seq1 = pF1KE2725.tfa, 1209 bp
seq2 = pF1KE2725/gi568815582r_79494463.tfa (gi568815582r:79494463_79699902), 205440 bp

>pF1KE2725 1209
>gi568815582r:79494463_79699902 (Chr16)

(complement)

1-1118  (100001-101118)   100% ->
1119-1209  (105350-105440)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCAGAACTGGCAATGAGCAACTCCGACCTGCCCACCAGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCAGAACTGGCAATGAGCAACTCCGACCTGCCCACCAGTCCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCATGGAATATGTTAATGACTTCGATCTGATGAAGTTTGAAGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCATGGAATATGTTAATGACTTCGATCTGATGAAGTTTGAAGTGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAACCGGTGGAGACCGACCGCATCATCAGCCAGTGCGGCCGTCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAACCGGTGGAGACCGACCGCATCATCAGCCAGTGCGGCCGTCTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGGGGGCTCGCTGTCCTCCACCCCCATGAGCACGCCGTGCAGCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGGGGGCTCGCTGTCCTCCACCCCCATGAGCACGCCGTGCAGCTCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCCCTTCCCCCAGCTTCTCGGCGCCCAGCCCGGGCTCGGGCAGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCCCTTCCCCCAGCTTCTCGGCGCCCAGCCCGGGCTCGGGCAGCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGGCGCACCTGGAAGACTACTACTGGATGACCGGCTACCCGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGGCGCACCTGGAAGACTACTACTGGATGACCGGCTACCCGCAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAACCCCGAGGCGCTGGGCTTCAGCCCCGAGGACGCGGTCGAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGAACCCCGAGGCGCTGGGCTTCAGCCCCGAGGACGCGGTCGAGGCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCAGCAACAGCCACCAGCTCCAGGGCGGCTTCGATGGCTACGCGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCAGCAACAGCCACCAGCTCCAGGGCGGCTTCGATGGCTACGCGCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCGCAGCAGCTGGCCGCGGCGGCCGGGGCCGGTGCCGGCGCCTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGCGCAGCAGCTGGCCGCGGCGGCCGGGGCCGGTGCCGGCGCCTCCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGGCAGCGGCGAGGAGATGGGCCCCGCCGCCGCCGTGGTGTCCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGGCAGCGGCGAGGAGATGGGCCCCGCCGCCGCCGTGGTGTCCGCCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATCGCCGCGGCCGCCGCGCAGAGCGGCGCGGGCCCGCACTACCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATCGCCGCGGCCGCCGCGCAGAGCGGCGCGGGCCCGCACTACCACCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCACCACCACGCCGCCGGCCACCACCACCACCCGACGGCCGGCGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCACCACCACGCCGCCGGCCACCACCACCACCCGACGGCCGGCGCGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCGCCGCGGGCAGCGCGGCCGCCTCGGCCGGTGGCGCTGGGGGCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCGCCGCGGGCAGCGCGGCCGCCTCGGCCGGTGGCGCTGGGGGCGCGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGCGGTGGCCCGGCCAGCGCTGGGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGCGGTGGCCCGGCCAGCGCTGGGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAGGCGGCGGGGGCGCGGCGGGGGCGGGGGGCGCCCTGCACCCGCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAGGCGGCGGGGGCGCGGCGGGGGCGGGGGGCGCCCTGCACCCGCACCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCGCCGGCGGCCTGCACTTCGACGACCGCTTCTCCGACGAGCAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCGCCGGCGGCCTGCACTTCGACGACCGCTTCTCCGACGAGCAGCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACCATGTCTGTGCGCGAGCTGAACCGGCAGCTGCGCGGGGTCAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACCATGTCTGTGCGCGAGCTGAACCGGCAGCTGCGCGGGGTCAGCAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGAGGTGATCCGGCTGAAGCAGAAGAGGCGGACCCTGAAAAACCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGGAGGTGATCCGGCTGAAGCAGAAGAGGCGGACCCTGAAAAACCGCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TATGCCCAGTCCTGCCGCTTCAAGAGGGTGCAGCAGAGACACGTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TATGCCCAGTCCTGCCGCTTCAAGAGGGTGCAGCAGAGACACGTCCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCGGAGAAGAACCAGCTGCTGCAGCAAGTCGACCACCTCAAGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCGGAGAAGAACCAGCTGCTGCAGCAAGTCGACCACCTCAAGCAGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTCCAGGCTGGTGCGCGAGAGGGACGCGTACAAGGAGAAATACGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTCCAGGCTGGTGCGCGAGAGGGACGCGTACAAGGAGAAATACGAGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTGGTGAGCAGCGGCTTCCGAGAAAACGGCTCGAGCAGCGACAACCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTGGTGAGCAGCGGCTTCCGAGAAAACGGCTCGAGCAGCGACAACCCGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTCTCCCGAGTTTTTCAT         AACTGAGCCCACTCGCAAGTTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101101 CTCTCCCGAGTTTTTCATGTG...CAGAACTGAGCCCACTCGCAAGTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AGCCATCAGTGGGATACGCCACATTTTGGAAGCCCCAGCATCGTGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105373 AGCCATCAGTGGGATACGCCACATTTTGGAAGCCCCAGCATCGTGTACTT

   1200     .    :    .
   1192 ACCAGTGTGTTCACAAAA
        ||||||||||||||||||
 105423 ACCAGTGTGTTCACAAAA