seq1 = pF1KE3086.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE3086/gi568815579f_727847.tfa (gi568815579f:727847_931874), 204028 bp

>pF1KE3086 753
>gi568815579f:727847_931874 (Chr19)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-215  (100384-100540)   100% ->
216-360  (101716-101860)   100% ->
361-594  (102862-103095)   99% ->
595-753  (103870-104028)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCGGCTGACAGTCCTGGCCCTGCTGGCTGGTCTGCTGGCGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCGGCTGACAGTCCTGGCCCTGCTGGCTGGTCTGCTGGCGTCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGCCG         GCTCCAGCCCCCTTTTGGACATCGTTGGCGGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGGCCGGTG...CAGGCTCCAGCCCCCTTTTGGACATCGTTGGCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAGGCGAGGCCCCGCCAGTTCCCGTTCCTGGCCTCCATTCAGAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100417 GGAAGGCGAGGCCCCGCCAGTTCCCGTTCCTGGCCTCCATTCAGAATCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAGGCACTTCTGCGGGGGTGCCCTGATCCATGCCCGCTTCGTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100467 GGCAGGCACTTCTGCGGGGGTGCCCTGATCCATGCCCGCTTCGTGATGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCGGCCAGCTGCTTCCAAAGCCA         GAACCCCGGGGTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100517 CGCGGCCAGCTGCTTCCAAAGCCAGTG...CAGGAACCCCGGGGTTAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGTGGTGCTGGGTGCCTATGACCTGAGGCGGCGGGAGAGGCAGTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101733 CCGTGGTGCTGGGTGCCTATGACCTGAGGCGGCGGGAGAGGCAGTCCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGACGTTTTCCATCAGCAGCATGAGCGAGAATGGCTACGACCCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 CAGACGTTTTCCATCAGCAGCATGAGCGAGAATGGCTACGACCCCCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAACCTGAACGACCTGATGCTGCTTCAG         CTGGACCGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101833 GAACCTGAACGACCTGATGCTGCTTCAGGTG...CAGCTGGACCGTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAACCTCACCAGCAGCGTGACGATACTGCCACTGCCTCTGCAGAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102875 CCAACCTCACCAGCAGCGTGACGATACTGCCACTGCCTCTGCAGAACGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGTGGAAGCCGGCACCAGATGCCAGGTGGCCGGCTGGGGGAGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102925 ACGGTGGAAGCCGGCACCAGATGCCAGGTGGCCGGCTGGGGGAGCCAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTGGGGGGCGTCTCTCCCGTTTTCCCAGGTTCGTCAACGTGACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 102975 CAGTGGGGGGCGTCTCTCCCGTTTTCCCAGGTTTGTCAACGTGACTGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCCCGAGGACCAGTGTCGCCCCAACAACGTGTGCACCGGTGTGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103025 CCCCCGAGGACCAGTGTCGCCCCAACAACGTGTGCACCGGTGTGCTCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGCCGCGGTGGCATCTGCAAT         GGGGACGGGGGCACCCCCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103075 CGCCGCGGTGGCATCTGCAATGTG...CAGGGGGACGGGGGCACCCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTCTGCGAGGGCCTGGCCCACGGCGTGGCCTCCTTTTCCCTGGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103890 CGTCTGCGAGGGCCTGGCCCACGGCGTGGCCTCCTTTTCCCTGGGGCCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTGGCCGAGGCCCTGACTTCTTCACCCGAGTGGCGCTCTTCCGAGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103940 GTGGCCGAGGCCCTGACTTCTTCACCCGAGTGGCGCTCTTCCGAGACTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .
    715 ATCGATGGTGTTCTCAACAACCCGGGACCGGGGCCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103990 ATCGATGGTGTTCTCAACAACCCGGGACCGGGGCCAGCC