seq1 = pF1KE3105.tfa, 777 bp
seq2 = pF1KE3105/gi568815597r_1155206.tfa (gi568815597r:1155206_1367992), 212787 bp

>pF1KE3105 777
>gi568815597r:1155206_1367992 (Chr1)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-172  (104607-104647)   100% ->
173-275  (110683-110785)   100% ->
276-414  (110863-111001)   100% ->
415-495  (111868-111948)   100% ->
496-777  (112506-112787)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAGCACCAGCAGTAAGAGGGCTCCGACCACGGCAACCCAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAGCACCAGCAGTAAGAGGGCTCCGACCACGGCAACCCAGAGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCAGGACTACCTTCGCATTAAGAAAGACCCGGTGCCTTACATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCAGGACTACCTTCGCATTAAGAAAGACCCGGTGCCTTACATCTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGCCCCTCCCTTCGAATATTCTCGAGTG         GCACTATGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 CCGAGCCCCTCCCTTCGAATATTCTCGAGTGGTA...TAGGCACTATGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCGAGGCCCAGAGATGACCCCTTATGAAG         GTGGCTATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104617 GTCCGAGGCCCAGAGATGACCCCTTATGAAGGTA...TAGGTGGCTATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCATGGAAAACTAATTTTTCCCAGAGAATTTCCTTTCAAACCTCCCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110693 TCATGGAAAACTAATTTTTCCCAGAGAATTTCCTTTCAAACCTCCCAGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTATATGATCACTCCCAACGGGAGGTTTAAGTGCAACACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110743 TCTATATGATCACTCCCAACGGGAGGTTTAAGTGCAACACCAGGTA...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   GCTGTGTCTTTCTATCACGGATTTCCACCCGGACACGTGGAACCCGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110861 AGGCTGTGTCTTTCTATCACGGATTTCCACCCGGACACGTGGAACCCGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGGTCTGTCTCCACCATCCTGACTGGGCTCCTGAGCTTCATGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110911 CTGGTCTGTCTCCACCATCCTGACTGGGCTCCTGAGCTTCATGGTGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGGCCCCACCCTGGGCAGTATAGAGACGTCGGACTTCACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 110961 AGGGCCCCACCCTGGGCAGTATAGAGACGTCGGACTTCACGGTA...TAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAAGACAACTGGCAGTGCAGAGTTTAGCATTTAATTTGAAAGATAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111868 AAAAGACAACTGGCAGTGCAGAGTTTAGCATTTAATTTGAAAGATAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTTTGTGAATTATTTCCTGAAGTCGTGGAG         GAGATTAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111918 CTTTTGTGAATTATTTCCTGAAGTCGTGGAGGTA...TAGGAGATTAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAAAACAGAAAGCACAAGACGAACTCAGTAGCAGACCCCAGACTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112516 AAAAACAGAAAGCACAAGACGAACTCAGTAGCAGACCCCAGACTCTCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTGCCAGACGTGGTTCCAGACGGGGAGACGCACCTCGTCCAGAACGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112566 TTGCCAGACGTGGTTCCAGACGGGGAGACGCACCTCGTCCAGAACGGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGCTGCTCAACGGGCATGCGCCGGGGGCCGTCCCAAACCTCGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112616 TCAGCTGCTCAACGGGCATGCGCCGGGGGCCGTCCCAAACCTCGCAGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCCAGCAGGCCAACCGGCACCACGGACTCCTGGGTGGCGCCCTGGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112666 TCCAGCAGGCCAACCGGCACCACGGACTCCTGGGTGGCGCCCTGGCGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTGTTTGTGATAGTTGGGTTTGCAGCCTTTGCTTACACGGTCAAGTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112716 TTGTTTGTGATAGTTGGGTTTGCAGCCTTTGCTTACACGGTCAAGTACGT

    800     .    :    .    :
    756 GCTGAGGAGCATCGCGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||
 112766 GCTGAGGAGCATCGCGCAGGAG