seq1 = pF1KE2756.tfa, 1467 bp
seq2 = pF1KE2756/gi568815583r_78862147.tfa (gi568815583r:78862147_79103946), 241800 bp

>pF1KE2756 1467
>gi568815583r:78862147_79103946 (Chr15)

(complement)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-271  (102160-102285)   100% ->
272-442  (104034-104204)   100% ->
443-549  (105122-105228)   100% ->
550-662  (105739-105851)   100% ->
663-723  (108147-108207)   100% ->
724-827  (112153-112256)   100% ->
828-912  (113674-113758)   100% ->
913-1110  (118743-118940)   100% ->
1111-1190  (123248-123327)   100% ->
1191-1308  (130527-130644)   100% ->
1309-1377  (132013-132081)   100% ->
1378-1467  (141711-141800)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACTCGGCCATGTCACCCTTCAGCAAGGCCACGCTGGACACCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACTCGGCCATGTCACCCTTCAGCAAGGCCACGCTGGACACCAGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTATGTGTCCAGCAGCTTCACCAACAAGATTCCAGATGAGGGCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTATGTGTCCAGCAGCTTCACCAACAAGATTCCAGATGAGGGCGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGACCCCTGAGAAGCCCGAAGACCCTTCAGCGCTCAGCAAGCAGA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 CGACCCCTGAGAAGCCCGAAGACCCTTCAGCGCTCAGCAAGCAGAGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GCTCAGAAGTCTCCATGAGAGAGGAGTCAGATATTGATCAAAACCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGGCTCAGAAGTCTCCATGAGAGAGGAGTCAGATATTGATCAAAACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGTGATGATGGTGATACTGAAACATCACCAACTAAATCTCCAACAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102206 GAGTGATGATGGTGATACTGAAACATCACCAACTAAATCTCCAACAACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAAATCAGTCAAAAACAAAAATTCTTCAG         AGTTCCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102256 CCAAATCAGTCAAAAACAAAAATTCTTCAGGTA...CAGAGTTCCCACTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTTCCTATAACAATGGAGTCGTCATGACCTCCTGTCGTGAACTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 TTTTCCTATAACAATGGAGTCGTCATGACCTCCTGTCGTGAACTGGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAACCGCAGTGCCTTGTCGGCCGCCTCTGCCTTTGCCATAGCAACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104095 TAACCGCAGTGCCTTGTCGGCCGCCTCTGCCTTTGCCATAGCAACCGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCCAACGAGGGCACCCCAAACAAGGAGAAGTACCGGAGGATGTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104145 GGGCCAACGAGGGCACCCCAAACAAGGAGAAGTACCGGAGGATGTCCTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCAGTGCAG         GGTTTCCCCCAGACCAGAGGAATGGAGACAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104195 GCCAGTGCAGGTA...CAGGGTTTCCCCCAGACCAGAGGAATGGAGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGTTTGTGATCCGCAGAGCAGCCACCAATCGTGTCTTGAACGTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105153 GGAGTTTGTGATCCGCAGAGCAGCCACCAATCGTGTCTTGAACGTGCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCACTGGGTGTCCAAGCACTCTCAG         GACTTTGAGACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105203 GCCACTGGGTGTCCAAGCACTCTCAGGTG...CAGGACTTTGAGACCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGAGCTCAAATGCAAGGTGATCGGCTTCCTGGAAGAAGTCATGCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105754 GATGAGCTCAAATGCAAGGTGATCGGCTTCCTGGAAGAAGTCATGCACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCGGAGCTCCTGACCCAGGAGCGGAAGGCTGCAGCCAACATCATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105804 CCCGGAGCTCCTGACCCAGGAGCGGAAGGCTGCAGCCAACATCATCAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    663        GACTCTGACCCAGGAGGACCCAGGTGACAACCAGATCACGCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105854 A...TAGGACTCTGACCCAGGAGGACCCAGGTGACAACCAGATCACGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGGAGATCACGCAGATG         GCTGAAGGCGTGAAGGCTGAGCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108190 GAGGAGATCACGCAGATGGTG...CAGGCTGAAGGCGTGAAGGCTGAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTTGAAAACCACTCAGCCCTGGAGATCGCGGAGCAGCTGACCCTGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112176 CTTTGAAAACCACTCAGCCCTGGAGATCGCGGAGCAGCTGACCCTGCTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATCACCTCGTCTTCAAGAAGATTCCTTATGA         GGAGTTCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112226 ATCACCTCGTCTTCAAGAAGATTCCTTATGAGTA...CAGGGAGTTCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGACAAGGATGGATGAAACTGGAAAAGAATGAAAGGACCCCTTATATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113684 GGACAAGGATGGATGAAACTGGAAAAGAATGAAAGGACCCCTTATATCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAAACCACTAAGCACTTCAATGAC         ATCAGTAACTTGATTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113734 GAAAACCACTAAGCACTTCAATGACGTG...AAGATCAGTAACTTGATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTTCAGAAATCATCCGCAATGAGGACATCAACGCCAGGGTGAGCGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118759 CTTCAGAAATCATCCGCAATGAGGACATCAACGCCAGGGTGAGCGCCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGAAGTGGGTGGCCGTAGCTGACATATGCCGCTGCCTCCACAACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118809 GAGAAGTGGGTGGCCGTAGCTGACATATGCCGCTGCCTCCACAACTACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGCCGTACTGGAGATCACCTCGTCCATGAACCGCAGTGCAATCTTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118859 TGCCGTACTGGAGATCACCTCGTCCATGAACCGCAGTGCAATCTTCCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCAAAAAGACGTGGCTCAAAGTCTCTAAGCAG         ACTAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118909 TCAAAAAGACGTGGCTCAAAGTCTCTAAGCAGGTG...TAGACTAAAGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTGATTGATAAGCTCCAAAAGCTTGTGTCATCTGAGGGCAGATTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123257 TTGATTGATAAGCTCCAAAAGCTTGTGTCATCTGAGGGCAGATTTAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCTCAGAGAAGCTCTGAAAAA         TTGTGACCCACCCTGTGTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 123307 TCTCAGAGAAGCTCTGAAAAAGTA...AAGTTGTGACCCACCCTGTGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTTACCTGGGGATGTACCTCACCGACCTGGCCTTCATCGAGGAGGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130547 CTTACCTGGGGATGTACCTCACCGACCTGGCCTTCATCGAGGAGGGGACG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCCAATTACACGGAAGACGGCCTGGTCAACTTCTCCAAGATGAGGATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 130597 CCCAATTACACGGAAGACGGCCTGGTCAACTTCTCCAAGATGAGGATGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1309        ATATCCCATATTATCCGAGAGATTCGCCAGTTTCAACAAACTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130647 G...CAGATATCCCATATTATCCGAGAGATTCGCCAGTTTCAACAAACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCTACAAAATAGAGCACCAAGCAAAG         GTAACGCAATATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 132056 CCTACAAAATAGAGCACCAAGCAAAGGTA...CAGGTAACGCAATATTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CTGGACCAATCTTTTGTAATGGATGAAGAAAGCCTCTACGAGTCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141726 CTGGACCAATCTTTTGTAATGGATGAAGAAAGCCTCTACGAGTCTTCTCT

   1550     .    :    .    :    .
   1443 CCGAATAGAACCAAAACTCCCCACC
        |||||||||||||||||||||||||
 141776 CCGAATAGAACCAAAACTCCCCACC