seq1 = pF1KE3164.tfa, 1155 bp
seq2 = pF1KE3164/gi568815581r_76211545.tfa (gi568815581r:76211545_76453619), 242075 bp

>pF1KE3164 1155
>gi568815581r:76211545_76453619 (Chr17)

(complement)

1-170  (99917-100086)   100% ->
171-223  (105039-105091)   100% ->
224-290  (108883-108949)   100% ->
291-463  (121185-121357)   100% ->
464-579  (122954-123069)   100% ->
580-635  (123522-123577)   100% ->
636-781  (124758-124903)   100% ->
782-852  (139729-139799)   100% ->
853-999  (140604-140750)   100% ->
1000-1155  (141920-142075)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAAGAAGCTGCTGCTGTTGCCCCCGCCCTCCGCGTCCTCGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99917 ATGCCCAAGAAGCTGCTGCTGTTGCCCCCGCCCTCCGCGTCCTCGGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGTCCCGCGCGCCCGCCCCGTTCCCCCGCCGGCCATGAACGCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99967 CCGCGTCCCGCGCGCCCGCCCCGTTCCCCCGCCGGCCATGAACGCCGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACCGGCTACCGAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCCGCCTGCACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 GCACCGGCTACCGAGTCTTCTCGGCCAACTCCACGGCCGCCTGCACGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCAAGCGCATCACAGA         GCGCCTTGGTGCTGAATTGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100067 CTGGCCAAGCGCATCACAGAGTA...TAGGCGCCTTGGTGCTGAATTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGTCTGTTGTATATCAAGAGACCAATGGAG         AAACAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105060 GAAGTCTGTTGTATATCAAGAGACCAATGGAGGTA...CAGAAACAAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAAATAAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108892 TTGAAATAAAAGAATCTGTTCGTGGCCAAGATATTTTCATTATACAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATACCCAG         AGATGTGAATACAGCTGTGATGGAGTTGCTCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108942 ATACCCAGGTA...CAGAGATGTGAATACAGCTGTGATGGAGTTGCTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGGCTTACGCACTGAAGACTGCCTGTGCCAGGAACATTATTGGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121218 CATGGCTTACGCACTGAAGACTGCCTGTGCCAGGAACATTATTGGGGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAGAGCAAGATGAGGAAGAGGGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121268 TCCCCTACTTCCCCTACAGCAAGCAGAGCAAGATGAGGAAGAGGGGTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTGTGTGCAAGCTGCTAGCATCCATGCTGGCGAAAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 121318 ATTGTGTGCAAGCTGCTAGCATCCATGCTGGCGAAAGCAGGTG...CAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTAACTCACATTATCACTATGGATCTTCATCAAAAGGAAATACAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122955 TTTAACTCACATTATCACTATGGATCTTCATCAAAAGGAAATACAAGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTTTCAGCTTTCCTGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123005 TTTTCAGCTTTCCTGTGGACAACCTTAGAGCCTCACCTTTCCTGCTTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATATCCAGGAAGAA         ATTCCAAATTACAGAAATGCAGTCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123055 TATATCCAGGAAGAAGTG...TAGATTCCAAATTACAGAAATGCAGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAGAG         GGCCCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123548 TGTAGCTAAGTCTCCTGATGCTGCAAAGAGGTA...TAGGGCCCAGTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGCGGAGAGACTGCGTCTGGGTTTGGCCGTCATTCACGGGGAAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124769 ATGCGGAGAGACTGCGTCTGGGTTTGGCCGTCATTCACGGGGAAGCTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGCACGGAACTGGACATGGACGATGGTCGTCACTCCCCGCCTATGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124819 TGCACGGAACTGGACATGGACGATGGTCGTCACTCCCCGCCTATGGTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAATGCTACTGTGCACCCAGGCCTGGAGTTGCCAT         TGATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 124869 AAATGCTACTGTGCACCCAGGCCTGGAGTTGCCATGTA...TAGTGATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGCCAAAGAGAAGCCACCGATAACTGTAGTTGGAGATGTTGGAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139735 TGGCCAAAGAGAAGCCACCGATAACTGTAGTTGGAGATGTTGGAGGCCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATCGCAATCATCGTG         GATGACATTATTGACGATGTGGAGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 139785 ATCGCAATCATCGTGGTA...CAGGATGACATTATTGACGATGTGGAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TTTTGTTGCTGCCGCGGAGATCCTGAAAGAGAGAGGCGCCTATAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140630 TTTTGTTGCTGCCGCGGAGATCCTGAAAGAGAGAGGCGCCTATAAGATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGTTATGGCCACCCACGGCATCCTGTCTGCAGAGGCCCCTCGCCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140680 ATGTTATGGCCACCCACGGCATCCTGTCTGCAGAGGCCCCTCGCCTGATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGGAGTCCTCCGTAGACGAG         GTGGTGGTGACGAATACTGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 140730 GAGGAGTCCTCCGTAGACGAGGTC...TAGGTGGTGGTGACGAATACTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCCTCATGAGGTTCAGAAGCTGCAATGTCCCAAGATAAAGACTGTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141940 CCCTCATGAGGTTCAGAAGCTGCAATGTCCCAAGATAAAGACTGTGGATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCAGTTTGATTCTTTCTGAAGCCATTCGGAGAATCCACAATGGAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141990 TCAGTTTGATTCTTTCTGAAGCCATTCGGAGAATCCACAATGGAGAGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1120 ATGGCCTACCTTTTCCGAAACATCACTGTGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142040 ATGGCCTACCTTTTCCGAAACATCACTGTGGATGAC