seq1 = pF1KE3033.tfa, 453 bp
seq2 = pF1KE3033/gi568815590r_73705651.tfa (gi568815590r:73705651_73930474), 224824 bp

>pF1KE3033 453
>gi568815590r:73705651_73930474 (Chr8)

(complement)

7-107  (99993-100094)   96% ->
108-210  (105226-105328)   100% ->
211-366  (119846-120001)   100% ->
367-442  (124749-124824)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      7 TCAATGC AGAAACGACTACAGAAAGAACTGTTGGCTTTGCAAAATGACC
        ||  | |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 TCTTTTCTAGAAACGACTACAGAAAGAACTGTTGGCTTTGCAAAATGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 CACCTCCTGGAATGACCTTAAATGAGAAGAGTGTTCAAAATTCAATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 CACCTCCTGGAATGACCTTAAATGAGAAGAGTGTTCAAAATTCAATTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 CA         GTGGATTGTAGACATGGAAGGTGCACCAGGTACCTTATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100093 CAGTA...TAGGTGGATTGTAGACATGGAAGGTGCACCAGGTACCTTATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    147 TGAAGGGGAAAAATTTCAACTTCTATTTAAATTTAGTAGTCGATATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105265 TGAAGGGGAAAAATTTCAACTTCTATTTAAATTTAGTAGTCGATATCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    197 TTGACTCTCCTCAG         GTCATGTTTACTGGTGAAAATATTCCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105315 TTGACTCTCCTCAGGTA...TAGGTCATGTTTACTGGTGAAAATATTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238 GTTCATCCTCATGTTTATAGCAATGGTCATATCTGTTTATCCATTCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119873 GTTCATCCTCATGTTTATAGCAATGGTCATATCTGTTTATCCATTCTAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    288 AGAAGACTGGTCCCCAGCGCTCTCAGTCCAATCAGTTTGTCTTAGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119923 AGAAGACTGGTCCCCAGCGCTCTCAGTCCAATCAGTTTGTCTTAGCATTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338 TTAGCATGCTTTCCAGCTGCAAGGAAAAG         AGACGACCACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119973 TTAGCATGCTTTCCAGCTGCAAGGAAAAGGTA...CAGAGACGACCACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379 GATAATTCTTTTTATGTGCGAACATGTAACAAGAATCCAAAGAAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124761 GATAATTCTTTTTATGTGCGAACATGTAACAAGAATCCAAAGAAAACAAA

    450     .    :
    429 ATGGTGGTATCATG
        ||||||||||||||
 124811 ATGGTGGTATCATG