seq1 = pF1KE3012.tfa, 303 bp
seq2 = pF1KE3012/gi568815581f_41615437.tfa (gi568815581f:41615437_41815869), 200433 bp

>pF1KE3012 303
>gi568815581f:41615437_41815869 (Chr17)

1-211  (100001-100211)   100% ->
212-303  (100342-100433)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGACTGTGTGTGTATGTGCTGATCTTTGCACTGGCTCTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGACTGTGTGTGTATGTGCTGATCTTTGCACTGGCTCTGGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCTGAAGCTTCTTGGAAGCCCCGCTCCCAGCAGCCAGATGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTCTGAAGCTTCTTGGAAGCCCCGCTCCCAGCAGCCAGATGCACCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGGTACAGGGGCCAACAGGGACCTGGAGCTACCCTGGCTGGAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGGTACAGGGGCCAACAGGGACCTGGAGCTACCCTGGCTGGAGCAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCAGCCTCTCATCATCGAAGGCAGCTGGGACCCCAGGGTCCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCCAGCCTCTCATCATCGAAGGCAGCTGGGACCCCAGGGTCCCCCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCGTGGCAG         ACCCGTCCAAGAAGCAGGGACCATGGCTGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCGTGGCAGGTA...CAGACCCGTCCAAGAAGCAGGGACCATGGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAAGAAGAAGAAGCCTATGGATGGATGGACTTCGGCCGCCGCAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100372 AGGAAGAAGAAGAAGCCTATGGATGGATGGACTTCGGCCGCCGCAGTGCT

    300     .    :
    292 GAGGATGAGAAC
        ||||||||||||
 100422 GAGGATGAGAAC