seq1 = pF1KE3063.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KE3063/gi568815579r_11225401.tfa (gi568815579r:11225401_11437399), 211999 bp

>pF1KE3063 657
>gi568815579r:11225401_11437399 (Chr19)

(complement)

1-228  (100001-100228)   100% ->
229-347  (101617-101735)   100% ->
348-472  (101829-101953)   100% ->
473-657  (111815-111999)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCAGCTGGAGACACCCAGGCAGGCCCACGGGATGCAGCAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCAGCTGGAGACACCCAGGCAGGCCCACGGGATGCAGCAGATCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACTTCGACTATATGTTCAAACTGCTACTGATAGGCAACAGCAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACTTCGACTATATGTTCAAACTGCTACTGATAGGCAACAGCAGTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGACTTCCTTCCTGTTCCGATACGCGGACGACTCCTTCACTCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGACTTCCTTCCTGTTCCGATACGCGGACGACTCCTTCACTCCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGTCAGTACTGTGGGCATCGATTTCAAGGTCAAGACCGTCTACCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGTCAGTACTGTGGGCATCGATTTCAAGGTCAAGACCGTCTACCGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACAAGAGGATCAAGCTGCAGATCTGG         GACACAGCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100201 TGACAAGAGGATCAAGCTGCAGATCTGGGTA...CAGGACACAGCGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGCGCTACCGCACCATCACCACGGCCTACTACCGGGGAGCCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101630 AGGAGCGCTACCGCACCATCACCACGGCCTACTACCGGGGAGCCATGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCTGCTCATGTATGACATCGCCAATCAGGAATCCTTTGCCGCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101680 TTCCTGCTCATGTATGACATCGCCAATCAGGAATCCTTTGCCGCTGTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGACTG         GGCCACGCAAATCAAGACCTACTCCTGGGACAACG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101730 GGACTGGTG...CAGGGCCACGCAAATCAAGACCTACTCCTGGGACAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCAGGTCATCCTGGTGGGGAACAAGTGTGACCTGGAGGACGAACGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101864 CCCAGGTCATCCTGGTGGGGAACAAGTGTGACCTGGAGGACGAACGTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGCCTGCTGAGGATGGCCGGAGGCTCGCCGACGACCTTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101914 GTGCCTGCTGAGGATGGCCGGAGGCTCGCCGACGACCTTGGTT...CAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTTCGAGTTCTTTGAAGCCAGTGCCAAGGAGAACATCAATGTGAAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111816 TTTCGAGTTCTTTGAAGCCAGTGCCAAGGAGAACATCAATGTGAAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTTCGAGCGCCTGGTGGATGTCATCTGCGAGAAGATGAACGAGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111866 TCTTCGAGCGCCTGGTGGATGTCATCTGCGAGAAGATGAACGAGTCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAACCCAGCTCCAGCTCAGGCAGCAACGGGAAAGGCCCGGCCGTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111916 GAACCCAGCTCCAGCTCAGGCAGCAACGGGAAAGGCCCGGCCGTGGGGGA

    650     .    :    .    :    .    :
    624 TGCTCCAGCCCCCCAGCCCAGCAGCTGCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111966 TGCTCCAGCCCCCCAGCCCAGCAGCTGCAGCTGC