCTTCCGCAGCCTCTCGCAGAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGGCCACACAGGGGCTACTCCGCGGGGCCATGGCCCTGGCGCCCCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109367 CGGCCACACAGGGGCTACTCCGCGGGGCCATGGCCCTGGCGCCCCCACCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCGGCCTGTGGCAGGCCAAGGACATCTCCCCCATCGTCAAGGCGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109417 CGCGGCCTGTGGCAGGCCAAGGACATCTCCCCCATCGTCAAGGCGGCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGGGATGGCGAGCTGCTCCTCTCCGCCCAGCTGGATTCTGAGGAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109467 CCGGGATGGCGAGCTGCTCCTCTCCGCCCAGCTGGATTCTGAGGAGAGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACCCGGGGGTGCCCCGGCCCAGCCCCTATGCGCCCTACATCCTAGTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109517 ACCCGGGGGTGCCCCGGCCCAGCCCCTATGCGCCCTACATCCTAGTCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCAACGATCTGGCCATCTCGGAGCCCAACAGCGTGGCAGTGACGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109567 GCCAACGATCTGGCCATCTCGGAGCCCAACAGCGTGGCAGTGACGCTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GAGATACGACCCCTTCCCTGCCGGAGACCCCGAGCCCCGCGCAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109617 GAGATACGACCCCTTCCCTGCCGGAGACCCCGAGCCCCGCGCAGCCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACAACTCAGCGGACCCCCGCGTGCGCCGAGCCGCGCAGGCCACTGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109667 ACAACTCAGCGGACCCCCGCGTGCGCCGAGCCGCGCAGGCCACTGGGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTCCAGGACAACGAGCTGCCGGGGCTGGATGAGAGGCCGCCGCGCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109717 CTCCAGGACAACGAGCTGCCGGGGCTGGATGAGAGGCCGCCGCGCGCCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CGCACAGCACTTCCACAAGCACCAGCTGTGGCCCAGCCCCTTCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109767 CGCACAGCACTTCCACAAGCACCAGCTGTGGCCCAGCCCCTTCCGGGCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGAAACCCCGGCCAGGGCGCAAAGACCGCAGGAAGAAGGGCCAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109817 TGAAACCCCGGCCAGGGCGCAAAGACCGCAGGAAGAAGGGCCAGGAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TTCATGGCCGCCTCGCAGGTGCTGGACTTTGACGAGAAGACGATGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109867 TTCATGGCCGCCTCGCAGGTGCTGGACTTTGACGAGAAGACGATGCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGCCCGGAGGAAGCAGTGGGATGAGCCGAGGGTGTGCTCCCGGAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109917 AGCCCGGAGGAAGCAGTGGGATGAGCCGAGGGTGTGCTCCCGGAGGTACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGAAGGTGGACTTCGCAGACATCGGCTGGAATGAATGGATAATCTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109967 TGAAGGTGGACTTCGCAGACATCGGCTGGAATGAATGGATAATCTCACCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAATCTTTTGATGCCTACTACTGCGCGGGAGCATGTGAGTTCCCCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110017 AAATCTTTTGATGCCTACTACTGCGCGGGAGCATGTGAGTTCCCCATGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TAAG         ATCGTTCGTCCATCCAACCATGCCACCATCCAGAGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110067 TAAGGTA...CAGATCGTTCGTCCATCCAACCATGCCACCATCCAGAGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TTGTCAGGGCTGTGGGCATCATCCCTGGCATCCCAGAGCCCTGCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111987 TTGTCAGGGCTGTGGGCATCATCCCTGGCATCCCAGAGCCCTGCTGTGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CCCGATAAGATGAACTCCCTTGGGGTCCTCTTCCTGGATGAGAATCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112037 CCCGATAAGATGAACTCCCTTGGGGTCCTCTTCCTGGATGAGAATCGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGTGGTTCTGAAGGTGTACCCCAACATGTCCGTGGACACCTGTGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112087 TGTGGTTCTGAAGGTGTACCCCAACATGTCCGTGGACACCTGTGCCTGCC

   1450 
   1433 GG
        ||
 112137 GG