seq1 = pF1KE3064.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KE3064/gi568815593r_565105.tfa (gi568815593r:565105_870113), 305009 bp

>pF1KE3064 657
>gi568815593r:565105_870113 (Chr5)

(complement)

1-311  (192054-192364)   99% ->
312-465  (203991-204144)   100% ->
466-657  (204818-205009)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACAAGGCCAAGCCTGCCAAAGCTGCCAACAGGACGCCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192054 ATGGCTGACAAGGCCAAGCCTGCCAAAGCTGCCAACAGGACGCCCCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCCCGGGGGACCCCTCGAAGGACCGGGCAGCCAAGAGGCTGTCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192104 GTCCCCGGGGGACCCCTCGAAGGACCGGGCAGCCAAGAGGCTGTCGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATCGGAGGGTGCCGGTGAGGGGGCAGCCGCATCCCCTGAGCTCAGTGCC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192154 AATCGGAGGGTGCTGGTGAGGGGGCAGCCGCATCCCCTGAGCTCAGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGAGGAGGCCTTCCGGCGCTTTGCCGTGCACGGGGACGCCAGGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192204 CTGGAGGAGGCCTTCCGGCGCTTTGCCGTGCACGGGGACGCCAGGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGGAGGGAGATGCACGGCAAGAACTGGTCGAAGCTGTGCAAGGACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192254 CGGGAGGGAGATGCACGGCAAGAACTGGTCGAAGCTGTGCAAGGACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTGATCGACGGCAGGAACGTGACCGTCACTGACGTGGACATCGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192304 AGGTGATCGACGGCAGGAACGTGACCGTCACTGACGTGGACATCGTCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCAAGATCAA         AGGGAAGTCTTGCCGGACCATCACCTTTGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 192354 AGCAAGATCAAGTG...TAGAGGGAAGTCTTGCCGGACCATCACCTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCAGTTCCAGGAGGCGCTGGAGGAGCTCGCCAAGAAGCGATTCAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204021 GCAGTTCCAGGAGGCGCTGGAGGAGCTCGCCAAGAAGCGATTCAAAGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAGCAGCGAGGAGGCCGTTCGCGAGGTGCACAGGCTCATCGAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204071 AGAGCAGCGAGGAGGCCGTTCGCGAGGTGCACAGGCTCATCGAGGGCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCGCCCATCATCTCAGGGGTGACG         AAAGCCATCTCGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 204121 GCGCCCATCATCTCAGGGGTGACGGTG...CAGAAAGCCATCTCGTCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACAGTGTCGAGGCTCACGGACACCACCAAGTTCACGGGCTCCCACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204835 CACAGTGTCGAGGCTCACGGACACCACCAAGTTCACGGGCTCCCACAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCGCTTCGACCCCTCTGGCAAGGGCAAGGGCAAGGCTGGCCGCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 204885 AGCGCTTCGACCCCTCTGGCAAGGGCAAGGGCAAGGCTGGCCGCGTGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGTGGACGAGTCGGGCTATGTGTCCGGCTACAAGCACGCAGGCACCTA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204935 CTGGTGGACGAGTCAGGCTATGTGTCCGGCTACAAGCACGCAGGCACCTA

    650     .    :    .    :    .
    633 CGACCAGAAGGTGCAAGGGGGCAAG
        |||||||||||||||||||||||||
 204985 CGACCAGAAGGTGCAAGGGGGCAAG