seq1 = pF1KE2754.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KE2754/gi568815593r_60654627.tfa (gi568815593r:60654627_60887397), 232771 bp

>pF1KE2754 843
>gi568815593r:60654627_60887397 (Chr5)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-255  (115305-115495)   100% ->
256-336  (119495-119575)   100% ->
337-393  (120768-120824)   100% ->
394-499  (123066-123171)   100% ->
500-636  (129753-129889)   100% ->
637-843  (132565-132771)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTCAGTGATCTTACATCGAGGACTGTGCATCTTTATGATAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTCAGTGATCTTACATCGAGGACTGTGCATCTTTATGATAATTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCAAAGATGCTG         ATCCAAGAGTTGAAGATTGGCTCCTCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCAAAGATGCTGGTG...TAGATCCAAGAGTTGAAGATTGGCTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTCCTCGCCTCTGCCACAAACCATCCTCCTAGGATTCTATGTCTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115332 TGTCCTCGCCTCTGCCACAAACCATCCTCCTAGGATTCTATGTCTATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCACTTCCTTGGGACCAAAGCTCATGGAAAATCGCAAGCCCTTTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115382 GTCACTTCCTTGGGACCAAAGCTCATGGAAAATCGCAAGCCCTTTGAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGAAAGCAATGATAACGTACAATTTTTTCATAGTACTCTTTTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115432 CAAGAAAGCAATGATAACGTACAATTTTTTCATAGTACTCTTTTCTGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATGTGTTATGAG         TTTGTGATGTCTGGCTGGGGTATAGGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 115482 ATATGTGTTATGAGGCA...CAGTTTGTGATGTCTGGCTGGGGTATAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATTCATTTCGATGTGACATTGTTGACTATTCACGGTCACCCACAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119522 TATTCATTTCGATGTGACATTGTTGACTATTCACGGTCACCCACAGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGG         ATGGCACGTACCTGCTGGCTTTATTACTTCTCCAAAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119572 GAGGGTA...CAGATGGCACGTACCTGCTGGCTTTATTACTTCTCCAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTATTGAGCTATTAGATACG         ATCTTTTTTGTTCTGCGCAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 120805 TTATTGAGCTATTAGATACGGTG...CAGATCTTTTTTGTTCTGCGCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAAATAGCCAAGTGACTTTCCTTCATGTATTCCATCATACCATCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123087 AAAAATAGCCAAGTGACTTTCCTTCATGTATTCCATCATACCATCATGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTGGACCTGGTGGTTTGGAGTCAAATTTGCTGCAG         GTGGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123137 GTGGACCTGGTGGTTTGGAGTCAAATTTGCTGCAGGTA...CAGGTGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGGAACATTCCATGCCCTTCTAAATACAGCTGTACATGTAGTCATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129759 TGGGAACATTCCATGCCCTTCTAAATACAGCTGTACATGTAGTCATGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCCTACTATGGACTTTCTGCATTGGGGCCAGCCTACCAGAAGTATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129809 TCCTACTATGGACTTTCTGCATTGGGGCCAGCCTACCAGAAGTATTTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTGGAAAAAATATTTGACATCATTACAGCTT         GTCCAGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 129859 GTGGAAAAAATATTTGACATCATTACAGCTTGTG...TAGGTCCAGTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTATTGTCGCCATCCACATAAGCCAGTTCTTTTTCATGGAGGATTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132575 TTATTGTCGCCATCCACATAAGCCAGTTCTTTTTCATGGAGGATTGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATCAGTTTCCAGTCTTTGCGTGCATCATTATGAGTTACAGTTTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132625 TATCAGTTTCCAGTCTTTGCGTGCATCATTATGAGTTACAGTTTCATGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCTGCTGCTCTTTCTCCATTTTTGGTACCGTGCTTACACCAAAGGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132675 TCTGCTGCTCTTTCTCCATTTTTGGTACCGTGCTTACACCAAAGGTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    797 GGTTGCCCAAAACTGTGAAAAATGGAACTTGCAAAAACAAAGATAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132725 GGTTGCCCAAAACTGTGAAAAATGGAACTTGCAAAAACAAAGATAAT