seq1 = pF1KE2792.tfa, 630 bp
seq2 = pF1KE2792/gi568815595r_51869429.tfa (gi568815595r:51869429_52071670), 202242 bp

>pF1KE2792 630
>gi568815595r:51869429_52071670 (Chr3)

(complement)

1-211  (100001-100211)   100% ->
212-453  (101487-101728)   100% ->
454-630  (102066-102242)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCAAGCGTGGAGCAGCGCGAGGGCACCATCCAGGTGCAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCAAGCGTGGAGCAGCGCGAGGGCACCATCCAGGTGCAGGGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTCTTCTTCCGAGAGGCCCTGCCCGGCAGTGGGCAGGCTCGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTCTTCTTCCGAGAGGCCCTGCCCGGCAGTGGGCAGGCTCGCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTACTGCTGCTGCATGGTATTCGCTTCTCCTCCGAGACCTGGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTACTGCTGCTGCATGGTATTCGCTTCTCCTCCGAGACCTGGCAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGTACACTGCACAGGCTGGCCCAGGCTGGCTACCGGGCTGTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGTACACTGCACAGGCTGGCCCAGGCTGGCTACCGGGCTGTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACCTGCCAG         GTCTGGGGCACTCCAAGGAAGCAGCAGCCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGACCTGCCAGGTA...CAGGTCTGGGGCACTCCAAGGAAGCAGCAGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGCCCCTATTGGGGAGCTGGCCCCTGGCAGCTTCCTGGCGGCTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101517 CTGCCCCTATTGGGGAGCTGGCCCCTGGCAGCTTCCTGGCGGCTGTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGCCTTGGAGCTGGGCCCCCCGGTTGTGATCAGTCCATCACTGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101567 GATGCCTTGGAGCTGGGCCCCCCGGTTGTGATCAGTCCATCACTGAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGTACTCCCTGCCCTTCCTCACGGCCCCTGGCTCCCAGCTCCCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101617 CATGTACTCCCTGCCCTTCCTCACGGCCCCTGGCTCCCAGCTCCCGGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTGTGCCAGTGGCCCCCATCTGCACTGACAAAATCAATGCTGCCAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101667 TTGTGCCAGTGGCCCCCATCTGCACTGACAAAATCAATGCTGCCAACTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCAGTGTGAAG         ACTCCAGCTCTGATTGTATATGGAGACCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101717 GCCAGTGTGAAGGTA...CAGACTCCAGCTCTGATTGTATATGGAGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACCCCATGGGTCAGACCAGCTTTGAGCACCTGAAGCAGCTGCCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102095 GGACCCCATGGGTCAGACCAGCTTTGAGCACCTGAAGCAGCTGCCCAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCGGGTGCTGATCATGAAGGGGGCGGGGCACCCCTGTTACCTGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102145 ACCGGGTGCTGATCATGAAGGGGGCGGGGCACCCCTGTTACCTGGACAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    583 CCAGAGGAGTGGCATACAGGGCTGCTGGACTTCCTGCAGGGGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102195 CCAGAGGAGTGGCATACAGGGCTGCTGGACTTCCTGCAGGGGCTCCAG