seq1 = pF1KE3205.tfa, 1428 bp
seq2 = pF1KE3205/gi568815582r_630420.tfa (gi568815582r:630420_840985), 210566 bp

>pF1KE3205 1428
>gi568815582r:630420_840985 (Chr16)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-162  (101248-101343)   100% ->
163-306  (103657-103800)   100% ->
307-439  (104588-104720)   100% ->
440-574  (106115-106249)   100% ->
575-693  (106639-106757)   100% ->
694-823  (107559-107688)   100% ->
824-896  (108613-108685)   100% ->
897-1034  (109284-109421)   100% ->
1035-1192  (109986-110143)   100% ->
1193-1428  (110331-110566)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCGCCCTTCAGCGGGGCGCTGCAGCTGACGGACCTGGATGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCGCCCTTCAGCGGGGCGCTGCAGCTGACGGACCTGGATGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCGGGCCGTCTCAG         GAGTGCATCAAGCCTGTCAAAGTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCGGGCCGTCTCAGGTG...TAGGAGTGCATCAAGCCTGTCAAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAAAGGGCGGGAAGTGGCGTGGCCAAGATTCGCATTGAAGATGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101273 AAAAAAGGGCGGGAAGTGGCGTGGCCAAGATTCGCATTGAAGATGACGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCTACTTCCAAATTAACCAA         GACGGCGGGACCCGGAGGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101323 AGCTACTTCCAAATTAACCAAGTA...TAGGACGGCGGGACCCGGAGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAGAAGGCCAAGGTCTCGCTAAACGACTGCCTGGCGTGCAGCGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103677 GGAGAAGGCCAAGGTCTCGCTAAACGACTGCCTGGCGTGCAGCGGCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCACCTCCGCAGAGACCGTGCTTATCACCCAGCAGAGCCACGAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103727 TCACCTCCGCAGAGACCGTGCTTATCACCCAGCAGAGCCACGAGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAAGGTTCTAGATGCTAACAAG         ATGGCGGCACCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103777 AAGAAGGTTCTAGATGCTAACAAGGTA...CAGATGGCGGCACCCAGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAGAGGCTGGTTGTAGTTTCGGTCTCACCACAGTCTAGAGCATCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104605 GCAGAGGCTGGTTGTAGTTTCGGTCTCACCACAGTCTAGAGCATCGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGCACGGTTTCAGCTGAATCCTACAGATACTGCCAGGAAATTAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104655 CTGCACGGTTTCAGCTGAATCCTACAGATACTGCCAGGAAATTAACCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCTTTAAAAAAATAG         GGGTGCACTTCGTCTTCGACACCGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104705 TTCTTTAAAAAAATAGGTA...CAGGGGTGCACTTCGTCTTCGACACCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTCTCAAGGCACTTCAGCCTCCTGGAGAGCCAGCGAGAGTTTGTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106140 CTTCTCAAGGCACTTCAGCCTCCTGGAGAGCCAGCGAGAGTTTGTGCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GATTCCGAGGACAGGCCGACTGCAGACAGGCGCTGCCCCTGCTGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106190 GATTCCGAGGACAGGCCGACTGCAGACAGGCGCTGCCCCTGCTGGCCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCTGCCCAG         GCTGGATCTGCTATGCCGAGAAGACTCACGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106240 GCCTGCCCAGGTG...CAGGCTGGATCTGCTATGCCGAGAAGACTCACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAGCTTCATCCTCCCCCACATCAGCACCGCCCGGTCCCCGCAGCAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106670 CAGCTTCATCCTCCCCCACATCAGCACCGCCCGGTCCCCGCAGCAGGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGCTCCCTGGTCAAGGACTTCTTCGCCCAGCAGCAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106720 TGGGCTCCCTGGTCAAGGACTTCTTCGCCCAGCAGCAGGTA...TAGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTGACCCCTGACAAGATCTACCACGTCACAGTGATGCCCTGCTATGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107562 TTGACCCCTGACAAGATCTACCACGTCACAGTGATGCCCTGCTATGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAAGCTGGAAGCCTCCAGACCCGACTTTTTCAACCAGGAGCACCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107612 AAAGCTGGAAGCCTCCAGACCCGACTTTTTCAACCAGGAGCACCAGACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGATGTGGACTGTGTCCTCACAACAG         GAGAAGTTTTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107662 GGGATGTGGACTGTGTCCTCACAACAGGTG...CAGGAGAAGTTTTCAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTGCTGGAGGAAGAGGGCGTCTCCCTCCCCGACCTGGAACCAGCCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108627 TTGCTGGAGGAAGAGGGCGTCTCCCTCCCCGACCTGGAACCAGCCCCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGACAGCCT         GTGCAGCGGTGCCTCTGCAGAGGAGCCCACCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108677 GGACAGCCTGTA...CAGGTGCAGCGGTGCCTCTGCAGAGGAGCCCACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCATCGGGGAGGGGGCTCGGGGGGCTACCTGGAGCACGTGTTCCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109316 GCCATCGGGGAGGGGGCTCGGGGGGCTACCTGGAGCACGTGTTCCGGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCGGCCCGAGAGCTCTTTGGAATCCATGTGGCTGAGGTTACCTACAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109366 GCGGCCCGAGAGCTCTTTGGAATCCATGTGGCTGAGGTTACCTACAAACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCTGAG         GAACAAAGACTTCCAGGAGGTGACACTGGAGAAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109416 CCTGAGGTC...CAGGAACAAAGACTTCCAGGAGGTGACACTGGAGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGGGCCAGGTGCTGCTGCACTTCGCAATGGCGTACGGCTTCCGCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110021 AGGGCCAGGTGCTGCTGCACTTCGCAATGGCGTACGGCTTCCGCAACATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAGAACCTGGTGCAGAGGCTCAAACGAGGGCGCTGCCCCTACCACTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110071 CAGAACCTGGTGCAGAGGCTCAAACGAGGGCGCTGCCCCTACCACTACGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGAGGTCATGGCCTGCCCCTCAG         GCTGCCTGAACGGCGGGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110121 GGAGGTCATGGCCTGCCCCTCAGGTA...TAGGCTGCCTGAACGGCGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GCCAGCTCCAGGCCCCAGACAGGCCCAGCAGAGAGCTCCTCCAGCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110349 GCCAGCTCCAGGCCCCAGACAGGCCCAGCAGAGAGCTCCTCCAGCACGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAGAGACTGTACGGCATGGTCCGGGCTGAGGCGCCCGAGGACGCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110399 GAGAGACTGTACGGCATGGTCCGGGCTGAGGCGCCCGAGGACGCGCCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGTTCAGGAGCTGTACACACACTGGCTGCAGGGCACGGACTCGGAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110449 GGTTCAGGAGCTGTACACACACTGGCTGCAGGGCACGGACTCGGAGTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CAGGTCGCTTGCTGCATACGCAGTACCACGCCGTGGAGAAGGCCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110499 CAGGTCGCTTGCTGCATACGCAGTACCACGCCGTGGAGAAGGCCAGCACT

   1500     .    :    .
   1411 GGCCTGGGCATCCGGTGG
        ||||||||||||||||||
 110549 GGCCTGGGCATCCGGTGG