seq1 = pF1KE2764.tfa, 1572 bp
seq2 = pF1KE2764/gi568815588r_71718616.tfa (gi568815588r:71718616_71951221), 232606 bp

>pF1KE2764 1572
>gi568815588r:71718616_71951221 (Chr10)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-174  (116717-116850)   100% ->
175-249  (119302-119376)   100% ->
250-375  (119971-120096)   100% ->
376-576  (122145-122345)   100% ->
577-720  (123065-123208)   100% ->
721-777  (125329-125385)   100% ->
778-909  (129215-129346)   100% ->
910-1005  (130887-130982)   100% ->
1006-1192  (131322-131508)   100% ->
1193-1350  (131600-131757)   100% ->
1351-1431  (132111-132191)   100% ->
1432-1539  (132498-132605)   100% ->
1540-1572  (133746-133778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGCCCTCTTCCTCCTGGCCAGCCTCCTGGGCGCGG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGTACGCCCTCTTCCTCCTGGCCAGCCTCCTGGGCGCGGGTA...TAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCTAGCCGGCCCGGTCCTTGGACTGAAAGAATGCACCAGGGGCTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116718 TCTAGCCGGCCCGGTCCTTGGACTGAAAGAATGCACCAGGGGCTCGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTGGTGCCAGAATGTGAAGACGGCGTCCGACTGCGGGGCAGTGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116768 TGTGGTGCCAGAATGTGAAGACGGCGTCCGACTGCGGGGCAGTGAAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCCTGCAGACCGTTTGGAACAAGCCAACAGTG         AAATCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116818 TGCCTGCAGACCGTTTGGAACAAGCCAACAGTGGTG...TAGAAATCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCCTGCGACATATGCAAAGACGTTGTCACCGCAGCTGGTGATATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119310 TCCCTGCGACATATGCAAAGACGTTGTCACCGCAGCTGGTGATATGCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGACAATGCCACTGAG         GAGGAGATCCTTGTTTACTTGGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 119360 AGGACAATGCCACTGAGGTG...TAGGAGGAGATCCTTGTTTACTTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGACCTGTGACTGGCTTCCGAAACCGAACATGTCTGCTTCATGCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119995 AAGACCTGTGACTGGCTTCCGAAACCGAACATGTCTGCTTCATGCAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATAGTGGACTCCTACCTCCCTGTCATCCTGGACATCATTAAAGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120045 GATAGTGGACTCCTACCTCCCTGTCATCCTGGACATCATTAAAGGAGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TG         AGCCGTCCTGGGGAGGTGTGCTCTGCTCTCAACCTCTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120095 TGGTA...CAGAGCCGTCCTGGGGAGGTGTGCTCTGCTCTCAACCTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGTCTCTCCAGAAGCACCTAGCAGAGCTGAATCACCAGAAGCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122184 GAGTCTCTCCAGAAGCACCTAGCAGAGCTGAATCACCAGAAGCAGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTCCAATAAGATCCCAGAGCTGGACATGACTGAGGTGGTGGCCCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122234 GTCCAATAAGATCCCAGAGCTGGACATGACTGAGGTGGTGGCCCCCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCCAACATCCCTCTCCTCCTCTACCCTCAGGACGGCCCCCGCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122284 TGGCCAACATCCCTCTCCTCCTCTACCCTCAGGACGGCCCCCGCAGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCCCAGCCAAAG         GATAATGGGGACGTTTGCCAGGACTGCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122334 CCCCAGCCAAAGGTA...TAGGATAATGGGGACGTTTGCCAGGACTGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGATGGTGACTGACATCCAGACTGCTGTACGGACCAACTCCACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123094 TCAGATGGTGACTGACATCCAGACTGCTGTACGGACCAACTCCACCTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCCAGGCCTTGGTGGAACATGTCAAGGAGGAGTGTGACCGCCTGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123144 TCCAGGCCTTGGTGGAACATGTCAAGGAGGAGTGTGACCGCCTGGGCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCATGGCCGACATA         TGCAAGAACTATATCAGCCAGTATTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123194 GGCATGGCCGACATAGTG...CAGTGCAAGAACTATATCAGCCAGTATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAAATTGCTATCCAGATGATGATGCACATG         CAACCCAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 125355 TGAAATTGCTATCCAGATGATGATGCACATGGTA...CAGCAACCCAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGATCTGTGCGCTGGTTGGGTTCTGTGATGAGGTGAAAGAGATGCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129225 AGATCTGTGCGCTGGTTGGGTTCTGTGATGAGGTGAAAGAGATGCCCATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGACTCTGGTCCCCGCCAAAGTGGCCTCCAAGAATGTCATCCCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129275 CAGACTCTGGTCCCCGCCAAAGTGGCCTCCAAGAATGTCATCCCTGCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAACTGGTGGAGCCCATTAAG         AAGCACGAGGTCCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 129325 GGAACTGGTGGAGCCCATTAAGGTA...CAGAAGCACGAGGTCCCAGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGTCTGATGTTTACTGTGAGGTGTGTGAATTCCTGGTGAAGGAGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130906 AGTCTGATGTTTACTGTGAGGTGTGTGAATTCCTGGTGAAGGAGGTGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGCTGATTGACAACAACAAGACTGAG         AAAGAAATACTCGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 130956 AAGCTGATTGACAACAACAAGACTGAGGTA...CAGAAAGAAATACTCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CGCTTTTGACAAAATGTGCTCGAAGCTGCCGAAGTCCCTGTCGGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131336 CGCTTTTGACAAAATGTGCTCGAAGCTGCCGAAGTCCCTGTCGGAAGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCCAGGAGGTGGTGGACACGTACGGCAGCTCCATCCTGTCCATCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131386 GCCAGGAGGTGGTGGACACGTACGGCAGCTCCATCCTGTCCATCCTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGGAGGTCAGCCCTGAGCTGGTGTGCAGCATGCTGCACCTCTGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131436 GAGGAGGTCAGCCCTGAGCTGGTGTGCAGCATGCTGCACCTCTGCTCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CACGCGGCTGCCTGCACTGACCG         TTCACGTGACTCAGCCAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131486 CACGCGGCTGCCTGCACTGACCGGTG...TAGTTCACGTGACTCAGCCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGGACGGTGGCTTCTGCGAAGTGTGCAAGAAGCTGGTGGGTTATTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131618 AGGACGGTGGCTTCTGCGAAGTGTGCAAGAAGCTGGTGGGTTATTTGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CGCAACCTGGAGAAAAACAGCACCAAGCAGGAGATCCTGGCTGCTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131668 CGCAACCTGGAGAAAAACAGCACCAAGCAGGAGATCCTGGCTGCTCTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GAAAGGCTGCAGCTTCCTGCCAGACCCTTACCAGAAGCAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 131718 GAAAGGCTGCAGCTTCCTGCCAGACCCTTACCAGAAGCAGGTA...TAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GTGATCAGTTTGTGGCAGAGTACGAGCCCGTGCTGATCGAGATCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132112 GTGATCAGTTTGTGGCAGAGTACGAGCCCGTGCTGATCGAGATCCTGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGGTGATGGATCCTTCCTTCGTGTGCTTG         AAAATTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 132162 GAGGTGATGGATCCTTCCTTCGTGTGCTTGGTG...TAGAAAATTGGAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CTGCCCCTCGGCCCATAAGCCCTTGTTGGGAACTGAGAAGTGTATATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132509 CTGCCCCTCGGCCCATAAGCCCTTGTTGGGAACTGAGAAGTGTATATGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GCCCAAGCTACTGGTGCCAGAACACAGAGACAGCAGCCCAGTGCAAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 132559 GCCCAAGCTACTGGTGCCAGAACACAGAGACAGCAGCCCAGTGCAATGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .
   1540       GCTGTCGAGCATTGCAAACGCCATGTGTGGAAC
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 132609 ...CAGGCTGTCGAGCATTGCAAACGCCATGTGTGGAAC