seq1 = pF1KE2735.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE2735/gi568815581r_7073662.tfa (gi568815581r:7073662_7278563), 204902 bp

>pF1KE2735 756
>gi568815581r:7073662_7278563 (Chr17)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-166  (101488-101583)   100% ->
167-238  (101663-101734)   100% ->
239-325  (104104-104190)   100% ->
326-477  (104275-104426)   100% ->
478-584  (104497-104603)   100% ->
585-756  (104731-104902)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAAGGAGTATCAAGACCTTCAGCATCTGGACAATGAGGAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAAGGAGTATCAAGACCTTCAGCATCTGGACAATGAGGAGAGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCATCAGCTCAGAAAAG         ACTCCCAGCTGCAGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CCACCATCAGCTCAGAAAAGGTG...CAGACTCCCAGCTGCAGGAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCGGGGCCTGAGAGAGACGTTCAGCAACTTCACAGCGAGCACGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101509 TGCGGGGCCTGAGAGAGACGTTCAGCAACTTCACAGCGAGCACGGAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGGTCAAGGGCTTGAGCACCCAGG         GAGGCAATGTGGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101559 CAGGTCAAGGGCTTGAGCACCCAGGGTG...CAGGAGGCAATGTGGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAGATGAAGTCGCTAGAGTCCCAGCTGGAGAAACAGCAGAAGGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101679 AAAGATGAAGTCGCTAGAGTCCCAGCTGGAGAAACAGCAGAAGGACCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAAG         ATCACTCCAGCCTGCTGCTCCACGTGAAGCAGTTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101729 GTGAAGGTC...CAGATCACTCCAGCCTGCTGCTCCACGTGAAGCAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGTCTGACCTGCGGAGCCTGAGCTGTCAGATGGCGGCGCTCCAGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104139 GTGTCTGACCTGCGGAGCCTGAGCTGTCAGATGGCGGCGCTCCAGGGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TG         GCTCAGAAAGGACCTGCTGCCCGGTCAACTGGGTGGAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104189 TGGTA...CAGGCTCAGAAAGGACCTGCTGCCCGGTCAACTGGGTGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACGAGCGCAGCTGCTACTGGTTCTCTCGCTCCGGGAAGGCCTGGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104314 ACGAGCGCAGCTGCTACTGGTTCTCTCGCTCCGGGAAGGCCTGGGCTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCGACAACTACTGCCGGCTGGAGGACGCGCACCTGGTGGTGGTCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104364 GCCGACAACTACTGCCGGCTGGAGGACGCGCACCTGGTGGTGGTCACGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGGGAGGAGCAG         AAATTTGTCCAGCACCACATAGGCCCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104414 CTGGGAGGAGCAGGTG...CAGAAATTTGTCCAGCACCACATAGGCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGAACACCTGGATGGGCCTCCACGACCAAAACGGGCCCTGGAAGTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104525 TGAACACCTGGATGGGCCTCCACGACCAAAACGGGCCCTGGAAGTGGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACGGGACGGACTACGAGACGGGCTTCAA         GAACTGGAGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104575 GACGGGACGGACTACGAGACGGGCTTCAAGTG...CAGGAACTGGAGGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGAGCAGCCGGACGACTGGTACGGCCACGGGCTCGGAGGAGGCGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104743 GGAGCAGCCGGACGACTGGTACGGCCACGGGCTCGGAGGAGGCGAGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGCCCACTTCACCGACGACGGCCGCTGGAACGACGACGTCTGCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104793 GTGCCCACTTCACCGACGACGGCCGCTGGAACGACGACGTCTGCCAGAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCCTACCGCTGGGTCTGCGAGACAGAGCTGGACAAGGCCAGCCAGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104843 CCCTACCGCTGGGTCTGCGAGACAGAGCTGGACAAGGCCAGCCAGGAGCC

    800     .    :
    747 ACCTCTCCTT
        ||||||||||
 104893 ACCTCTCCTT