seq1 = pF1KE3002.tfa, 204 bp
seq2 = pF1KE3002/gi568815597r_84401848.tfa (gi568815597r:84401848_84606091), 204244 bp

>pF1KE3002 204
>gi568815597r:84401848_84606091 (Chr1)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-204  (104122-104244)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGCTCCTCCAGCGTCGCCGCTATGAAGAAAGTGGTTCAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGCTCCTCCAGCGTCGCCGCTATGAAGAAAGTGGTTCAACAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCTGGAGGCCGGACTCAACCGCGTAAAA         GTTTCCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 CCGGCTGGAGGCCGGACTCAACCGCGTAAAAGTG...TAGGTTTCCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGCTGCAGACTTGAAACAGTTCTGTCTGCAGAATGCTCAACATGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104132 CAGCTGCAGACTTGAAACAGTTCTGTCTGCAGAATGCTCAACATGACCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCTGACTGGAGTATCTTCAAGTACAAATCCCTTCAGACCCCAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104182 CTGCTGACTGGAGTATCTTCAAGTACAAATCCCTTCAGACCCCAGAAAGT

    200     .    :
    192 CTGTTCCTTTTTG
        |||||||||||||
 104232 CTGTTCCTTTTTG