seq1 = pF1KE2736.tfa, 711 bp
seq2 = pF1KE2736/gi568815586r_71025337.tfa (gi568815586r:71025337_71257678), 232342 bp

>pF1KE2736 711
>gi568815586r:71025337_71257678 (Chr12)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-123  (113466-113528)   98% ->
124-261  (117831-117968)   99% ->
262-336  (119449-119523)   100% ->
337-444  (119619-119726)   100% ->
445-576  (124855-124986)   100% ->
577-660  (128265-128348)   98% ->
661-711  (132292-132342)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGTGTGAGTGCCTGTATAAAATATTCTATGTTTACCTTCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGTGTGAGTGCCTGTATAAAATATTCTATGTTTACCTTCAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGTTCTGG         CTATGTGGTATCTTGATCCTAGCATTAGCAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGTTCTGGGTA...CAGCTATGTGGTATCTTGATCCTAGCATTAGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TATGGGTACGAATAAGCAATGACTCTCAAGCA         ATTTTTGGT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113497 TATGGGTACGAGTAAGCAATGACTCTCAAGCAGTA...CAGATTTTTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTGAAGATGTAGGCTCTAGCTCCTACGTTGCTGTGGACATATTGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117840 TCTGAAGATGTAGGCTCTAGCTCCTACGTTGCTGTGGACATATTGATTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTAGGTGCCATCATCATGATTCTGGGCTTCCTGGCATGCTGCGGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 117890 TGTAGGTGCCATCATCATGATTCTGGGCTTCCTGGGATGCTGCGGTGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAAAAGAAAGTCGCTGCATGCTTCTGTTG         TTTTTCATAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117940 TAAAAGAAAGTCGCTGCATGCTTCTGTTGGTG...CAGTTTTTCATAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGCTTCTGATCCTGCTCCTGCAGGTGGCGACAGGTATCCTAGGAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119461 TTGCTTCTGATCCTGCTCCTGCAGGTGGCGACAGGTATCCTAGGAGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTCAAATCTAAG         TCTGATCGCATTGTGAATGAAACTCTCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 119511 TTTCAAATCTAAGGTG...CAGTCTGATCGCATTGTGAATGAAACTCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAAAACACAAAGCTTTTGAGCGCCACAGGGGAAAGTGAAAAACAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119647 ATGAAAACACAAAGCTTTTGAGCGCCACAGGGGAAAGTGAAAAACAATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGGAAGCCATAATTGTGTTTCAAGAAGAG         TTTAAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 119697 CAGGAAGCCATAATTGTGTTTCAAGAAGAGGTA...CAGTTTAAATGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGGTTTGGTCAATGGAGCTGCTGATTGGGGAAATAATTTTCAACACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124866 CGGTTTGGTCAATGGAGCTGCTGATTGGGGAAATAATTTTCAACACTATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTGAATTATGTGCCTGTCTAGATAAGCAGAGACCATGCCAAAGCTATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124916 CTGAATTATGTGCCTGTCTAGATAAGCAGAGACCATGCCAAAGCTATAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGAAAACAAGTTTACAAAGAG         ACCTGTATTTCTTTCATAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124966 GGAAAACAAGTTTACAAAGAGGTG...CAGACCTGTATTTCTTTCATAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGACTTCTTGGCAAAAAATTTGATTATAGTTATTGGAATAGCATTTGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 128285 AGACTTCTTGGCAAAAAATTTGATTATAGTTATTGGAATATCATTTGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGGCAGTTATTGAG         ATACTGGGTTTGGTGTTTTCTATGGTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128335 TGGCAGTTATTGAGGTA...TAGATACTGGGTTTGGTGTTTTCTATGGTC

    750     .    :    .    :
    688 CTGTATTGCCAGATCGGGAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||
 132319 CTGTATTGCCAGATCGGGAACAAA