seq1 = pF1KE3015.tfa, 330 bp
seq2 = pF1KE3015/gi568815588f_72123915.tfa (gi568815588f:72123915_72333113), 209199 bp

>pF1KE3015 330
>gi568815588f:72123915_72333113 (Chr10)

1-142  (100001-100142)   100% ->
143-217  (106452-106526)   100% ->
218-330  (109087-109199)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTTCATCATCATCCTCCTCAGCTGGTGGGGTCAGTGGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTTCATCATCATCCTCCTCAGCTGGTGGGGTCAGTGGAAGTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCACTGGATCTGGTTTCAGTGTCTCAGACCTTGCCCCACCACGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCACTGGATCTGGTTTCAGTGTCTCAGACCTTGCCCCACCACGGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTTTTCACCTACCCCAAAGGAGCTGGAGAGATGTTAGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100101 CCCTTTTCACCTACCCCAAAGGAGCTGGAGAGATGTTAGAAGGTG...TA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143  ATGGCTCTGAGAGATTCCTCTGCGAATCTGTTTTTAGCTATCAAGTGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106451 GATGGCTCTGAGAGATTCCTCTGCGAATCTGTTTTTAGCTATCAAGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCCACGCTTAAACAGGTGAAACATG         ATCAGCAAGTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106501 ATCCACGCTTAAACAGGTGAAACATGGTA...CAGATCAGCAAGTTGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGATGGAAAAACTAGCTGGTTTGGTAGAAGAGCTGGAGGCTGACGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109102 GGATGGAAAAACTAGCTGGTTTGGTAGAAGAGCTGGAGGCTGACGAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    283 CGGTTTAAGCCCATCGAGCAGCTGCTGGGATTCACCCCCTCTTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109152 CGGTTTAAGCCCATCGAGCAGCTGCTGGGATTCACCCCCTCTTCAGGT