seq1 = pF1KE3198.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KE3198/gi568815582f_1919903.tfa (gi568815582f:1919903_2120616), 200714 bp

>pF1KE3198 495
>gi568815582f:1919903_2120616 (Chr16)

1-411  (100000-100410)   99% ->
412-495  (100631-100714)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTGGCGCCCAGGGGAGCGGGGGGCTCCCGCGAGCCGGCCGCGGCT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 CTGGCGTGGCGCCCAGGGGAGCGGGGGGCTCCCGCGAGCCGGCCGCGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCACTGCTGCTGCTTCTGCTCCTGCTGCCGCTGCCCTCCGGCGCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100050 GGCACTGCTGCTGCTTCTGCTCCTGCTGCCGCTGCCCTCCGGCGCGTGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGCACGTGGCGAGTCCCCGCTACCACACGGTGGGCCGCGCCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100100 ACAAGCACGTGGCGAGTCCCCGCTACCACACGGTGGGCCGCGCCGCTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTCATGGGGCTGCGTCGCTCACCCTATCTGTGGCGCCGCGCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100150 CTGCTCATGGGGCTGCGTCGCTCACCCTATCTGTGGCGCCGCGCGCTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGCCGCCGGGCCCCTGGCCAGGGACACCCTCTCCCCCGAACCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100200 CGCGGCCGCCGGGCCCCTGGCCAGGGACACCCTCTCCCCCGAACCCGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCGCGAGGCTCCTCTCCTGCTGCCCTCGTGGGTTCAGGAGCTGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100250 CCCGCGAGGCTCCTCTCCTGCTGCCCTCGTGGGTTCAGGAGCTGTGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGCGACGCAGGAGCTCCCAGGCAGGGATCCCCGTCCGTGCGCCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 ACGCGACGCAGGAGCTCCCAGGCAGGGATCCCCGTCCGTGCGCCCCGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCGCGCGCCCCAGAGCCTGCGCTGGAACCGGAGTCCCTGGACTTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 CCCGCGCGCCCCAGAGCCTGCGCTGGAACCGGAGTCCCTGGACTTCAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGCTGGCCAG         AGACTTCGGAGAGACGTCTCCCGCCCAGCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100400 GAGCTGGCCAGGTA...TAGAGACTTCGGAGAGACGTCTCCCGCCCAGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGGACCCCGCAGCAAACCGCCTTGGCCTGCCCTGCCTGGCCCCCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100661 GTGGACCCCGCAGCAAACCGCCTTGGCCTGCCCTGCCTGGCCCCCGGACC

    500 
    492 GTTC
        ||||
 100711 GTTC