seq1 = pF1KE2783.tfa, 780 bp
seq2 = pF1KE2783/gi568815581f_36492010.tfa (gi568815581f:36492010_36700200), 208191 bp

>pF1KE2783 780
>gi568815581f:36492010_36700200 (Chr17)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-357  (102962-103171)   100% ->
358-452  (106154-106248)   100% ->
453-582  (106912-107041)   100% ->
583-675  (107662-107754)   100% ->
676-741  (107963-108028)   100% ->
742-780  (108153-108191)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGGCCCGGCATGGAGCGGTGGCGCGACCGGCTGGCGCTGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGGCCCGGCATGGAGCGGTGGCGCGACCGGCTGGCGCTGGTGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGGCCTCGGGGGGCATCGGCGCGGCCGTGGCCCGGGCCCTGGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGGCCTCGGGGGGCATCGGCGCGGCCGTGGCCCGGGCCCTGGTCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGACTGAAGGTGGTGGGCTGCGCCCGCACTGTGGGCAACATCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 AGGGACTGAAGGTGGTGGGCTGCGCCCGCACTGTGGGCAACATCGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       GAGCTGGCTGCTGAATGTAAGAGTGCAGGCTACCCCGGGACTTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...TAGGAGCTGGCTGCTGAATGTAAGAGTGCAGGCTACCCCGGGACTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCCCCTACAGATGTGACCTATCAAATGAAGAGGACATCCTCTCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103006 GATCCCCTACAGATGTGACCTATCAAATGAAGAGGACATCCTCTCCATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCAGCTATCCGTTCTCAGCACAGCGGTGTAGACATCTGCATCAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103056 TCTCAGCTATCCGTTCTCAGCACAGCGGTGTAGACATCTGCATCAACAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGCTTGGCCCGGCCTGACACCCTGCTCTCAGGCAGCACCAGTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103106 GCTGGCTTGGCCCGGCCTGACACCCTGCTCTCAGGCAGCACCAGTGGTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGGACATGTTCAAT         GTGAACGTGCTGGCCCTCAGCATCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103156 GAAGGACATGTTCAATGTA...CAGGTGAACGTGCTGGCCCTCAGCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCACACGGGAAGCCTACCAGTCCATGAAGGAGCGGAATGTGGACGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106179 GCACACGGGAAGCCTACCAGTCCATGAAGGAGCGGAATGTGGACGATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACATCATTAACATCAATAG         CATGTCTGGCCACCGAGTGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106229 CACATCATTAACATCAATAGGTG...CAGCATGTCTGGCCACCGAGTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACCCCTGTCTGTGACCCACTTCTATAGTGCCACCAAGTATGCCGTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106933 ACCCCTGTCTGTGACCCACTTCTATAGTGCCACCAAGTATGCCGTCACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCTGACAGAGGGACTGAGGCAAGAGCTTCGGGAGGCCCAGACCCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106983 CGCTGACAGAGGGACTGAGGCAAGAGCTTCGGGAGGCCCAGACCCACATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGAGCCACG         TGCATCTCTCCAGGTGTGGTGGAGACACAATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107033 CGAGCCACGGTG...CAGTGCATCTCTCCAGGTGTGGTGGAGACACAATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGCCTTCAAACTCCACGACAAGGACCCTGAGAAGGCAGCTGCCACCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107694 CGCCTTCAAACTCCACGACAAGGACCCTGAGAAGGCAGCTGCCACCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCAAATGAAG         TGTCTCAAACCCGAGGATGTGGCCGAGGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 107744 AGCAAATGAAGGTG...CAGTGTCTCAAACCCGAGGATGTGGCCGAGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTATCTACGTCCTCAGCACCCCCGCACACATCCAG         ATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107993 GTTATCTACGTCCTCAGCACCCCCGCACACATCCAGGTG...CAGATTGG

    800     .    :    .    :    .    :
    747 AGACATCCAGATGAGGCCCACGGAGCAGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108158 AGACATCCAGATGAGGCCCACGGAGCAGGTGACC