seq1 = pF1KE2788.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KE2788/gi568815575r_30459453.tfa (gi568815575r:30459453_30660355), 200903 bp

>pF1KE2788 903
>gi568815575r:30459453_30660355 (ChrX)

(complement)

1-903  (100001-100903)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGTCAGAAGGGTATCTCAGTGGACTTGAGTACTGGAATGACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGTCAGAAGGGTATCTCAGTGGACTTGAGTACTGGAATGACATCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGAGTTGTGCCTCTTATAATGAGCAGGTGGCTGGGGAAAAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGAGTTGTGCCTCTTATAATGAGCAGGTGGCTGGGGAAAAGGAAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACAAATTCTGTTGCTACCCTTTCCTATTCCTCTGTGGATGAAACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACAAATTCTGTTGCTACCCTTTCCTATTCCTCTGTGGATGAAACACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGAAGTCTCTACGTGAGCTGCAAATCATCTGGCAAGTTTATCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGAAGTCTCTACGTGAGCTGCAAATCATCTGGCAAGTTTATCTCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTGCATTCAAGAGAGAGCCAACATAGCAGAAGTCAGAGAGTCACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTGCATTCAAGAGAGAGCCAACATAGCAGAAGTCAGAGAGTCACAGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGACAAACCCCAATCCTGTGTTTGAAAGCCCAAACTTGGCTGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGACAAACCCCAATCCTGTGTTTGAAAGCCCAAACTTGGCTGCAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAATATGTAGAGATGCCAGCAGAGAGACCTACTTGGTTCCATCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAATATGTAGAGATGCCAGCAGAGAGACCTACTTGGTTCCATCTTCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAAAGTATTTGCAAGAATTATAATGACTTACAGATTGCAGGGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAAAGTATTTGCAAGAATTATAATGACTTACAGATTGCAGGGGGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGGCCATTAATTCAGTGACAACAGATTTTCCCTCTGAGAGCAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGGCCATTAATTCAGTGACAACAGATTTTCCCTCTGAGAGCAGTTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAATATGGCCCTTTGCTGAAGTCATCTGAGATTCCTTTACCCATGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAATATGGCCCTTTGCTGAAGTCATCTGAGATTCCTTTACCCATGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCCATTTCTACTCAGCCCAGTGACTTTCCCCAAAAACCTATCCAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCCATTTCTACTCAGCCCAGTGACTTTCCCCAAAAACCTATCCAGCGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTCATCCTATTGGAGAATAACAAGCATCAAAGAGAAAAGCAGCTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTCATCCTATTGGAGAATAACAAGCATCAAAGAGAAAAGCAGCTTGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGCAGAATCCTATTTCTAATGCAGTGCTGAATGAGTACCTGGAGCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100601 ATGCAGAATCCTATTTCTAATGCAGTTCTGAATGAGTACCTGGAGCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTTGTGGAGTTATATAAACAGTACATTATGGACACCGTGTTTCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTTGTGGAGTTATATAAACAGTACATTATGGACACCGTGTTTCATGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTTCTCCTACCCAGATTCTGGCGTCTGAACTCATCATGACAAGTGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTTCTCCTACCCAGATTCTGGCGTCTGAACTCATCATGACAAGTGTAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAAATCAGTCTTCAAGTGTCTAGAGAGAAGAATCTGGAGACCTCAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAAATCAGTCTTCAAGTGTCTAGAGAGAAGAATCTGGAGACCTCAAAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGAGATATAGTCTTTAGCCGCCTATTGCAATTGATGTCAACTGAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGAGATATAGTCTTTAGCCGCCTATTGCAATTGATGTCAACTGAAATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGAAATTAGCACTCCTAGTCTCCATATTTCTCAGTATAGCAATGTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGAAATTAGCACTCCTAGTCTCCATATTTCTCAGTATAGCAATGTAAAT

    900 
    901 CCA
        |||
 100901 CCA