seq1 = pF1KE3096.tfa, 801 bp
seq2 = pF1KE3096/gi568815579r_50978010.tfa (gi568815579r:50978010_51182637), 204628 bp

>pF1KE3096 801
>gi568815579r:50978010_51182637 (Chr19)

(complement)

1-26  (99891-99916)   100% ->
27-88  (100002-100063)   100% ->
89-260  (100935-101106)   98% ->
261-514  (102936-103189)   100% ->
515-651  (103687-103823)   100% ->
652-801  (104479-104628)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCTGAGGGTCTTGGGCTCTGG         GACCTGGCCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  99891 ATGTCCCTGAGGGTCTTGGGCTCTGGGTA...CAGGACCTGGCCCTCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCCTAAAATGTTCCTCCTGCTGACAGCACTTCAAGTCCTGGCTATAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100017 CCCTAAAATGTTCCTCCTGCTGACAGCACTTCAAGTCCTGGCTATAGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     89       CCATGACACGGAGCCAAGAGGATGAGAACAAGATAATTGGTGGC
        ...>>>||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 ...TAGCCATGACACAGAGCCAAGAGGATGAGAACAAGATAATTGGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TATACGTGCACCCGGAGCTCCCAGCCGTGGCAGGCGGCCCTGCTGGCGGG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100979 CATACGTGCACCCGGAGCTCCCAGCCGTGGCAGGCGGCCCTGCTGGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCCAGGCGCCGCTTCCTCTGCGGAGGCGCCCTGCTTTCAGGCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 TCCCAGGCGCCGCTTCCTCTGCGGAGGCGCCCTGCTTTCAGGCCAGTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATCACTGCTGCTCACTGCGGCCGCCC         GATCCTTCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101079 TCATCACTGCTGCTCACTGCGGCCGCCCGTA...CAGGATCCTTCAGGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCCTGGGCAAGCACAACCTGAGGAGGTGGGAGGCCACCCAGCAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102949 GCCCTGGGCAAGCACAACCTGAGGAGGTGGGAGGCCACCCAGCAGGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGCGTGGTTCGTCAGGTGACGCACCCCAACTACAACTCCCGGACCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102999 GCGCGTGGTTCGTCAGGTGACGCACCCCAACTACAACTCCCGGACCCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAACGACCTCATGCTGCTGCAGCTACAGCAGCCCGCACGGATCGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103049 ACAACGACCTCATGCTGCTGCAGCTACAGCAGCCCGCACGGATCGGGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAGTCAGGCCCATTGAGGTCACCCAGGCCTGTGCCAGCCCCGGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103099 GCAGTCAGGCCCATTGAGGTCACCCAGGCCTGTGCCAGCCCCGGGACCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGCCGAGTGTCAGGCTGGGGAACTATATCCAGCCCCATCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103149 CTGCCGAGTGTCAGGCTGGGGAACTATATCCAGCCCCATCGGTG...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAGGTACCCCGCCTCTCTGCAATGCGTGAACATCAACATCTCCCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103687 CCAGGTACCCCGCCTCTCTGCAATGCGTGAACATCAACATCTCCCCGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGGTGTGCCAGAAGGCCTATCCTAGAACCATCACGCCTGGCATGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103737 GAGGTGTGCCAGAAGGCCTATCCTAGAACCATCACGCCTGGCATGGTCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCAGGAGTTCCCCAGGGCGGGAAGGACTCTTGTCAG         GGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103787 TGCAGGAGTTCCCCAGGGCGGGAAGGACTCTTGTCAGGTA...CAGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACTCTGGGGGACCCCTGGTGTGCAGAGGACAGCTCCAGGGCCTCGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104483 ACTCTGGGGGACCCCTGGTGTGCAGAGGACAGCTCCAGGGCCTCGTGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGGGGAATGGAGCGCTGCGCCCTGCCTGGCTACCCCGGTGTCTACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104533 TGGGGAATGGAGCGCTGCGCCCTGCCTGGCTACCCCGGTGTCTACACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    756 CCTGTGCAAGTACAGAAGCTGGATTGAGGAAACGATGCGGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104583 CCTGTGCAAGTACAGAAGCTGGATTGAGGAAACGATGCGGGACAAA