seq1 = pF1KE2790.tfa, 522 bp
seq2 = pF1KE2790/gi568815584f_75337895.tfa (gi568815584f:75337895_75569472), 231578 bp

>pF1KE2790 522
>gi568815584f:75337895_75569472 (Chr14)

8-234  (100001-100227)   100% ->
235-339  (123532-123636)   100% ->
340-522  (131396-131578)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 CAGGCTGGCCTGCCACTCCTCCTGCTATGATGCCTGGGCAGATCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGCTGGCCTGCCACTCCTCCTGCTATGATGCCTGGGCAGATCCCGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 CCTTCGGTGACCACAGGCTCCCTGCCAGGGCTTGGCCCCCTGACCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCGGTGACCACAGGCTCCCTGCCAGGGCTTGGCCCCCTGACCGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 CCCCAGCTCGGCCCTGACTGTGGAGGAGCTGAAATACGCTGACATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCAGCTCGGCCCTGACTGTGGAGGAGCTGAAATACGCTGACATCCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 ACCTCGGGGCCATGATTGCACCCTTGCACTTCCTGGAGGTGAAACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCTCGGGGCCATGATTGCACCCTTGCACTTCCTGGAGGTGAAACTGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    208 AAGAGGCCCCAGCCCGTGAAAAGTGAG         CTAGATGAGGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100201 AAGAGGCCCCAGCCCGTGAAAAGTGAGGTG...CAGCTAGATGAGGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 GGAGCGAAGGAAAAGGCGCCGGGAGAAGAACAAAGTCGCAGCAGCCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123546 GGAGCGAAGGAAAAGGCGCCGGGAGAAGAACAAAGTCGCAGCAGCCCGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 GCCGGAACAAGAAGAAGGAGCGCACGGAGTTTCTGCAGCGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123596 GCCGGAACAAGAAGAAGGAGCGCACGGAGTTTCTGCAGCGGGTG...CAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340 GAATCCGAGCGGCTGGAACTCATGAACGCAGAGCTGAAGACCCAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131396 GAATCCGAGCGGCTGGAACTCATGAACGCAGAGCTGAAGACCCAGATTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 GGAGCTGAAGCAGGAGCGGCAGCAGCTCATCCTGATGCTGAACCGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131446 GGAGCTGAAGCAGGAGCGGCAGCAGCTCATCCTGATGCTGAACCGACACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    440 GCCCCACCTGCATCGTCCGGACCGACAGTGTCAAGACCCCCGAGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131496 GCCCCACCTGCATCGTCCGGACCGACAGTGTCAAGACCCCCGAGTCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :
    490 GGCAACCCACTGCTCGAGCAGCTCGAGAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 131546 GGCAACCCACTGCTCGAGCAGCTCGAGAAGAAG