seq1 = pF1KE2751.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KE2751/gi568815592f_127019193.tfa (gi568815592f:127019193_127296004), 276812 bp

>pF1KE2751 816
>gi568815592f:127019193_127296004 (Chr6)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-289  (129456-129647)   100% ->
290-436  (131234-131380)   100% ->
437-634  (136049-136246)   100% ->
635-816  (176631-176812)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTTGCGACTGATTTCTTGGCTTTTTATCATTTTGAACTTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACTTGCGACTGATTTCTTGGCTTTTTATCATTTTGAACTTTATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATACATCGGCAGCCAAAACGCCTCCCGGGGAAGGCGCCAGCGAAGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 ATACATCGGCAGCCAAAACGCCTCCCGGGGAAGGCGCCAGCGAAGAAGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       TGCATCCTAACGTTAGTCAAGGCTGCCAAGGAGGCTGTGCAACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGTGCATCCTAACGTTAGTCAAGGCTGCCAAGGAGGCTGTGCAACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTCAGATTACAATGGATGTTTGTCATGTAAGCCCAGACTATTTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129500 TGCTCAGATTACAATGGATGTTTGTCATGTAAGCCCAGACTATTTTTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGGAAAGAATTGGCATGAAGCAGATTGGAGTATGTCTCTCTTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129550 TCTGGAAAGAATTGGCATGAAGCAGATTGGAGTATGTCTCTCTTCATGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAAGTGGATATTATGGAACTCGATATCCAGATATAAATAAGTGTACAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129600 CAAGTGGATATTATGGAACTCGATATCCAGATATAAATAAGTGTACAAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        AATGCAAAGCTGACTGTGATACCTGTTTCAACAAAAATTTCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129650 A...CAGAATGCAAAGCTGACTGTGATACCTGTTTCAACAAAAATTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACAAAATGTAAAAGTGGATTTTACTTACACCTTGGAAAGTGCCTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131277 CACAAAATGTAAAAGTGGATTTTACTTACACCTTGGAAAGTGCCTTGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTGCCCAGAAGGGTTGGAAGCCAACAACCATACTATGGAGTGTGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131327 ATTGCCCAGAAGGGTTGGAAGCCAACAACCATACTATGGAGTGTGTCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATTG         TGCACTGTGAGGTCAGTGAATGGAATCCTTGGAGTCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131377 ATTGGTA...CAGTGCACTGTGAGGTCAGTGAATGGAATCCTTGGAGTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATGCACGAAGAAGGGAAAAACATGTGGCTTCAAAAGAGGGACTGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136086 ATGCACGAAGAAGGGAAAAACATGTGGCTTCAAAAGAGGGACTGAAACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGTCCGAGAAATAATACAGCATCCTTCAGCAAAGGGTAACCTGTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136136 GGGTCCGAGAAATAATACAGCATCCTTCAGCAAAGGGTAACCTGTGTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCAACAAATGAGACAAGAAAGTGTACAGTGCAAAGGAAGAAGTGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136186 CCAACAAATGAGACAAGAAAGTGTACAGTGCAAAGGAAGAAGTGTCAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGGAGAACGAG         GAAAAAAAGGAAGGGAGAGGAAAAGAAAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 136236 GGGAGAACGAGGTA...CAGGAAAAAAAGGAAGGGAGAGGAAAAGAAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AACCTAATAAAGGAGAAAGTAAAGAAGCAATACCTGACAGCAAAAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176661 AACCTAATAAAGGAGAAAGTAAAGAAGCAATACCTGACAGCAAAAGTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAATCCAGCAAAGAAATCCCAGAGCAACGAGAAAACAAACAGCAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176711 GAATCCAGCAAAGAAATCCCAGAGCAACGAGAAAACAAACAGCAGCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAAGCGAAAAGTCCAAGATAAACAGAAATCGGTATCAGTCAGCACTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176761 GAAGCGAAAAGTCCAAGATAAACAGAAATCGGTATCAGTCAGCACTGTAC

    850 
    815 AC
        ||
 176811 AC