seq1 = pF1KE3145.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KE3145/gi568815591r_80358674.tfa (gi568815591r:80358674_80611926), 253253 bp

>pF1KE3145 1062
>gi568815591r:80358674_80611926 (Chr7)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-161  (117280-117322)   100% ->
162-303  (123251-123392)   100% ->
304-461  (132929-133086)   100% ->
462-590  (137548-137676)   100% ->
591-720  (149296-149425)   100% ->
721-874  (149615-149768)   100% ->
875-1062  (153066-153253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAGTGGAATTAGTTCAGAGAGCAAGGAGTCAGCCAAAAGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAGTGGAATTAGTTCAGAGAGCAAGGAGTCAGCCAAAAGATCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAACTGGAGAAAAAGCTTCAGGAGGATGCTGAGCGAGATGCAAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAACTGGAGAAAAAGCTTCAGGAGGATGCTGAGCGAGATGCAAGAACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAAGCTGCTACTATTAG         GAGCAGGAGAATCTGGGAAAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 TAAAGCTGCTACTATTAGGTA...CAGGAGCAGGAGAATCTGGGAAAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTATTGTTAAACAAATGAA         GATCATCCATAAGAATGGTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117303 ACTATTGTTAAACAAATGAAGTA...TAGGATCATCCATAAGAATGGTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGTGAGCAAGAATGCATGGAGTTCAAAGCAGTAATTTACAGTAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123272 CAGTGAGCAAGAATGCATGGAGTTCAAAGCAGTAATTTACAGTAATACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAATCCATCCTAGCTATTGTGAAAGCCATGACTACCCTTGGAATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123322 TGCAATCCATCCTAGCTATTGTGAAAGCCATGACTACCCTTGGAATTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGTAAATCCCAGAAGTGCA         GAGGACCAACGACAACTTTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 123372 TATGTAAATCCCAGAAGTGCAGTA...TAGGAGGACCAACGACAACTTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCAATGGCAAATACCCTGGAAGATGGTGGCATGACACCTCAACTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132949 TGCAATGGCAAATACCCTGGAAGATGGTGGCATGACACCTCAACTGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTAATAAAACGGCTGTGGAGAGATCCAGGAATTCAGGCCTGCTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132999 AGGTAATAAAACGGCTGTGGAGAGATCCAGGAATTCAGGCCTGCTTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGGGCATCTGAATATCAGCTCAATGACTCAGCAGCTTA         CTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 133049 AGGGCATCTGAATATCAGCTCAATGACTCAGCAGCTTAGTA...TAGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTTAATGATTTAGATAGAATAACAGCATCTGGGTATGTGCCAAATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137551 CCTTAATGATTTAGATAGAATAACAGCATCTGGGTATGTGCCAAATGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGATGTTCTCCATTCTCGAGTGAAAACGACTGGAATCATTGAAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137601 AAGATGTTCTCCATTCTCGAGTGAAAACGACTGGAATCATTGAAACTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTCTCCTTTAAAGACTTGCACTTCAG         GATGTTTGATGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 137651 TTCTCCTTTAAAGACTTGCACTTCAGGTA...AAGGATGTTTGATGTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGACAGAGATCTGAGAGAAAGAAGTGGATTCACTGCTTTGAAGGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149311 TGGACAGAGATCTGAGAGAAAGAAGTGGATTCACTGCTTTGAAGGAGTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CATGCATTATATTTTGTGCTGCACTTAGTGCCTATGACATGGTCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149361 CATGCATTATATTTTGTGCTGCACTTAGTGCCTATGACATGGTCCTCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAGACGAAGAAGTG         AATAGAATGCATGAAAGCCTTCACCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 149411 GAAGACGAAGAAGTGGTA...CAGAATAGAATGCATGAAAGCCTTCACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTTCAACAGTATCTGTAATCACAAGTATTTTTCAACAACCTCCATTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149641 GTTCAACAGTATCTGTAATCACAAGTATTTTTCAACAACCTCCATTGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGTTCCTCAACAAAAAAGATATCTTTCAAGAAAAGGTAACCAAGGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149691 TGTTCCTCAACAAAAAAGATATCTTTCAAGAAAAGGTAACCAAGGTGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTAGTATCTGCTTTCCAGAATACACTG         GGCCAAATACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 149741 CTTAGTATCTGCTTTCCAGAATACACTGGTA...AAGGGCCAAATACATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGAAGATGCAGGAAACTACATCAAGAACCAGTTTCTAGACCTGAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153079 TGAAGATGCAGGAAACTACATCAAGAACCAGTTTCTAGACCTGAATTTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAAAAGAAGATAAGGAAATTTATTCCCACATGACCTGTGCTACTGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153129 AAAAAGAAGATAAGGAAATTTATTCCCACATGACCTGTGCTACTGACACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAAAATGTCAAGTTTGTGTTTGACGCAGTTACAGATATAATAATCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153179 CAAAATGTCAAGTTTGTGTTTGACGCAGTTACAGATATAATAATCAAAGA

   1100     .    :    .    :    .
   1038 GAATCTAAAAGACTGTGGGCTTTTC
        |||||||||||||||||||||||||
 153229 GAATCTAAAAGACTGTGGGCTTTTC