seq1 = pF1KE3036.tfa, 507 bp
seq2 = pF1KE3036/gi568815594f_74265309.tfa (gi568815594f:74265309_74484805), 219497 bp

>pF1KE3036 507
>gi568815594f:74265309_74484805 (Chr4)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-154  (114140-114226)   100% ->
155-278  (115706-115829)   100% ->
279-428  (117337-117486)   99% ->
429-507  (119419-119497)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGCGGGGAGGAGGATGGAGATGCTCTGTGCCGGCAGGGTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGCGGGGAGGAGGATGGAGATGCTCTGTGCCGGCAGGGTCCCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTCTGCCTGG         GTTTCCATCTTCTACAGGCAGTCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTCTGCCTGGGTA...TAGGTTTCCATCTTCTACAGGCAGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGTACAACTGTGATTCCATCATGTATCCCAGGAGAGTCCAGTGATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114164 TCAGTACAACTGTGATTCCATCATGTATCCCAGGAGAGTCCAGTGATAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCACAGCTTTAG         TTCAGACAGAAGACAATCCACGTGTGGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114214 TGCACAGCTTTAGGTA...CAGTTCAGACAGAAGACAATCCACGTGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCAAGTGTCAATAACAAAGTGTAGCTCTGACATGAATGGCTATTGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115734 TCAAGTGTCAATAACAAAGTGTAGCTCTGACATGAATGGCTATTGTTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGACAGTGCATCTATCTGGTGGACATGAGTCAAAACTACTGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 115784 ATGGACAGTGCATCTATCTGGTGGACATGAGTCAAAACTACTGCAGGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    279      GTGTGAAGTGGGTTATACTGGTGTCCGATGTGAACACTTCTTTTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115834 ..CAGGTGTGAAGTGGGTTATACTGGTGTCCGATGTGAACACTTCTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AACCGTCCACCAACCTTTAAGCAAAGAGTATGTGGCTTTGACCGTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 117382 AACCGTCCACCAACCTTTAAGCAAAGAATATGTGGCTTTGACCGTGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTATTATTTTGTTTCTTATCACAGTCGTCGGTTCCACATATTATTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117432 TTATTATTTTGTTTCTTATCACAGTCGTCGGTTCCACATATTATTTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGATG         GTACAGAAATCGAAAAAGTAAAGAACCAAAGAAGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117482 AGATGGTA...CAGGTACAGAAATCGAAAAAGTAAAGAACCAAAGAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATATGAGAGAGTTACCTCAGGGGATCCAGAGTTGCCGCAAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119455 ATATGAGAGAGTTACCTCAGGGGATCCAGAGTTGCCGCAAGTC