seq1 = pF1KE3206.tfa, 1428 bp
seq2 = pF1KE3206/gi568815596r_159136036.tfa (gi568815596r:159136036_159383069), 247034 bp

>pF1KE3206 1428
>gi568815596r:159136036_159383069 (Chr2)

(complement)

1-398  (100001-100398)   100% ->
399-583  (103125-103309)   100% ->
584-676  (107432-107524)   100% ->
677-770  (111275-111368)   100% ->
771-804  (123227-123260)   100% ->
805-845  (125085-125125)   100% ->
846-952  (125206-125312)   100% ->
953-1132  (126695-126874)   100% ->
1133-1273  (134558-134698)   100% ->
1274-1428  (146880-147034)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAACTGATTCACACATTAGCTGATCATGGTGACGATGTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAAACTGATTCACACATTAGCTGATCATGGTGACGATGTCAACTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGCCTTCTCCTTTTCCCTCTTGGCTACTTGCTCCTTGGACAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGCCTTCTCCTTTTCCCTCTTGGCTACTTGCTCCTTGGACAAAACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCGCCTGTACTCGTTACGTGACTTTACTGAACTGCCACATTCTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCGCCTGTACTCGTTACGTGACTTTACTGAACTGCCACATTCTCCATTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGTTTCATACCTATGCTGTCCACTGCTGCTGTTTCTCCCCTTCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGTTTCATACCTATGCTGTCCACTGCTGCTGTTTCTCCCCTTCAGGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATTTTGGCATCGTGTTCAACAGATGGTACCACTGTCCTATGGAATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TATTTTGGCATCGTGTTCAACAGATGGTACCACTGTCCTATGGAATACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAAATGGACAGATGCTGGCAGTGATGGAACAGCCTAGTGGCAGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAAATGGACAGATGCTGGCAGTGATGGAACAGCCTAGTGGCAGCCCTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGGTTTGCCAGTTTTCCCCAGACTCCACGTGTTTGGCATCAGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGGTTTGCCAGTTTTCCCCAGACTCCACGTGTTTGGCATCAGGGGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATGGAACTGTGGTTTTGTGGAATGCACAGTCATACAAATTATATAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100351 TGATGGAACTGTGGTTTTGTGGAATGCACAGTCATACAAATTATATAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    399        ATGTGGTAGTGTTAAAGATGGCTCCTTGGCGGCATGTGCATTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 A...CAGATGTGGTAGTGTTAAAGATGGCTCCTTGGCGGCATGTGCATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCTCCTAATGGAAGCTTCTTTGTCACTGGCTCCTCATGTGGTGATTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103168 TCTCCTAATGGAAGCTTCTTTGTCACTGGCTCCTCATGTGGTGATTTAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGTGTGGGATGATAAAATGAGGTGTCTGCATAGTGAAAAAGCACATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103218 AGTGTGGGATGATAAAATGAGGTGTCTGCATAGTGAAAAAGCACATGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTGGAATTACCTGCTGCGATTTTTCTTCACAGCCAGTTTCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103268 TTGGAATTACCTGCTGCGATTTTTCTTCACAGCCAGTTTCTGGTT...TA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    584  ATGGAGAACAAGGTCTTCAGTTTTTTCGACTGGCATCATGTGGTCAGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107431 GATGGAGAACAAGGTCTTCAGTTTTTTCGACTGGCATCATGTGGTCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTGCCAAGTCAAAATTTGGATTGTTTCTTTTACCCATATCTTAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107481 TTGCCAAGTCAAAATTTGGATTGTTTCTTTTACCCATATCTTAGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    677    GTTTTGAATTAAAATATAAAAGTACACTGAGTGGGCACTGTGCTCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111272 CAGGTTTTGAATTAAAATATAAAAGTACACTGAGTGGGCACTGTGCTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTTCTGGCTTGTGCTTTTTCCCATGATGGGCAGATGCTAGTCTCAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111322 GTTCTGGCTTGTGCTTTTTCCCATGATGGGCAGATGCTAGTCTCAGGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    771       GTCAGTGGATAAGTCTGTCATAGTATATGATACT         A
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111372 ...AAGGTCAGTGGATAAGTCTGTCATAGTATATGATACTGTA...CAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATACTGAGAATATACTTCACACATTGACTCAGCACACCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 125086 ATACTGAGAATATACTTCACACATTGACTCAGCACACCAGGTC...TAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TATGTCACAACTTGTGCTTTTGCACCTAATACCCTTTTACTTGCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125207 TATGTCACAACTTGTGCTTTTGCACCTAATACCCTTTTACTTGCTACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTCAATGGACAAAACAGTGAACATCTGGCAATTTGACCTGGAAACACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125257 TTCAATGGACAAAACAGTGAACATCTGGCAATTTGACCTGGAAACACTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCAAG         CAAGGCGCACAGAACATCAGCTGAAGCAATTTACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125307 GCCAAGGTT...AAGCAAGGCGCACAGAACATCAGCTGAAGCAATTTACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAAGATTGGTCAGAGGAGGATGTCTCAACATGGCTTTGTGCACAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126730 GAAGATTGGTCAGAGGAGGATGTCTCAACATGGCTTTGTGCACAAGATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAAAGATCTTGTTGGTATTTTCAAGATGAATAACATTGATGGAAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126780 AAAAGATCTTGTTGGTATTTTCAAGATGAATAACATTGATGGAAAAGAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGTTGAATCTTACAAAAGAAAGTCTGGCTGATGATTTGAAAATTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 126830 TGTTGAATCTTACAAAAGAAAGTCTGGCTGATGATTTGAAAATTGGTA..

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133     AATCTCTAGGACTGCGTAGTAAAGTGCTGAGGAAAATTGAAGAGCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126880 .CAGAATCTCTAGGACTGCGTAGTAAAGTGCTGAGGAAAATTGAAGAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CAGGACCAAGGTTAAATCCCTTTCTTCAGGAATTCCTGATGAATTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134604 CAGGACCAAGGTTAAATCCCTTTCTTCAGGAATTCCTGATGAATTTATAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTCCAATAACTAGAGAACTTATGAAAGATCCGGTCATCGCATCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 134654 GTCCAATAACTAGAGAACTTATGAAAGATCCGGTCATCGCATCAGGTA..

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274     ATGGCTATTCATATGAAAAGGAAGCAATGGAAAATTGGATCAGCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134704 .TAGATGGCTATTCATATGAAAAGGAAGCAATGGAAAATTGGATCAGCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AAAGAAACGTACAAGTCCCATGACAAATCTTGTTCTTCCTTCAGCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146926 AAAGAAACGTACAAGTCCCATGACAAATCTTGTTCTTCCTTCAGCGGTAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TTACACCAAATAGGACTCTGAAAATGGCCATCAATAGATGGCTGGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146976 TTACACCAAATAGGACTCTGAAAATGGCCATCAATAGATGGCTGGAGACA

   1500     .
   1420 CACCAAAAG
        |||||||||
 147026 CACCAAAAG