seq1 = pF1KE3049.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KE3049/gi568815589r_21139369.tfa (gi568815589r:21139369_21339935), 200567 bp

>pF1KE3049 567
>gi568815589r:21139369_21339935 (Chr9)

(complement)

1-567  (100001-100567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATTGCCCTTTGCTTTAATGATGGCCCTGGTGGTGCTCAGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATTGCCCTTTGCTTTAATGATGGCCCTGGTGGTGCTCAGCTGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCAAGCTGCTCTCTGGGCTGTAATCTGTCTCAAACCCACAGCCTGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCAAGCTGCTCTCTGGGCTGTAATCTGTCTCAAACCCACAGCCTGAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGGAGGACTTTGATGCTCATGGCACAAATGAGGAGAATCTCTCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGGAGGACTTTGATGCTCATGGCACAAATGAGGAGAATCTCTCCTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGACTTTGAATTTCCCCAGGAGGAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTGCCTGAAGGACAGACATGACTTTGAATTTCCCCAGGAGGAATTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCAACCAGTTCCAGAAAGCTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCAACCAGTTCCAGAAAGCTCAAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAAAGAACTCATCTGCTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGCAGACCTTCAATCTCTTCAGCACAAAGAACTCATCTGCTGCTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGAGACCCTCCTAGAAAAATTCTACATTGAACTTTTCCAGCAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGAGACCCTCCTAGAAAAATTCTACATTGAACTTTTCCAGCAAATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACCTGGAAGCCTGTGTGATACAGGAGGTTGGGGTGGAAGAGACTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGACCTGGAAGCCTGTGTGATACAGGAGGTTGGGGTGGAAGAGACTCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGAATGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAAGAAATACTTCCAAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGAATGAGGACTCCATCCTGGCTGTGAAGAAATACTTCCAAAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTCTTTATCTGATGGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTCTTTATCTGATGGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCCTCTCTTTTTCAACAAACTTGCAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGAGCAGAAATCATGAGATCCCTCTCTTTTTCAACAAACTTGCAAAAAA

    550     .    :    .
    551 GATTAAGGAGGAAGGAT
        |||||||||||||||||
 100551 GATTAAGGAGGAAGGAT