seq1 = pF1KE3004.tfa, 228 bp
seq2 = pF1KE3004/gi568815578f_44514557.tfa (gi568815578f:44514557_44718361), 203805 bp

>pF1KE3004 228
>gi568815578f:44514557_44718361 (Chr20)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-228  (103729-103805)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGAGGTCGAGTCCTCCTACTCGGACTTCATCTCCTGTGACCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGAGGTCGAGTCCTCCTACTCGGACTTCATCTCCTGTGACCGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCCGTCGGAATGCGGTCCCTGACATCCAGGGAGACTCAGAGGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCCGTCGGAATGCGGTCCCTGACATCCAGGGAGACTCAGAGGCTGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGAGGAAGCTGGCTGGAGACATGGGCGAGCTGGCACTCGAGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGAGGAAGCTGGCTGGAGACATGGGCGAGCTGGCACTCGAGGGGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         AAGGACAGGTGGAGGGAAGCGCCCCAGACAAGGAAGCTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTT...CAGAAGGACAGGTGGAGGGAAGCGCCCCAGACAAGGAAGCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .
    192 CAACCAGCCCCAGAGCAGCGATGGGACCACCTCGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103769 CAACCAGCCCCAGAGCAGCGATGGGACCACCTCGTCT