seq1 = pF1KE3146.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KE3146/gi568815590r_51720354.tfa (gi568815590r:51720354_51961151), 240798 bp

>pF1KE3146 1071
>gi568815590r:51720354_51961151 (Chr8)

(complement)

1-307  (100001-100307)   100% ->
308-410  (115389-115491)   100% ->
411-582  (127463-127634)   100% ->
583-706  (129585-129708)   100% ->
707-1071  (140434-140798)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGGAGCTGTGAGTGCTGGGGAAGATAATGATGACTTAATTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGGAGCTGTGAGTGCTGGGGAAGATAATGATGACTTAATTGATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTAAAAGAAGCTCAGTATATTCGTACTGAAAGAGTGGAGCAAGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTAAAAGAAGCTCAGTATATTCGTACTGAAAGAGTGGAGCAAGCCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGCGATTGATCGTGGAGATTACTATTTGGAAGGCTACAGAGACAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGCGATTGATCGTGGAGATTACTATTTGGAAGGCTACAGAGACAATGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACAAAGACTTAGCCTGGAAGCATGGAAACATCCACTTGTCAGCACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACAAAGACTTAGCCTGGAAGCATGGAAACATCCACTTGTCAGCACCTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTTATTCTGAAGTTATGGAAGCATTGAAACTTCAACCAGGATTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTTATTCTGAAGTTATGGAAGCATTGAAACTTCAACCAGGATTGTCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCTTAACCTGGGAAGTGGAACCGGATATTTAAGTACAATGGTGGGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCTTAACCTGGGAAGTGGAACCGGATATTTAAGTACAATGGTGGGCTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTTTAG         GTCCTTTTGGAATAAATCATGGGATTGAGCTTCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTTTAGGTA...CAGGTCCTTTTGGAATAAATCATGGGATTGAGCTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCAGATGTGGTGGAATATGCCAAGGAAAAACTGGAGAGCTTCATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115423 TTCAGATGTGGTGGAATATGCCAAGGAAAAACTGGAGAGCTTCATCAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATAGTGATAGCTTTGATAA         ATTTGAGTTCTGTGAACCTGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115473 ATAGTGATAGCTTTGATAAGTA...CAGATTTGAGTTCTGTGAACCTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGTTGTTGGTAATTGCCTCCAGATAGCTTCTGACAGTCATCAGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127485 TTTGTTGTTGGTAATTGCCTCCAGATAGCTTCTGACAGTCATCAGTATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCGAATTTATTGTGGAGCTGGAGTGCAGAAAGACCATGAAAACTACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127535 TCGAATTTATTGTGGAGCTGGAGTGCAGAAAGACCATGAAAACTACATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAATATTACTAAAAGTTGGAGGCATATTAGTCATGCCTATAGAGGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127585 AAATATTACTAAAAGTTGGAGGCATATTAGTCATGCCTATAGAGGATCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583          TTAACACAGATTATGCGAACTGGACAGAACACTTGGGAAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127635 GTA...TAGTTAACACAGATTATGCGAACTGGACAGAACACTTGGGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAAAAATATCCTTGCTGTTTCATTTGCTCCACTTGTGCAACCAAGTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129626 TAAAAATATCCTTGCTGTTTCATTTGCTCCACTTGTGCAACCAAGTAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGATAATGGCAAACCAGATTCTGTGGGACTCC         CTCCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129676 ATGATAATGGCAAACCAGATTCTGTGGGACTCCGTA...TAGCTCCCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTGTCAGGAATCTACAGGACTTGGCTCGTATTTACATTCGACGCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140442 GCTGTCAGGAATCTACAGGACTTGGCTCGTATTTACATTCGACGCACACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAGAAATTTCATAAATGATGAGATGCAGGCCAAGGGGATTCCTCAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140492 TAGAAATTTCATAAATGATGAGATGCAGGCCAAGGGGATTCCTCAAAGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCCACCCAAAAGGAAAAGAAAGAGAGTTAAACAGAGAATTAACACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140542 CTCCACCCAAAAGGAAAAGAAAGAGAGTTAAACAGAGAATTAACACTTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTATTTGTGGGTAATCAGCTTATTCCTCAGCCTCTAGACAGTGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140592 GTATTTGTGGGTAATCAGCTTATTCCTCAGCCTCTAGACAGTGAAGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGAAAAAATGGAAGAGGATAACAAAGAAGAGGAGGAAAAAGATCACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140642 TGAAAAAATGGAAGAGGATAACAAAGAAGAGGAGGAAAAAGATCACAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAGCAATGAAGCCAGAGGAGCCACCTCAAAATTTACTGAGAGAAAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140692 AAGCAATGAAGCCAGAGGAGCCACCTCAAAATTTACTGAGAGAAAAAATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATGAAGCTGCCCCTCCCTGAATCTTTAAAAGCTTACTTGACATATTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140742 ATGAAGCTGCCCCTCCCTGAATCTTTAAAAGCTTACTTGACATATTTTAG

   1100     .
   1065 AGACAAA
        |||||||
 140792 AGACAAA