seq1 = pF1KE3130.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE3130/gi568815590f_90970295.tfa (gi568815590f:90970295_91184865), 214571 bp

>pF1KE3130 969
>gi568815590f:90970295_91184865 (Chr8)

1-172  (100001-100172)   100% ->
173-324  (100844-100995)   100% ->
325-405  (103537-103617)   100% ->
406-718  (108062-108374)   100% ->
719-780  (110375-110436)   100% ->
781-887  (113714-113820)   100% ->
888-969  (114490-114571)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCCGGGTGAGGGTTGAGGGGTGGAAGGTGCCTACTAGCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCCGGGTGAGGGTTGAGGGGTGGAAGGTGCCTACTAGCCGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGTTTCTTCTAGCGCGTGTGCTGGGGTACCTGGTCGTCATGGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGTTTCTTCTAGCGCGTGTGCTGGGGTACCTGGTCGTCATGGAGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTGACCGAAGAGCTTGATGAGGAAGAGCAGCTGCTGAGAAGGCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTGACCGAAGAGCTTGATGAGGAAGAGCAGCTGCTGAGAAGGCATCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGAGAAGAAGGAGTTGCAAG         CCAAAATTCAGGGCATGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100151 AAAGAGAAGAAGGAGTTGCAAGGTG...CAGCCAAAATTCAGGGCATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAATGCTGTTCCCAAGAATGACAAGAAGAGGAGGAAGCAACTCACCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100863 GAATGCTGTTCCCAAGAATGACAAGAAGAGGAGGAAGCAACTCACCGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTGGCCAAGTTGGAAAAAGAAATGGAACAGAAACATAGAGAGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 ATGTGGCCAAGTTGGAAAAAGAAATGGAACAGAAACATAGAGAGGAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGCAATTGAAGCTGACTACTAAGGAGAATAAG         ATAGATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100963 GAGCAATTGAAGCTGACTACTAAGGAGAATAAGGTA...CAGATAGATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTGCTGTTAACATTTCAAACTTGGTGCTTGAGAATCAGCCACCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103545 TGTTGCTGTTAACATTTCAAACTTGGTGCTTGAGAATCAGCCACCTCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TATCAAAAGCACAAAAGAGACGG         GAAAAGAAAGCTGCATTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103595 TATCAAAAGCACAAAAGAGACGGGTA...TAGGAAAAGAAAGCTGCATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAAAGGAGCGAGAAGAACGGATAGCTGAAGCTGAAATTGAAAACTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108080 GAAAAGGAGCGAGAAGAACGGATAGCTGAAGCTGAAATTGAAAACTTAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGAGCCAGACATATGGAAAGTGAGAAACTTGCTCAAATATTGGCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108130 AGGAGCCAGACATATGGAAAGTGAGAAACTTGCTCAAATATTGGCAGCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GACAGTTAGAAATTAAACAGATTCCATCTGATGGCCACTGTATGTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108180 GACAGTTAGAAATTAAACAGATTCCATCTGATGGCCACTGTATGTATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCATTGAAGATCAACTGAAAGAAAAGGATTGTGCTCTGACTGTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108230 GCCATTGAAGATCAACTGAAAGAAAAGGATTGTGCTCTGACTGTGGTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTGAGAAGTCAGACCGCTGAGTATATGCAAAGCCATGTGGAAGACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108280 CTTGAGAAGTCAGACCGCTGAGTATATGCAAAGCCATGTGGAAGACTTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCATTTTTAACAAACCCTAATACAGGAGATATGTATACTCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 108330 TGCCATTTTTAACAAACCCTAATACAGGAGATATGTATACTCCAGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    719     AAGAATTTCAGAAGTACTGTGAAGATATTGTAAACACAGCTGCATG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108380 .CAGAAGAATTTCAGAAGTACTGTGAAGATATTGTAAACACAGCTGCATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGGAGGTCAGCTTGAG         CTAAGAGCTCTGTCTCACATTTTAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110421 GGGAGGTCAGCTTGAGGTA...TAGCTAAGAGCTCTGTCTCACATTTTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAACACCAATAGAGATAATACAGGCAGATTCTCCTCCCATTATAGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113739 AAACACCAATAGAGATAATACAGGCAGATTCTCCTCCCATTATAGTTGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAAGAATATTCAAAAAAACCACTAATACTTGT         ATATATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113789 GAAGAATATTCAAAAAAACCACTAATACTTGTGTA...CAGATATATGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACATGCATATGGCTTAGGAGAACATTATAATTCGGTTACACGGTTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114499 ACATGCATATGGCTTAGGAGAACATTATAATTCGGTTACACGGTTGGTAA

   1000     .    :    .    :
    947 ACATAGTTACTGAAAATTGCAGC
        |||||||||||||||||||||||
 114549 ACATAGTTACTGAAAATTGCAGC