seq1 = pF1KE3007.tfa, 261 bp
seq2 = pF1KE3007/gi568815596f_237466574.tfa (gi568815596f:237466574_237667172), 200599 bp

>pF1KE3007 261
>gi568815596f:237466574_237667172 (Chr2)

1-100  (100001-100100)   100% ->
101-261  (100439-100599)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTGCTGAGGGCCTGGCTCCTGTGCCTGCTGATGCTGGGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTGCTGAGGGCCTGGCTCCTGTGCCTGCTGATGCTGGGCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCGGGGAGCTGCAAGTCGTACCCATCGGCACTCCATGGAGATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCGGGGAGCTGCAAGTCGTACCCATCGGCACTCCATGGAGATCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          CCCCTGACATCAATCCTGCCTGGTACGCCAGTCGCGGGATC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTG...CAGCCCCTGACATCAATCCTGCCTGGTACGCCAGTCGCGGGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGCCTGTGGGCCGCTTCGGTCGGAGGAGGGCAACCCTGGGGGACGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100480 AGGCCTGTGGGCCGCTTCGGTCGGAGGAGGGCAACCCTGGGGGACGTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGCCTGGCCTGCGACCCCGGCTGACCTGCTTCCCCCTGGAAGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100530 CAAGCCTGGCCTGCGACCCCGGCTGACCTGCTTCCCCCTGGAAGGCGGTG

    250     .    :    .    :
    242 CTATGTCGTCCCAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||
 100580 CTATGTCGTCCCAGGATGGC