seq1 = pF1KE3066.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KE3066/gi568815594r_13268561.tfa (gi568815594r:13268561_13584150), 315590 bp

>pF1KE3066 663
>gi568815594r:13268561_13584150 (Chr4)

(complement)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-172  (104625-104721)   100% ->
173-261  (109745-109833)   100% ->
262-391  (123323-123452)   100% ->
392-495  (202557-202660)   100% ->
496-573  (207529-207606)   100% ->
574-663  (215501-215590)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAAG         ACCTCCTTAACTACGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 GCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAAGGTC...TAGACCTCCTTAACTACGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104641 GTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATTTCTTTTTGAGAAGGATAACATTGCCAG         GAAACTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104691 GATTTCTTTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGTA...TAGGAAACTTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATAGGAGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109755 TGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATAGGAGGCAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAG         GGAGTCCTCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109805 TGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGTA...CAGGGAGTCCTCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTATATGATATTACAAATTATCAAAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123335 GTATATGATATTACAAATTATCAAAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123385 TACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGGTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTTGGTAGGCAATAAAA         TTGATTTGGAGCATATGCGAACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 123435 CCTTGGTAGGCAATAAAAGTA...TAGTTGATTTGGAGCATATGCGAACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGCCAGGAAAATGGTTTTAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202580 ATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGCCAGGAAAATGGTTTTAGTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCT         GTCTTCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 202630 CCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTA...TAGGTCTTCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCTTTCAGAAAGTTGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207539 GCTTTCAGAAAGTTGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAATAGAACAGTCACAG         AGGGTGGTGAAGGCAGATATTGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 207589 GAAATAGAACAGTCACAGGTG...CAGAGGGTGGTGAAGGCAGATATTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215524 AAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCT

    700     .    :    .
    647 CTATGTGTGCAGTTCAG
        |||||||||||||||||
 215574 CTATGTGTGCAGTTCAG