seq1 = pF1KE2797.tfa, 2373 bp
seq2 = pF1KE2797/gi568815581r_3413920.tfa (gi568815581r:3413920_3654850), 240931 bp

>pF1KE2797 2373
>gi568815581r:3413920_3654850 (Chr17)

(complement)

1-119  (100001-100119)   99% ->
120-224  (109580-109684)   100% ->
225-311  (110186-110272)   98% ->
312-466  (111223-111377)   99% ->
467-643  (112153-112329)   98% ->
644-784  (119138-119278)   100% ->
785-1065  (121914-122194)   100% ->
1066-1242  (124648-124824)   100% ->
1243-1401  (125856-126014)   100% ->
1402-1503  (126725-126826)   100% ->
1504-1577  (127924-127997)   100% ->
1578-1743  (130488-130653)   100% ->
1744-1810  (133812-133878)   100% ->
1811-2085  (136001-136275)   99% ->
2086-2198  (138282-138394)   100% ->
2199-2278  (140179-140258)   100% ->
2279-2373  (140837-140931)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGCCCACCCCAAGGAGATGGTGCCTCTCATGGGCAAGAGAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGCCCACCCCAAGGAGATGGTGCCTCTCATGGGCAAGAGAGTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCCCCAGTGGGAACCCTGCCGTCCTGCCAGAGAAGAGGCCGGCGGAGA
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCCCCAGTGGGAACCCTGCCATCCTGCCAGAGAAGAGGCCGGCGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCCCACAAAGAAGAG         TGCACACTTCTTCCTGGAGATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCCCCACAAAGAAGAGGTG...CAGTGCACACTTCTTCCTGGAGATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGGGTTTGAACCCAACCCCACAGTTGCCAAGACCTCTCCTCCTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109602 GAAGGGTTTGAACCCAACCCCACAGTTGCCAAGACCTCTCCTCCTGTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCAAGCCCATGGATTCCAACATCCGGCAGTG         CATCTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109652 CTCCAAGCCCATGGATTCCAACATCCGGCAGTGGTG...CAGCATCTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTAACTGTGATGACATGGACTCCCCCCAGTCTCCTCAAGATGATGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 110194 GTAACTGTGATGACATGGACTCCCCCCAGTCTCCTCAGGATGATGTGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGACCCCATCCAATCCCAACAGCCCCAG         TGCACAGCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110244 GAGACCCCATCCAATCCCAACAGCCCCAGGTA...CAGTGCACAGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGGAAGAGCAGAGGAGGAAAAAGGGGCGGCTGAAGAAGCGCATCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 111235 CAAGGAAGAGCAGAGGAGGAAAAAGAGGCGGCTGAAGAAGCGCATCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGCCGTGTCTGAGGGCTGCGTGGAGGAGTTGGTAGAGTTGCTGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111285 CAGCCGTGTCTGAGGGCTGCGTGGAGGAGTTGGTAGAGTTGCTGGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGCAGGAGCTTTGCAGGCGGCGCCATGATGAGGATGTGCCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111335 CTGCAGGAGCTTTGCAGGCGGCGCCATGATGAGGATGTGCCTGGTG...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    467   ACTTCCTCATGCACAAGCTGACGGCCTCCGACACGGGGAAGACCTGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112151 AGACTTCCTCATGCACAAGCTGACGGCCTCCGACACGGGGAAGACCTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATGAAGGCCTTGTTAAACATCAACCCCAACACCAAGGAGATCGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 112201 TGATGAAGGCCTTGTTAAACATCAACCCCAACACCAAGGAGATAGTGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCCTGCTTGCCTTTGCTGAAGAGAACAACATCCTGGGCAGGTTCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 112251 ATCCTGCTTGCCTTTGCTGAAGAGAACGACATCCTGGGCAGGTTCATCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGCCGAGTACACAGAGGAGGCCTATGAAG         GGCAGACGGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 112301 CGCCGAGTACACAGAGGAGGCCTATGAAGGTA...CAGGGCAGACGGCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGAACATCGCCATCGAGCGGCGGCAGGGGGACATCGCAGCCCTGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119150 TGAACATCGCCATCGAGCGGCGGCAGGGGGACATCGCAGCCCTGCTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCGCCGGCGCCGACGTCAACGCGCACGCCAAGGGGGCCTTCTTCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119200 GCCGCCGGCGCCGACGTCAACGCGCACGCCAAGGGGGCCTTCTTCAACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAGTACCAACACGAAGGCTTCTACTTCG         GTGAGACGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119250 CAAGTACCAACACGAAGGCTTCTACTTCGGTG...CAGGTGAGACGCCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGCCCTGGCAGCATGCACCAACCAGCCCGAGATTGTGCAGCTGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121926 TGGCCCTGGCAGCATGCACCAACCAGCCCGAGATTGTGCAGCTGCTGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGCACGAGCAGACGGACATCACCTCGCGGGACTCACGAGGCAACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121976 GAGCACGAGCAGACGGACATCACCTCGCGGGACTCACGAGGCAACAACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCTTCACGCCCTGGTGACCGTGGCCGAGGACTTCAAGACGCAGAATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122026 CCTTCACGCCCTGGTGACCGTGGCCGAGGACTTCAAGACGCAGAATGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGTGAAGCGCATGTACGACATGATCCTACTGCGGAGTGGCAACTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122076 TTGTGAAGCGCATGTACGACATGATCCTACTGCGGAGTGGCAACTGGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGGAGACCACTCGCAACAACGATGGCCTCACGCCGCTGCAGCTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122126 CTGGAGACCACTCGCAACAACGATGGCCTCACGCCGCTGCAGCTGGCCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAGATGGGCAAGGCGGAG         ATCCTGAAGTACATCCTCAGTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 122176 CAAGATGGGCAAGGCGGAGGTG...CAGATCCTGAAGTACATCCTCAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GTGAGATCAAGGAGAAGCGGCTCCGGAGCCTGTCCAGGAAGTTCACCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124670 GTGAGATCAAGGAGAAGCGGCTCCGGAGCCTGTCCAGGAAGTTCACCGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TGGGCGTACGGACCCGTGTCATCCTCCCTCTACGACCTCACCAACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124720 TGGGCGTACGGACCCGTGTCATCCTCCCTCTACGACCTCACCAACGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CACCACCACGGACAACTCAGTGCTGGAAATCACTGTCTACAACACCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124770 CACCACCACGGACAACTCAGTGCTGGAAATCACTGTCTACAACACCAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCGAC         AACCGGCATGAGATGCTGACCCTGGAGCCGCTGCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124820 TCGACGTG...TAGAACCGGCATGAGATGCTGACCCTGGAGCCGCTGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACGCTGCTGCATATGAAGTGGAAGAAGTTTGCCAAGCACATGTTCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125892 ACGCTGCTGCATATGAAGTGGAAGAAGTTTGCCAAGCACATGTTCTTTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GTCCTTCTGCTTTTATTTCTTCTACAACATCACCCTGACCCTCGTCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125942 GTCCTTCTGCTTTTATTTCTTCTACAACATCACCCTGACCCTCGTCTCGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACTACCGCCCCCGGGAGGAGGAG         GCCATCCCGCACCCCTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 125992 ACTACCGCCCCCGGGAGGAGGAGGTA...CAGGCCATCCCGCACCCCTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCCCTGACGCACAAGATGGGGTGGCTGCAGCTCCTAGGGAGGATGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126743 GCCCTGACGCACAAGATGGGGTGGCTGCAGCTCCTAGGGAGGATGTTTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCTCATCTGGGCCATGTGCATCTCTGTGAAAGAG         GGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 126793 GCTCATCTGGGCCATGTGCATCTCTGTGAAAGAGGTA...TAGGGCATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CCATCTTCCTGCTGAGACCCTCGGATCTGCAGTCCATCCTCTCGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127931 CCATCTTCCTGCTGAGACCCTCGGATCTGCAGTCCATCCTCTCGGATGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TGGTTCCACTTTGTCTT         TTTTATCCAAGCTGTGCTTGTGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127981 TGGTTCCACTTTGTCTTGTA...CAGTTTTATCCAAGCTGTGCTTGTGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACTGTCTGTCTTCTTGTACTTGTTTGCCTACAAAGAGTACCTCGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130512 ACTGTCTGTCTTCTTGTACTTGTTTGCCTACAAAGAGTACCTCGCCTGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TCGTGCTGGCCATGGCCCTGGGCTGGGCGAACATGCTCTACTATACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130562 TCGTGCTGGCCATGGCCCTGGGCTGGGCGAACATGCTCTACTATACGCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GGTTTCCAGTCCATGGGCATGTACAGCGTCATGATCCAGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 130612 GGTTTCCAGTCCATGGGCATGTACAGCGTCATGATCCAGAAGGTG...TA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1744  GTCATTTTGCATGATGTTCTGAAGTTCTTGTTTGTATATATCGTGTTTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133811 GGTCATTTTGCATGATGTTCTGAAGTTCTTGTTTGTATATATCGTGTTTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TGCTTGGATTTGGAGTAG         CCTTGGCCTCGCTGATCGAGAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 133861 TGCTTGGATTTGGAGTAGGTA...TAGCCTTGGCCTCGCTGATCGAGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TGTCCCAAAGACAACAAGGACTGCAGCTCCTACGGCAGCTTCAGCGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136024 TGTCCCAAAGACAACAAGGACTGCAGCTCCTACGGCAGCTTCAGCGACGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AGTGCTGGAACTCTTCAAGCTCACCATAGGCCTGGGTGATCTGAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 136074 AGTGCTGGAACTCTTCAAGCTCACCATAGGCCTGGGTGACCTGAACATCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGCAGAACTCCAAGTATCCCATTCTCTTTCTGTTCCTGCTCATCACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136124 AGCAGAACTCCAAGTATCCCATTCTCTTTCTGTTCCTGCTCATCACCTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GTCATCCTCACCTTTGTTCTCCTCCTCAACATGCTCATTGCTCTGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136174 GTCATCCTCACCTTTGTTCTCCTCCTCAACATGCTCATTGCTCTGATGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CGAGACTGTGGAGAACGTCTCCAAGGAGAGCGAACGCATCTGGCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136224 CGAGACTGTGGAGAACGTCTCCAAGGAGAGCGAACGCATCTGGCGCCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AG         AGAGCCAGGACCATCTTGGAGTTTGAGAAAATGTTACCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136274 AGGTG...CAGAGAGCCAGGACCATCTTGGAGTTTGAGAAAATGTTACCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GAATGGCTGAGGAGCAGATTCCGGATGGGAGAGCTGTGCAAAGTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138321 GAATGGCTGAGGAGCAGATTCCGGATGGGAGAGCTGTGCAAAGTGGCCGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGATGATTTCCGACTGTGTTTGCG         GATCAATGAGGTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 138371 GGATGATTTCCGACTGTGTTTGCGGTA...CAGGATCAATGAGGTGAAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GGACTGAATGGAAGACGCACGTCTCCTTCCTTAACGAAGACCCGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140196 GGACTGAATGGAAGACGCACGTCTCCTTCCTTAACGAAGACCCGGGGCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GTAAGACGAACAG         CAGATTTCAACAAAATCCAAGATTCTTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 140246 GTAAGACGAACAGGTA...AAGCAGATTTCAACAAAATCCAAGATTCTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CAGGAACAACAGCAAAACCACTCTCAATGCATTTGAAGAAGTCGAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140865 CAGGAACAACAGCAAAACCACTCTCAATGCATTTGAAGAAGTCGAGGAAT

   2500     .    :    .
   2357 TCCCGGAAACCTCGGTG
        |||||||||||||||||
 140915 TCCCGGAAACCTCGGTG