seq1 = pF1KE2744.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KE2744/gi568815595r_139461013.tfa (gi568815595r:139461013_139679053), 218041 bp

>pF1KE2744 645
>gi568815595r:139461013_139679053 (Chr3)

(complement)

1-182  (100001-100182)   100% ->
183-265  (105374-105456)   100% ->
266-645  (117662-118041)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACCAGGTCATCCAGGGTATCATCTCTCCTGTCAACGACACCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACCAGGTCATCCAGGGTATCATCTCTCCTGTCAACGACACCTATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAAAGACCTCGCAGCTTCTCATCACCGAGTGGCCATGGCCCGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAAAGACCTCGCAGCTTCTCATCACCGAGTGGCCATGGCCCGGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGCAGACATCCGACTGGATCCGGGTGGACCCTTGGGAGAGTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGCAGACATCCGACTGGATCCGGGTGGACCCTTGGGAGAGTGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACAGTGGATGGAGACAGTGAAGGTGCTGAG         GCATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100151 GCACAGTGGATGGAGACAGTGAAGGTGCTGAGGTA...CAGGCATCATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCAAACTGCTCAGATCTCCACCCCAGATGGAAGGCCCAGACCATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105383 CAGCAAACTGCTCAGATCTCCACCCCAGATGGAAGGCCCAGACCATGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGCACTCTTCTCGACCCCTGCAG         CTGTGCCTGAGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105433 AGGCACTCTTCTCGACCCCTGCAGGTG...CAGCTGTGCCTGAGCTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTCTCTGTGGGGCAGACGTCTTGAAGACCTTCCAGACCCCCAACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117679 CTTCTCTGTGGGGCAGACGTCTTGAAGACCTTCCAGACCCCCAACCTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGGATGCGCACATCCAGGAAATAGTGGAGAAGTTTGGCTTGGTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117729 GAAGGATGCGCACATCCAGGAAATAGTGGAGAAGTTTGGCTTGGTGTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGGCCGAGTAGGTCACGACCCAAAAGGTTACATCGCAGAATCTCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117779 TGGGCCGAGTAGGTCACGACCCAAAAGGTTACATCGCAGAATCTCCCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTACGGATGCACCAGCACAACATTCACCTGGCCAAGGAGCCTGTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117829 CTACGGATGCACCAGCACAACATTCACCTGGCCAAGGAGCCTGTGCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGAGATCAGTGCCACATACATCAGGCGAGCCTTGGGCCAAGGGCAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117879 TGAGATCAGTGCCACATACATCAGGCGAGCCTTGGGCCAAGGGCAGAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TAAAGTACCTGATTCCCGATGCTGTCATCACGTACATCAAGGACCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117929 TAAAGTACCTGATTCCCGATGCTGTCATCACGTACATCAAGGACCATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCTACACCAAGGGCAGTACCTGGAAAGGCAAAAGCACCCAGAGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117979 CTCTACACCAAGGGCAGTACCTGGAAAGGCAAAAGCACCCAGAGCACTGA

    650     .    :
    633 GGGCAAGACAAGC
        |||||||||||||
 118029 GGGCAAGACAAGC