seq1 = pF1KE2749.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KE2749/gi568815579f_10014097.tfa (gi568815579f:10014097_10214735), 200639 bp

>pF1KE2749 639
>gi568815579f:10014097_10214735 (Chr19)

1-639  (100001-100639)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCACACTCAGCTTCTCCCACCTGAAGAGGCCGCAGCAGGGGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCACACTCAGCTTCTCCCACCTGAAGAGGCCGCAGCAGGGGGCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTGCAGCGTGGCCAGGCCCGAGGCCTGCATCAAGTGTCTGGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACTGCAGCGTGGCCAGGCCCGAGGCCTGCATCAAGTGTCTGGGGACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGACCACGGGCTGGCGGCCTACAGAGCGTATAGCCTGGTGCTGGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGACCACGGGCTGGCGGCCTACAGAGCGTATAGCCTGGTGCTGGCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGGCTGCGGCCTGCCGCTGCTGCTCACGCTGGCAGCCTACGGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGGCTGCGGCCTGCCGCTGCTGCTCACGCTGGCAGCCTACGGCGCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGGCGGGCCGTGCTACGCAGCCCAGGCATGACTGTGGCCGAGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGGCGGGCCGTGCTACGCAGCCCAGGCATGACTGTGGCCGAGAAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGTGGCAGCGTTGGTGGCCAGTGGTGTGGCCCTCTACGCCAGCTCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGTGGCAGCGTTGGTGGCCAGTGGTGTGGCCCTCTACGCCAGCTCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCCCTACCACATCATGCGGGTGCTCAACGTGGATGCTCGGCGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCCCTACCACATCATGCGGGTGCTCAACGTGGATGCTCGGCGGCGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCACCCGCTGCCCGAGCTTTGCAGACATAGCCCAGGCCACAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCACCCGCTGCCCGAGCTTTGCAGACATAGCCCAGGCCACAGCAGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGCTGGGGCCCTACGTGGGCTACCAGGTGATGCGGGGCCTCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAGCTGGGGCCCTACGTGGGCTACCAGGTGATGCGGGGCCTCATGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGCCTTCTGTGTCCACCCTCTACTCTACATGGCCGCAGTGCCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGCCTTCTGTGTCCACCCTCTACTCTACATGGCCGCAGTGCCCAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCTGCTGCTGCCGACACTGCCCCGGCTACAGGGACAGCTGGAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCTGCTGCTGCCGACACTGCCCCGGCTACAGGGACAGCTGGAACCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGACGCCAAGAGCACTGGCCAAGCCCTGCCCCTCAATGCCACAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGACGCCAAGAGCACTGGCCAAGCCCTGCCCCTCAATGCCACAGCCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .
    601 CCTAAACCGTCAGAGCCCCAGTCCCGTGAGCTGAGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTAAACCGTCAGAGCCCCAGTCCCGTGAGCTGAGCCAA