seq1 = pF1KE2760.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE2760/gi568815576f_38884071.tfa (gi568815576f:38884071_39091515), 207445 bp

>pF1KE2760 753
>gi568815576f:38884071_39091515 (Chr22)

14-174  (100001-100161)   100% ->
175-454  (101742-102021)   98% ->
455-569  (102228-102342)   100% ->
570-753  (107262-107445)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 TCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 TCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 GAAAACGAACCCATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAAACGAACCCATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 AGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTTGGGACACAGGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTTGGGACACAGGGGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 TTCGAGGCCAG         GTGTATTTCGAGCCTCAGTACCACGCAGAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||| ||||||||||||||||||||
 100151 TTCGAGGCCAGGTA...CAGGTGTATTTCAAGCCTCAGTACCACGCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    205 ATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101772 ATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    255 TTTCCAGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101822 TTTCCAGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    305 CGAAGCTGGCCGAATTCCTGTCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101872 CGAAGCTGGCCGAATTCCTGTCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 TCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101922 TCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 CTGCAGGCTGAGTCAGGCAGGAGCCCGCGTGAAGATCATGGACTATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101972 CTGCAGGCTGAGTCAGGCAGGAGCCCGCGTGACGATCATGGACTATGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    455          AATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAATGAAGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102022 GTG...CAGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAATGAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 CAGCAATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGAAAATTATGCATTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102269 CAGCAATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGAAAATTATGCATTCCTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546 CCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAG         GCTAAGAATCTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102319 CCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGGTG...TAGGCTAAGAATCTTCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587 TGGCTTTTACGGCCGCCATGCGGAGCTGCGCTTCTTGGACCTGGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107279 TGGCTTTTACGGCCGCCATGCGGAGCTGCGCTTCTTGGACCTGGTTCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 CTTTGCAGTTGGACCCGGCCCAGATCTACAGGGTCACTTGGTTCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107329 CTTTGCAGTTGGACCCGGCCCAGATCTACAGGGTCACTTGGTTCATCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    687 TGGAGCCCCTGCTTCTCCTGGGGCTGTGCCGGGGAAGTGCGTGCGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107379 TGGAGCCCCTGCTTCTCCTGGGGCTGTGCCGGGGAAGTGCGTGCGTTCCT

    750     .    :    .
    737 TCAGGAGAACACACACG
        |||||||||||||||||
 107429 TCAGGAGAACACACACG