seq1 = pF1KE3031.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KE3031/gi568815584f_23277252.tfa (gi568815584f:23277252_23479384), 202133 bp

>pF1KE3031 468
>gi568815584f:23277252_23479384 (Chr14)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-279  (101098-101250)   100% ->
280-372  (101780-101872)   100% ->
373-466  (102048-102140)   95%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCAGTGCTCGAGATCGCCGGGACCGGCACCCTGAGGAGGGGGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCAGTGCTCGAGATCGCCGGGACCGGCACCCTGAGGAGGGGGTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAGAGCTCCAGGGCTTCGCGGTGGACAAGGCCTTCCTCACCTCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGAGCTCCAGGGCTTCGCGGTGGACAAGGCCTTCCTCACCTCCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCATCCTGCTGGAAACCGAGCTG         GCCCTGACCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 AGGGCATCCTGCTGGAAACCGAGCTGGTA...CAGGCCCTGACCCTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCTTCATCTGCTTCACGGCCTCCATCTCTGCCTACATGGCCGCGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101113 ATCTTCATCTGCTTCACGGCCTCCATCTCTGCCTACATGGCCGCGGCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTGGAGTTCTTCATCACACTTGCCTTCCTCTTCCTCTATGCCACCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101163 ACTGGAGTTCTTCATCACACTTGCCTTCCTCTTCCTCTATGCCACCCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTACCAGCGCTTCGACCGAATTAACTGGCCCTGTCTG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101213 ACTACCAGCGCTTCGACCGAATTAACTGGCCCTGTCTGGTG...CAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCCTGCGCTGTGTCAGTGCCATCATCATCTTCCTGGTGGTCTCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 TTCCTGCGCTGTGTCAGTGCCATCATCATCTTCCTGGTGGTCTCCTTTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCTGTGACCTCCCGGGACGGAGCTGCCATTGCTGCTTTT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101833 AGCTGTGACCTCCCGGGACGGAGCTGCCATTGCTGCTTTTGTG...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTTTTGGCATCATCCTGGTTTCCATCTTTGCCTATGATGCCTTCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102049 TTTTTGGCATCATCCTGGTTTCCATCTTTGCCTATGATGCCTTCAAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACCGGACTGAGATGGCACCCGGGGCCAGCCAGGGGGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  -||
 102099 TACCGGACTGAGATGGCACCCGGGGCCAGCCAGGGTGAGT GC