seq1 = pF1KE2769.tfa, 1413 bp
seq2 = pF1KE2769/gi568815581r_76526003.tfa (gi568815581r:76526003_76743638), 217636 bp

>pF1KE2769 1413
>gi568815581r:76526003_76743638 (Chr17)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-831  (113928-114627)   99% ->
832-1000  (116056-116224)   100% ->
1001-1172  (116401-116572)   99% ->
1173-1311  (116850-116988)   100% ->
1312-1410  (117544-117640)   96%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTCCTGCCTGTGGAGATGCAGGCACCTGAGCCAAGGCGTCCAGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGTCTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCCTTGCTTCTGGCTGTCCTGGTCTTCTTTCTCTTCGCCTTGCCCTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAG         GCATCAACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 TTATTAAGGAGCCTCAAACAAAGCCTTCCAGGTA...TAGGCATCAACGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAGAGAACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113938 ACAGAGAACATTAAAGAAAGGTCTCTACAGTCCCTGGCAAAGCCTAAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACCATCTATGCAGAGCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113988 CCAGGCACCCACAAGGGCAAGGAGGACAACCATCTATGCAGAGCCAGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114038 CAGAGAACAATGCCCTCAACACACAAACCCAGCCCAAGGCCCACACCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAGACAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114088 GGAGACAGAGGAAAGGAGGCCAACCAGGCACCGCCGGAGGAGCAGGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCATGGAAGAGCCCAGAAAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 GGTGCCCCACACAGCACAGAGGGCAGCATGGAAGAGCCCAGAAAAAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114188 AAACCATGGTGAACACACTGTCACCCAGAGGGCAAGATGCAGGGATGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCTGGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114238 TCTGGCAGGACAGAGGCACAATCATGGAAGAGCCAGGACACAAAGACGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAAGCTGACGGCCTCCAGGACGGTGT
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114288 CCAAGGAAATGGGGGCCAGACCAGGAAGCTGACGGCCTCCAGGACGGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114338 CAGAGAAGCACCAGGGCAAAGCGGCAACCACAGCCAAGACGCTCATTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114388 AAAAGTCAGCACAGAATGCTGGCTCCCACAGGAGCAGTGTCAACAAGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCAGTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114438 GAGACAGAAAGGAGTGACCACAGCAGTCATCCCACCTAAGGAGAAGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114488 CTCAGGCCACCCCACCCCCTGCCCCTTTCCAGAGCCCCACGACGCAGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114538 AACCAAAGACTGAAGGCCGCCAACTTCAAATCTGAGCCTCGGTGGGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGAGGAAAAATACAGCTTCGAAATAGGAGGCCTTCAGACG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 114588 TGAGGAAAAATACAGCTTCGAAATAGGAGGCCTTCAGACGGTG...TAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116057 CTTGCCCTGACTCTGTGAAGATCAAAGCCTCCAAGTCGCTGTGGCTCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAACTCTTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116107 AAACTCTTTCTGCCCAACCTCACTCTCTTCCTGGACTCCAGACACTTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTTTGCACCACCCTTTGGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116157 CCAGAGTGAGTGGGACCGCCTGGAACACTTTGCACCACCCTTTGGCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGGAGCTCAACTACTCCT         TGGTGCAGAAGGTCGTGACACGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 116207 TGGAGCTCAACTACTCCTGTG...CAGTGGTGCAGAAGGTCGTGACACGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTCCCTCCAGTGCCCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116424 TTCCCTCCAGTGCCCCAGCAGCAGCTGCTCCTGGCCAGCCTCCCCGCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAACGGGGGCATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116474 GAGCCTCCGGTGCATCACCTGTGCCGTGGTGGGCAACGGGGGCATCCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACAACTCCCACATAGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCG 
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116524 ACAACTCCCACATGGGCCAGGAGATAGACAGTCACGACTACGTGTTCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1173         ATTGAGCGGAGCTCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116574 TA...CAGATTGAGCGGAGCTCTCATTAAAGGCTACGAACAGGATGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCCAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116892 GACTCGGACATCCTTCTACGGCTTTACCGCCTTCTCCCTGACCCAGTCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116942 TCCTTATATTGGGCAATCGGGGTTTCAAGAACGTGCCTCTTGGGAAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1312       GCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116992 ...CAGGCACAGACCCCAGGAAGCTTTTCGGGAAGCCCTGCACATGGACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGTACCTGTTGCTGCACCCAGACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 117588 GGTACCTGTTGCTGCACCCAGACTTTCTCCGATACATGAAGAACAGGTTA

   1450     .
   1406 CTGAG
        --|||
 117638   GAG