seq1 = pF1KE2762.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE2762/gi568815584r_100046764.tfa (gi568815584r:100046764_100259587), 212824 bp

>pF1KE2762 969
>gi568815584r:100046764_100259587 (Chr14)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-825  (109878-110620)   99% ->
826-969  (112681-112824)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACAGCGCGAGCCGCAGCGACTTCGAGTGGGTCTACACCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAACAGCGCGAGCCGCAGCGACTTCGAGTGGGTCTACACCGACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCACACGCAGCGGCGCAAGGAGATACTGG         CCAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GCCGCACACGCAGCGGCGCAAGGAGATACTGGGTG...CAGCCAAGTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGCCATCAAGGCCCTGATGCGGCCAGACCCGCGCCTCAAGTGGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109887 CGGCCATCAAGGCCCTGATGCGGCCAGACCCGCGCCTCAAGTGGGCGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGTGCTGGTGCTGGTGCAGATGCTGACCTGCTGGCTGGTGCGCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 109937 CTGGTGCTGGTGCTGGTGCAGATGCTGGCCTGCTGGCTGGTGCGCGGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCTGGCGCTGGCTGCTGTTCTGGGCCTACGCCTTTGGTGGCTGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109987 GGCCTGGCGCTGGCTGCTGTTCTGGGCCTACGCCTTTGGTGGCTGCGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCACTCGCTGACGCTGGCCATCCACGACATCTCGCACAACGCGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110037 ACCACTCGCTGACGCTGGCCATCCACGACATCTCGCACAACGCGGCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCACGGGCCGTGCGGCACGCAACCGCTGGCTGGCCGTGTTCGCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110087 GGCACGGGCCGTGCGGCACGCAACCGCTGGCTGGCCGTGTTCGCCAACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCCGTGGGTGTGCCCTACGCCGCCTCCTTCAAGAAGTACCACGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110137 GCCCGTGGGTGTGCCCTACGCCGCCTCCTTCAAGAAGTACCACGTGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCACCGCTACCTGGGCGGCGACGGGCTGGACGTGGACGTGCCCACGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110187 ACCACCGCTACCTGGGCGGCGACGGGCTGGACGTGGACGTGCCCACGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGAGGGCTGGTTCTTCTGCACGCCCGCCCGCAAGCTGCTCTGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 110237 CTGGAGGGCTGGTTCTTCTGCACACCCGCCCGCAAGCTGCTCTGGCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCTGCAGCCCTTCTTCTACTCACTACGGCCGCTCTGCGTCCACCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110287 GCTGCAGCCCTTCTTCTACTCACTACGGCCGCTCTGCGTCCACCCCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCGTGACCCGCATGGAGGTGCTCAACACGCTGGTGCAGCTGGCGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110337 CCGTGACCCGCATGGAGGTGCTCAACACGCTGGTGCAGCTGGCGGCCGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGGCCATCTTTGCCCTTTGGGGGCTCAAGCCCGTGGTCTACCTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110387 CTGGCCATCTTTGCCCTTTGGGGGCTCAAGCCCGTGGTCTACCTGCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGCTCCTTCCTGGGCCTGGGCCTGCACCCCATCTCGGGCCACTTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110437 CAGCTCCTTCCTGGGCCTGGGCCTGCACCCCATCTCGGGCCACTTCGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCGAGCACTACATGTTCCTCAAGGGCCACGAGACCTACTCCTACTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110487 CCGAGCACTACATGTTCCTCAAGGGCCACGAGACCTACTCCTACTATGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTCTCAACTGGATCACCTTCAATGTGGGCTACCACGTGGAGCACCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110537 CCTCTCAACTGGATCACCTTCAATGTGGGCTACCACGTGGAGCACCACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTTCCCCAGCATCCCGGGCTACAACCTGCCGCTG         GTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110587 CTTCCCCAGCATCCCGGGCTACAACCTGCCGCTGGTA...CAGGTGCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGATCGCGCCCGAGTACTACGACCACCTGCCGCAGCACCACTCCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112688 AGATCGCGCCCGAGTACTACGACCACCTGCCGCAGCACCACTCCTGGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAGGTGCTCTGGGATTTTGTGTTTGAGGACTCCCTGGGGCCCTATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112738 AAGGTGCTCTGGGATTTTGTGTTTGAGGACTCCCTGGGGCCCTATGCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .
    933 GGTGAAGCGGGTGTACAGGCTGGCAAAAGATGGTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112788 GGTGAAGCGGGTGTACAGGCTGGCAAAAGATGGTCTG