seq1 = pF1KE2703.tfa, 2595 bp
seq2 = pF1KE2703/gi568815594r_15879395.tfa (gi568815594r:15879395_16175906), 296512 bp

>pF1KE2703 2595
>gi568815594r:15879395_16175906 (Chr4)

(complement)

1-220  (100001-100220)   100% ->
221-276  (136906-136961)   100% ->
277-303  (140146-140172)   100% ->
304-509  (142398-142603)   100% ->
510-630  (150595-150715)   100% ->
631-694  (151549-151612)   100% ->
695-784  (152492-152581)   100% ->
785-1002  (157367-157584)   100% ->
1003-1077  (159667-159741)   100% ->
1078-1141  (162569-162632)   100% ->
1142-1301  (166799-166958)   100% ->
1302-1454  (169217-169369)   100% ->
1455-1578  (175288-175411)   100% ->
1579-1682  (177419-177522)   100% ->
1683-1767  (181836-181920)   100% ->
1768-1911  (183516-183659)   100% ->
1912-1983  (184614-184685)   100% ->
1984-2076  (186083-186175)   100% ->
2077-2130  (188191-188244)   100% ->
2131-2211  (189870-189950)   100% ->
2212-2280  (190079-190147)   100% ->
2281-2373  (191552-191644)   100% ->
2374-2489  (195370-195485)   100% ->
2490-2513  (196003-196026)   100% ->
2514-2582  (196444-196512)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTCGTACTCGGCTCCCTGTTGCTGCTGGGGCTGTGCGGGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTCGTACTCGGCTCCCTGTTGCTGCTGGGGCTGTGCGGGAACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTTCAGGAGGGCAGCCTTCATCCACAGATGCTCCTAAGGCTTGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTTCAGGAGGGCAGCCTTCATCCACAGATGCTCCTAAGGCTTGGAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAATTGCCTGCAACAAATTATGAGACCCAAGACTCCCATAAAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAATTGCCTGCAACAAATTATGAGACCCAAGACTCCCATAAAGCTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCATTGGCATTCTCTTTGAACTAGTGCATATCTTTCTCTATGTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCATTGGCATTCTCTTTGAACTAGTGCATATCTTTCTCTATGTGGTACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCGCGTGATTTCCCAGAAG         ATACTTTGAGAAAATTCTTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100201 GCCGCGTGATTTCCCAGAAGGTA...CAGATACTTTGAGAAAATTCTTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAAGGCATATGAATCCAAAATTGATTATGACAAG         CCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136927 AGAAGGCATATGAATCCAAAATTGATTATGACAAGGTA...CAGCCAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTGTAATCTTAGGTCTAAAG         ATTGTCTACTATGAAGCAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 140152 ACTGTAATCTTAGGTCTAAAGGTA...CAGATTGTCTACTATGAAGCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATTATTCTATGCTGTGTCCTGGGGCTGCTGTTTATTATTCTGATGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142418 GATTATTCTATGCTGTGTCCTGGGGCTGCTGTTTATTATTCTGATGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGTGGGGTATTTCTTTTGTATGTGTCGTTGCTGTAACAAATGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142468 TGGTGGGGTATTTCTTTTGTATGTGTCGTTGCTGTAACAAATGTGGTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAATGCACCAGCGACAGAAGGAAAATGGGCCCTTCCTGAGGAAATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142518 GAAATGCACCAGCGACAGAAGGAAAATGGGCCCTTCCTGAGGAAATGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCAATCTCCCTGTTGGTGATTTGTATAATAATAAG         CATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 142568 TGCAATCTCCCTGTTGGTGATTTGTATAATAATAAGGCA...CAGCATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCATCTTCTATGGTTTTGTGGCAAATCACCAGGTAAGAACCCGGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150600 GCATCTTCTATGGTTTTGTGGCAAATCACCAGGTAAGAACCCGGATCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGGAGTCGGAAACTGGCAGATAGCAATTTCAAGGACTTGCGAACTCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150650 AGGAGTCGGAAACTGGCAGATAGCAATTTCAAGGACTTGCGAACTCTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAATGAAACTCCAGAG         CAAATCAAATATATATTGGCCCAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 150700 GAATGAAACTCCAGAGGTA...CAGCAAATCAAATATATATTGGCCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACAACACTACCAAGGACAAGGCGTTCACAGATCTGAACA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 151574 ACAACACTACCAAGGACAAGGCGTTCACAGATCTGAACAGTG...TAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCAATTCAGTGCTAGGAGGCGGAATTCTTGACCGACTGAGACCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152494 ATCAATTCAGTGCTAGGAGGCGGAATTCTTGACCGACTGAGACCCAACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATCCCTGTTCTTGATGAGATTAAGTCCATGGCAACAG         CGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 152544 CATCCCTGTTCTTGATGAGATTAAGTCCATGGCAACAGGTA...TAGCGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCAAGGAGACCAAAGAGGCGTTGGAGAACATGAACAGCACCTTGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157370 TCAAGGAGACCAAAGAGGCGTTGGAGAACATGAACAGCACCTTGAAGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTGCACCAACAAAGTACACAGCTTAGCAGCAGTCTGACCAGCGTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157420 TTGCACCAACAAAGTACACAGCTTAGCAGCAGTCTGACCAGCGTGAAAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TAGCCTGCGGTCATCTCTCAATGACCCTCTGTGCTTGGTGCATCCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157470 TAGCCTGCGGTCATCTCTCAATGACCCTCTGTGCTTGGTGCATCCATCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GTGAAACCTGCAACAGCATCAGATTGTCTCTAAGCCAGCTGAATAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157520 GTGAAACCTGCAACAGCATCAGATTGTCTCTAAGCCAGCTGAATAGCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCTGAACTGAGGCAG         CTTCCACCCGTGGATGCAGAACTTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 157570 CCTGAACTGAGGCAGGTG...CAGCTTCCACCCGTGGATGCAGAACTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CAACGTTAATAACGTTCTTAGGACAGATTTGGATGGCCTGGTCCAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 159693 CAACGTTAATAACGTTCTTAGGACAGATTTGGATGGCCTGGTCCAACAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078         GGCTATCAATCCCTTAATGATATACCTGACAGAGTACAACGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159743 TA...CAGGGCTATCAATCCCTTAATGATATACCTGACAGAGTACAACGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAAACCACGACTGTCGTAGCAG         GTATCAAAAGGGTCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 162611 CAAACCACGACTGTCGTAGCAGGTG...CAGGTATCAAAAGGGTCTTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTCCATTGGTTCAGATATCGACAATGTAACTCAGCGTCTTCCTATTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166818 TTCCATTGGTTCAGATATCGACAATGTAACTCAGCGTCTTCCTATTCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATATACTCTCAGCATTCTCTGTTTATGTTAATAACACTGAAAGTTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166868 ATATACTCTCAGCATTCTCTGTTTATGTTAATAACACTGAAAGTTACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CACAGAAATTTACCTACATTGGAAGAGTATGATTCATACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 166918 CACAGAAATTTACCTACATTGGAAGAGTATGATTCATACTGGTG...CAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GTGGCTGGGTGGCCTGGTCATCTGCTCTCTGCTGACCCTCATCGTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169217 GTGGCTGGGTGGCCTGGTCATCTGCTCTCTGCTGACCCTCATCGTGATTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTTACTACCTGGGCTTACTGTGTGGCGTGTGCGGCTATGACAGGCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169267 TTTACTACCTGGGCTTACTGTGTGGCGTGTGCGGCTATGACAGGCATGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACCCCGACCACCCGAGGCTGTGTCTCCAACACCGGAGGCGTCTTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169317 ACCCCGACCACCCGAGGCTGTGTCTCCAACACCGGAGGCGTCTTCCTCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGT         TGGAGTTGGATTAAGTTTCCTCTTTTGCTGGATATTGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169367 GGTGTG...CAGTGGAGTTGGATTAAGTTTCCTCTTTTGCTGGATATTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGATCATTGTGGTTCTTACCTTTGTCTTTGGTGCAAATGTGGAAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175326 TGATCATTGTGGTTCTTACCTTTGTCTTTGGTGCAAATGTGGAAAAACTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 ATCTGTGAACCTTACACGAGCAAGGAATTATTCCGG         GTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 175376 ATCTGTGAACCTTACACGAGCAAGGAATTATTCCGGGTA...TAGGTTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GGATACACCCTACTTACTAAATGAAGACTGGGAATACTATCTCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177424 GGATACACCCTACTTACTAAATGAAGACTGGGAATACTATCTCTCTGGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGCTATTTAATAAATCAAAAATGAAGCTCACTTTTGAACAAGTTTACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 177474 AGCTATTTAATAAATCAAAAATGAAGCTCACTTTTGAACAAGTTTACAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683         TGACTGCAAAAAAAATAGAGGCACTTACGGCACTCTTCACCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177524 TA...CAGTGACTGCAAAAAAAATAGAGGCACTTACGGCACTCTTCACCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GCAGAACAGCTTCAATATCAGTGAACATCTCAACATTAATGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 181878 GCAGAACAGCTTCAATATCAGTGAACATCTCAACATTAATGAGGTA...C

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1768   CATACTGGAAGCATAAGCAGTGAATTGGAAAGTCTGAAGGTAAATCTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183514 AGCATACTGGAAGCATAAGCAGTGAATTGGAAAGTCTGAAGGTAAATCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AATATCTTTCTGTTGGGTGCAGCAGGAAGAAAAAACCTTCAGGATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183564 AATATCTTTCTGTTGGGTGCAGCAGGAAGAAAAAACCTTCAGGATTTTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGCTTGTGGAATAGACAGAATGAATTATGACAGCTACTTGGCTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 183614 TGCTTGTGGAATAGACAGAATGAATTATGACAGCTACTTGGCTCAGGTA.

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1912      ACTGGTAAATCCCCCGCAGGAGTGAATCTTTTATCATTTGCATAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183664 ..TAGACTGGTAAATCCCCCGCAGGAGTGAATCTTTTATCATTTGCATAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GATCTAGAAGCAAAAGCAAACAGTTTG         CCCCCAGGAAATTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 184659 GATCTAGAAGCAAAAGCAAACAGTTTGGTG...TAGCCCCCAGGAAATTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GAGGAACTCCCTGAAAAGAGATGCACAAACTATTAAAACAATTCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186097 GAGGAACTCCCTGAAAAGAGATGCACAAACTATTAAAACAATTCACCAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AACGAGTCCTTCCTATAGAACAATCACTG         AGCACTCTATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 186147 AACGAGTCCTTCCTATAGAACAATCACTGGTA...CAGAGCACTCTATAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 CAAAGCGTCAAGATACTTCAACGCACAGGGAATGGATTGTTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 188203 CAAAGCGTCAAGATACTTCAACGCACAGGGAATGGATTGTTGGTA...CA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2131  GAGAGAGTAACTAGGATTCTAGCTTCTCTGGATTTTGCTCAGAACTTCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189869 GGAGAGAGTAACTAGGATTCTAGCTTCTCTGGATTTTGCTCAGAACTTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 TCACAAACAATACTTCCTCTGTTATTATTGAG         GAAACTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 189919 TCACAAACAATACTTCCTCTGTTATTATTGAGGTG...CAGGAAACTAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 AAGTATGGGAGAACAATAATAGGATATTTTGAACATTATCTGCAGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190088 AAGTATGGGAGAACAATAATAGGATATTTTGAACATTATCTGCAGTGGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 CGAGTTCTCT         ATCAGTGAGAAAGTGGCATCGTGCAAACCTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 190138 CGAGTTCTCTGTA...TAGATCAGTGAGAAAGTGGCATCGTGCAAACCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 TGGCCACCGCTCTAGATACTGCTGTTGATGTCTTTCTGTGTAGCTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191583 TGGCCACCGCTCTAGATACTGCTGTTGATGTCTTTCTGTGTAGCTACATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 ATCGACCCCTTG         AATTTGTTTTGGTTTGGCATAGGAAAAGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 191633 ATCGACCCCTTGGTA...TAGAATTTGTTTTGGTTTGGCATAGGAAAAGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 TACTGTATTTTTACTTCCGGCTCTAATTTTTGCGGTAAAACTGGCTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195399 TACTGTATTTTTACTTCCGGCTCTAATTTTTGCGGTAAAACTGGCTAAGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 ACTATCGTCGAATGGATTCGGAGGACGTGTACGATGA         TGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 195449 ACTATCGTCGAATGGATTCGGAGGACGTGTACGATGAGTA...TAGTGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2494 GAAACTATACCCATGAAAAA         TATGGAAAATGGTAATAATGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 196007 GAAACTATACCCATGAAAAAGTA...CAGTATGGAAAATGGTAATAATGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2535 TTATCATAAAGATCATGTATATGGTATTCACAATCCTGTTATGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196465 TTATCATAAAGATCATGTATATGGTATTCACAATCCTGTTATGACAAG