seq1 = pF1KE3110.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KE3110/gi568815582f_490292.tfa (gi568815582f:490292_727619), 237328 bp

>pF1KE3110 843
>gi568815582f:490292_727619 (Chr16)

1-142  (100001-100142)   100% ->
143-203  (126917-126977)   100% ->
204-264  (127909-127969)   100% ->
265-342  (135141-135218)   100% ->
343-565  (135608-135830)   100% ->
566-843  (137051-137328)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTCGCAGGGCAGTCCGGTGAAGAGCTACGACTACCTGCTCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTCGCAGGGCAGTCCGGTGAAGAGCTACGACTACCTGCTCAAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGGTGGGCGACAGCGACGTGGGCAAGGGCGAGATCCTGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGGTGGGCGACAGCGACGTGGGCAAGGGCGAGATCCTGGAGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGGACGGCGCGGCAGAGTCCCCGTACGCCTACAGTAACG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100101 TGCAGGACGGCGCGGCAGAGTCCCCGTACGCCTACAGTAACGGTA...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143  GGATCGACTACAAGACCACCACCATCCTGCTGGACGGCCGGCGCGTGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126916 GGGATCGACTACAAGACCACCACCATCCTGCTGGACGGCCGGCGCGTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGAGCTCTG         GGACACGTCGGGCCAGGGCCGGTTCTGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 126966 GCTGGAGCTCTGGTG...CAGGGACACGTCGGGCCAGGGCCGGTTCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCATCTTCAGGTCCTACTCCAGGGGCGCTCAG         GGGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 127938 CCATCTTCAGGTCCTACTCCAGGGGCGCTCAGGTA...CAGGGGATCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGGTGTATGACATCACCAACCGCTGGTCCTTTGACGGCATCGACCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135150 TTGGTGTATGACATCACCAACCGCTGGTCCTTTGACGGCATCGACCGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATCAAGGAGATCGATGAG         CATGCACCCGGAGTCCCCCGGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 135200 GATCAAGGAGATCGATGAGGTA...CAGCATGCACCCGGAGTCCCCCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCTTGGTTGGAAACCGGCTGCACCTGGCCTTCAAGCGGCAGGTCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135630 TCTTGGTTGGAAACCGGCTGCACCTGGCCTTCAAGCGGCAGGTCCCGACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGCAGGCCCGCGCGTACGCAGAGAAGAACTGCATGACCTTCTTTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135680 GAGCAGGCCCGCGCGTACGCAGAGAAGAACTGCATGACCTTCTTTGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGCCCCCTGTGCAACTTCAACGTCATCGAGTCCTTCACGGAGCTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135730 CAGCCCCCTGTGCAACTTCAACGTCATCGAGTCCTTCACGGAGCTATCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCATCGTGCTCATGCGGCACGGCATGGAGAAGATCTGGAGGCCCAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135780 GCATCGTGCTCATGCGGCACGGCATGGAGAAGATCTGGAGGCCCAACCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 G         TGTTCAGCCTGCAGGACCTCTGCTGCCGGGCCATCGTCTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135830 GGTG...CAGTGTTCAGCCTGCAGGACCTCTGCTGCCGGGCCATCGTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGCACCCCCGTGCACCTCATCGACAAGCTTCCACTGCCCGTCACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137091 CTGCACCCCCGTGCACCTCATCGACAAGCTTCCACTGCCCGTCACCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAGCCACCTCAAGTCCTTCTCGATGGCCAACGGCATGAACGCGGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137141 AGAGCCACCTCAAGTCCTTCTCGATGGCCAACGGCATGAACGCGGTCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGCACGGCCGTTCCTACTCCCTGGCCAGCGGGGCCGGGGGCGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137191 ATGCACGGCCGTTCCTACTCCCTGGCCAGCGGGGCCGGGGGCGGCGGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGGGCAACAGCCTCAAGAGGTCCAAGTCCATCCGTCCACCCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137241 CAAGGGCAACAGCCTCAAGAGGTCCAAGTCCATCCGTCCACCCCAGAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .
    806 CCCCCCAGAACTGCTCGCGGAGTAACTGCAAGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137291 CCCCCCAGAACTGCTCGCGGAGTAACTGCAAGATCTCC