seq1 = pF1KE3173.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KE3173/gi568815588r_22437204.tfa (gi568815588r:22437204_22814326), 377123 bp

>pF1KE3173 1218
>gi568815588r:22437204_22814326 (Chr10)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-242  (204610-204707)   100% ->
243-339  (206304-206400)   100% ->
340-492  (222546-222698)   100% ->
493-639  (240870-241016)   100% ->
640-678  (246438-246476)   100% ->
679-792  (263555-263668)   100% ->
793-1036  (272280-272523)   100% ->
1037-1140  (274253-274356)   100% ->
1141-1218  (277046-277123)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCCCCGGCAACCTAGGGTCCTCTGTCCTGGCGAGCAAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACCCCCGGCAACCTAGGGTCCTCTGTCCTGGCGAGCAAGACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCAAGAAGAAGCACTTCGTAGCGCAGAAAGTGAAGCTGTTTCGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCAAGAAGAAGCACTTCGTAGCGCAGAAAGTGAAGCTGTTTCGGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGACCCGCTGCTCAGCGTCCTCATGTGGGGGGTAAACCACTCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 GCGACCCGCTGCTCAGCGTCCTCATGTGGGGGGTAAACCACTCGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    ATCAATGAACTGAGCCATGTTCAAATCCCTGTTATGTTGATGCCAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204607 CAGATCAATGAACTGAGCCATGTTCAAATCCCTGTTATGTTGATGCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACTTCAAAGCCTATTCAAAAATAAAGGTGGACAATCACCTTTTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204657 TGACTTCAAAGCCTATTCAAAAATAAAGGTGGACAATCACCTTTTTAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 A         AGAAAACATGCCGAGCCATTTCAAGTTTAAGGAATACTGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204707 AGTA...CAGAGAAAACATGCCGAGCCATTTCAAGTTTAAGGAATACTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCGATGGTCTTCCGTAACCTGCGGGAGAGGTTTGGAATTGATGATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206344 CCGATGGTCTTCCGTAACCTGCGGGAGAGGTTTGGAATTGATGATCAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTCCAG         AATTCCCTGACCAGGAGCGCACCCCTCCCCAACG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206394 TTTCCAGGTG...AAGAATTCCCTGACCAGGAGCGCACCCCTCCCCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTCCCAGGCCCGCAGTGGAGCTCGTTTTCACACTTCCTACGACAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222580 ACTCCCAGGCCCGCAGTGGAGCTCGTTTTCACACTTCCTACGACAAAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACATCATCAAGACTATTACCAGTGAAGACGTGGCCGAAATGCACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222630 TACATCATCAAGACTATTACCAGTGAAGACGTGGCCGAAATGCACAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGAAGAAATACCACCAG         TACATAGTGGAATGTCATGGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 222680 CCTGAAGAAATACCACCAGGTA...CAGTACATAGTGGAATGTCATGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCACCCTTCTTCCCCAGTTCTTGGGCATGTACCGGCTTAATGTTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240892 TCACCCTTCTTCCCCAGTTCTTGGGCATGTACCGGCTTAATGTTGATGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTGAAATATATGTGATAGTTACAAGAAATGTATTCAGCCACCGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240942 GTTGAAATATATGTGATAGTTACAAGAAATGTATTCAGCCACCGTTTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGTGTATAGGAAATACGACTTAAAG         GGCTCTACAGTGGCTA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 240992 TGTGTATAGGAAATACGACTTAAAGGTG...CAGGGCTCTACAGTGGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGAAGCTAGTGACAAAGAAAAG         GCCAAAGAACTGCCAACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 246454 GAGAAGCTAGTGACAAAGAAAAGGTA...TAGGCCAAAGAACTGCCAACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGAAAGATAATGATTTCATTAATGAGGGCCAAAAGATTTATATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263573 CTGAAAGATAATGATTTCATTAATGAGGGCCAAAAGATTTATATTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAACAACAAGAAGGTCTTCCTGGAAAAACTAAAAAAGGATGTTGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 263623 CAACAACAAGAAGGTCTTCCTGGAAAAACTAAAAAAGGATGTTGAGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    793      TTTCTGGCCCAGCTGAAGCTCATGGACTACAGTCTGCTGGTGGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263673 ..CAGTTTCTGGCCCAGCTGAAGCTCATGGACTACAGTCTGCTGGTGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATTCATGATGTGGAGAGAGCCGAACAGGAGGAAGTGGAGTGTGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272325 ATTCATGATGTGGAGAGAGCCGAACAGGAGGAAGTGGAGTGTGAGGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CGATGGGGAGGAGGAGGGCGAGAGCGATGGCACCCACCCGGTGGGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272375 CGATGGGGAGGAGGAGGGCGAGAGCGATGGCACCCACCCGGTGGGAACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCCAGATAGCCCCGGGAATACACTGAACAGCTCACCACCCCTGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272425 CCCCAGATAGCCCCGGGAATACACTGAACAGCTCACCACCCCTGGCTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGGGAGTTCGATCCGAACATCGACGTCTATGGAATTAAGTGCCATGAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 272475 GGGGAGTTCGATCCGAACATCGACGTCTATGGAATTAAGTGCCATGAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037         ACTCGCCTAGGAAGGAGGTGTACTTCATGGCAATTATTGACA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272525 TA...CAGACTCGCCTAGGAAGGAGGTGTACTTCATGGCAATTATTGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCCTTACTCATTATGATGCAAAAAAGAAAGCTGCCCATGCTGCAAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274295 TCCTTACTCATTATGATGCAAAAAAGAAAGCTGCCCATGCTGCAAAAACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTTAAACATGGC         GCTGGCGCGGAGATCTCCACCGTGAACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 274345 GTTAAACATGGCGTG...CAGGCTGGCGCGGAGATCTCCACCGTGAACCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1170 AGAACAGTATTCAAAGCGCTTTTTGGACTTTATTGGCCACATCTTGACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277075 AGAACAGTATTCAAAGCGCTTTTTGGACTTTATTGGCCACATCTTGACG