seq1 = pF1KE2702.tfa, 1287 bp
seq2 = pF1KE2702/gi568815580r_57450715.tfa (gi568815580r:57450715_57686620), 235906 bp

>pF1KE2702 1287
>gi568815580r:57450715_57686620 (Chr18)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-212  (106422-106566)   100% ->
213-332  (113256-113375)   100% ->
333-481  (115081-115229)   100% ->
482-616  (120040-120174)   100% ->
617-723  (123641-123747)   100% ->
724-822  (127378-127476)   98% ->
823-930  (131669-131776)   100% ->
931-1095  (132197-132361)   99% ->
1096-1155  (135247-135306)   100% ->
1156-1287  (135775-135906)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTTCACTCGGCGCAAACATGGCTGCGGCCCTGCGCGCCGCGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTTCACTCGGCGCAAACATGGCTGCGGCCCTGCGCGCCGCGGGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTCCGCGATCCGC         TGGCATCCAGCAGCTGGAGGGTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTCCGCGATCCGCGTA...CAGTGGCATCCAGCAGCTGGAGGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCAGCCATGGAGGTGGAAGTCAGGTGCAGCTGCAGCGGCCGTCACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106446 GTCAGCCATGGAGGTGGAAGTCAGGTGCAGCTGCAGCGGCCGTCACCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAACAGCCCAGCATGCCCAGGGTGCAAAACCTCAAGTTCAACCGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106496 GAAACAGCCCAGCATGCCCAGGGTGCAAAACCTCAAGTTCAACCGCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGGTATGAGTCTAACATCAG         GAAGCCGAAAACTGGAATAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106546 GAGGTATGAGTCTAACATCAGGTA...TAGGAAGCCGAAAACTGGAATAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAATGCTAAACATGGGAGGCCCTGAAACTCTTGGAGATGTTCACGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113276 TAATGCTAAACATGGGAGGCCCTGAAACTCTTGGAGATGTTCACGACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTCTGAGACTCTTCTTGGACCGAGACCTCATGACACTTCCTATTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113326 CTTCTGAGACTCTTCTTGGACCGAGACCTCATGACACTTCCTATTCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333          TAAGCTGGCACCATTCATCGCCAAACGCCGAACCCCCAAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113376 GTG...TAGTAAGCTGGCACCATTCATCGCCAAACGCCGAACCCCCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCAAGAGCAGTACCGCAGGATTGGAGGCGGATCCCCCATCAAGATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115122 TTCAAGAGCAGTACCGCAGGATTGGAGGCGGATCCCCCATCAAGATATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACTTCCAAGCAGGGAGAGGGCATGGTGAAGCTGCTGGATGAATTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115172 ACTTCCAAGCAGGGAGAGGGCATGGTGAAGCTGCTGGATGAATTGTCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAACACAG         CCCCTCACAAATACTATATTGGATTTCGGTACG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115222 CAACACAGGTA...TAGCCCCTCACAAATACTATATTGGATTTCGGTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCATCCTTTAACAGAAGAAGCAATTGAAGAGATGGAGAGAGATGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120073 TCCATCCTTTAACAGAAGAAGCAATTGAAGAGATGGAGAGAGATGGCCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAAGGGCTATTGCTTTCACACAGTATCCACAGTACAGCTGCTCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120123 GAAAGGGCTATTGCTTTCACACAGTATCCACAGTACAGCTGCTCCACCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AG         GCAGCAGCTTAAATGCCATTTACAGATACTATAATCAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120173 AGGTA...CAGGCAGCAGCTTAAATGCCATTTACAGATACTATAATCAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGACGGAAGCCCACGATGAAGTGGAGCACTATTGACAGGTGGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123680 TGGGACGGAAGCCCACGATGAAGTGGAGCACTATTGACAGGTGGCCCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATCACCTCCTCATCCAG         TGCTTTGCAGATCATATTCTAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 123730 CATCACCTCCTCATCCAGGTA...CAGTGCTTTGCAGATCATATTCTAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAACTGGACCATTTTCCACTTGAGAAGAGAAGCGAGGTGGTCATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127401 GGAACTGGACCATTTTCCACTTGAGAAGAGAAGCGAGGTGGTCATTCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTTCTGCTCACTCACTGCCGATGTCT         GTGGTCAACAGAGGC
        ||||||||||||||||||| ||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 127451 TTTCTGCTCACTCACTGCCCATGTCTGTA...CAGGTGGTCAACAGAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACCCATATCCTCAGGAGGTAAGCGCCACTGTCCAAAAAGTCATGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131684 GACCCATATCCTCAGGAGGTAAGCGCCACTGTCCAAAAAGTCATGGAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCTGGAGTACTGCAACCCCTACCGACTGGTGTGGCAATCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 131734 GCTGGAGTACTGCAACCCCTACCGACTGGTGTGGCAATCCAAGGTA...T

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    931   GTTGGTCCGATGCCCTGGTTGGGTCCTCAAACAGACGAATCTATCAAA
        >>|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132195 AGGTTGGTCCAATGCCCTGGTTGGGTCCTCAAACAGACGAATCTATCAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGGCTTTGTGAGAGGGGGAGGAAGAATATCCTCTTGGTTCCGATAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132245 GGGCTTTGTGAGAGGGGGAGGAAGAATATCCTCTTGGTTCCGATAGCATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TACCAGTGACCATATTGAAACGCTGTATGAGCTGGACATCGAGTACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132295 TACCAGTGACCATATTGAAACGCTGTATGAGCTGGACATCGAGTACTCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAGTTTTAGCCAAGGAG         TGTGGAGTTGAAAACATCAGAAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 132345 AAGTTTTAGCCAAGGAGGTA...CAGTGTGGAGTTGAAAACATCAGAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCTGAGTCTCTTAATGGAAATCCATTGTTCTCTAAG         GCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 135271 GCTGAGTCTCTTAATGGAAATCCATTGTTCTCTAAGGTA...CAGGCCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGCCGACTTGGTGCATTCACACATCCAGTCAAACGAGCTGTGTTCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135780 GGCCGACTTGGTGCATTCACACATCCAGTCAAACGAGCTGTGTTCCAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGCTGACCCTGAGCTGTCCGCTCTGTGTCAATCCTGTCTGCAGGGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135830 AGCTGACCCTGAGCTGTCCGCTCTGTGTCAATCCTGTCTGCAGGGAGACT

   1350     .    :    .    :    .
   1261 AAATCCTTCTTCACCAGCCAGCAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 135880 AAATCCTTCTTCACCAGCCAGCAGCTG