seq1 = pF1KE3035.tfa, 504 bp
seq2 = pF1KE3035/gi568815597r_240392972.tfa (gi568815597r:240392972_240593475), 200504 bp

>pF1KE3035 504
>gi568815597r:240392972_240593475 (Chr1)

(complement)

1-504  (100001-100504)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTGGAAGCTTTCCCTGTCCTTGTTCCTGGTGGCGGTGCTGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTGGAAGCTTTCCCTGTCCTTGTTCCTGGTGGCGGTGCTGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGCGGAAGCCCGGAAGAACCGGCCGGCGGGCGCCATCCCCTCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGCGGAAGCCCGGAAGAACCGGCCGGCGGGCGCCATCCCCTCGCCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGGACGGCAGCAGCAACAACTCGGAGAGATGGCAGCACCAGATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAAGGACGGCAGCAGCAACAACTCGGAGAGATGGCAGCACCAGATCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGTGCTGGCCTCCAGCCAGGAGGCCCTGGTGGTCACCGAGCGCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGTGCTGGCCTCCAGCCAGGAGGCCCTGGTGGTCACCGAGCGCAAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCAAGAGTGACTGGTGCAAGACGCAGCCGCTGCGGCAGACGGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCAAGAGTGACTGGTGCAAGACGCAGCCGCTGCGGCAGACGGTGAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGGGCTGCCGGAGCCGCACCATCCTCAACCGCTTCTGCTACGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGGGCTGCCGGAGCCGCACCATCCTCAACCGCTTCTGCTACGGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCAACTCCTTCTACATCCCGCGGCACGTGAAGAAGGAGGAGGAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCAACTCCTTCTACATCCCGCGGCACGTGAAGAAGGAGGAGGAGTCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGTCCTGCGCCTTCTGCAAGCCCCAGCGCGTCACCTCCGTCCTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGTCCTGCGCCTTCTGCAAGCCCCAGCGCGTCACCTCCGTCCTCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTCGAGTGCCCCGGCCTGGACCCACCCTTCCGACTCAAGAAAATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTCGAGTGCCCCGGCCTGGACCCACCCTTCCGACTCAAGAAAATCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGGTGAAGCAGTGCCGGTGCATGTCCGTGAACCTGAGCGACTCGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGGTGAAGCAGTGCCGGTGCATGTCCGTGAACCTGAGCGACTCGGACAA

    500 
    501 GCAG
        ||||
 100501 GCAG