seq1 = pF1KE3057.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KE3057/gi568815596r_241576130.tfa (gi568815596r:241576130_241786783), 210654 bp

>pF1KE3057 636
>gi568815596r:241576130_241786783 (Chr2)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-239  (100907-101015)   100% ->
240-330  (106465-106555)   100% ->
331-528  (108135-108332)   99% ->
529-636  (110547-110654)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCCGGCGCGGGGCTCTCATAGTGCTGGAGGGCGTGGACCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCCGGCGCGGGGCTCTCATAGTGCTGGAGGGCGTGGACCGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGAAGAGCACGCAGAGCCGCAAGCTGGTGGAAGCGCTGTGCGCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGAAGAGCACGCAGAGCCGCAAGCTGGTGGAAGCGCTGTGCGCCGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACCGCGCCGAACTGCTCCGGTTCCCGG         AAAGATCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 GCCACCGCGCCGAACTGCTCCGGTTCCCGGGTG...TAGAAAGATCAACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAATCGGCAAACTTCTGAGTTCCTACTTGCAAAAGAAAAGTGACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100918 GAAATCGGCAAACTTCTGAGTTCCTACTTGCAAAAGAAAAGTGACGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATCACTCGGTGCACCTGCTTTTTTCTGCAAATCGCTGGGAACAAGT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100968 GGATCACTCGGTGCACCTGCTTTTTTCTGCAAATCGCTGGGAACAAGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        GCCGTTAATTAAGGAAAAGTTGAGCCAGGGCGTGACCCTCGTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101018 A...CAGGCCGTTAATTAAGGAAAAGTTGAGCCAGGGCGTGACCCTCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGACAGATACGCATTTTCTGGTGTGGCCTTCACCGGTGCCAAGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106508 GTGGACAGATACGCATTTTCTGGTGTGGCCTTCACCGGTGCCAAGGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331        AATTTTTCCCTAGACTGGTGTAAACAGCCAGACGTGGGCCTTC
        >...>>>|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 106558 G...CAGAATTTTTCCCTAGATTGGTGTAAACAGCCAGACGTGGGCCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAAACCCGACCTGGTCCTGTTCCTCCAGTTACAGCTGGCGGATGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108178 CCAAACCCGACCTGGTCCTGTTCCTCCAGTTACAGCTGGCGGATGCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCGGGGAGCGTTTGGCCATGAGCGCTATGAGAACGGGGCTTTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108228 AAGCGGGGAGCGTTTGGCCATGAGCGCTATGAGAACGGGGCTTTCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCGGGCGCTCCGGTGTTTCCACCAGCTCATGAAAGACACGACTTTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108278 GCGGGCGCTCCGGTGTTTCCACCAGCTCATGAAAGACACGACTTTGAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGAAG         ATGGTGGATGCTTCCAAAAGCATCGAAGCTGTCCAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108328 GGAAGGTG...CAGATGGTGGATGCTTCCAAAAGCATCGAAGCTGTCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGGACATCCGCGTGCTCTCTGAGGACGCCATCCGCACTGCCACAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110583 GAGGACATCCGCGTGCTCTCTGAGGACGCCATCCGCACTGCCACAGAGAA

    650     .    :    .    :
    615 GCCGCTGGGGGAGCTATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||
 110633 GCCGCTGGGGGAGCTATGGAAG