seq1 = pF1KE2686.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KE2686/gi568815588r_102730705.tfa (gi568815588r:102730705_102937361), 206657 bp

>pF1KE2686 1524
>gi568815588r:102730705_102937361 (Chr10)

(complement)

1-297  (100001-100297)   100% ->
298-436  (101970-102108)   100% ->
437-666  (102348-102577)   100% ->
667-753  (103240-103326)   100% ->
754-969  (104154-104369)   100% ->
970-1139  (104682-104851)   100% ->
1140-1243  (105751-105854)   100% ->
1244-1524  (106377-106657)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGAGCTCGTGGCTCTCTTGCTGCTTACCCTAGCTTATTTGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGAGCTCGTGGCTCTCTTGCTGCTTACCCTAGCTTATTTGTTTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCAAGAGAAGGTGCCCTGGTGCCAAGTACCCCAAGAGCCTCCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCAAGAGAAGGTGCCCTGGTGCCAAGTACCCCAAGAGCCTCCTGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCCTGGTGGGCAGCCTGCCATTCCTCCCCAGACACGGCCATATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCCTGGTGGGCAGCCTGCCATTCCTCCCCAGACACGGCCATATGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACAACTTCTTCAAGCTGCAGAAAAAATATGGCCCCATCTATTCGGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACAACTTCTTCAAGCTGCAGAAAAAATATGGCCCCATCTATTCGGTTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATGGGCACCAAGACTACAGTGATTGTCGGCCACCACCAGCTGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TATGGGCACCAAGACTACAGTGATTGTCGGCCACCACCAGCTGGCCAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTGCTTATTAAGAAGGGCAAGGACTTCTCTGGGCGGCCTCAAATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100251 AGGTGCTTATTAAGAAGGGCAAGGACTTCTCTGGGCGGCCTCAAATGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    298       GCAACTCTAGACATCGCGTCCAACAACCGTAAGGGTATCGCCTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ...AAGGCAACTCTAGACATCGCGTCCAACAACCGTAAGGGTATCGCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCTGACTCTGGCGCACACTGGCAGCTGCATCGAAGGCTGGCGATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102014 CGCTGACTCTGGCGCACACTGGCAGCTGCATCGAAGGCTGGCGATGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTTTGCCCTGTTCAAGGATGGCGATCAGAAGCTGGAGAAGATCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102064 CCTTTGCCCTGTTCAAGGATGGCGATCAGAAGCTGGAGAAGATCAGTG..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    437     TTTGTCAGGAAATCAGTACATTGTGTGATATGCTGGCCACCCACAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102114 .CAGTTTGTCAGGAAATCAGTACATTGTGTGATATGCTGGCCACCCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGGACAGTCCATAGACATCTCCTTTCCTGTCTTCGTGGCGGTAACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102394 CGGACAGTCCATAGACATCTCCTTTCCTGTCTTCGTGGCGGTAACCAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCATCTCCTTGATCTGCTTCAATACCTCCTACAAGAATGGGGACCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102444 TCATCTCCTTGATCTGCTTCAATACCTCCTACAAGAATGGGGACCCTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTGAATGTCATACAGAATTACAATGAAGGCATCATAGACAACCTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102494 TTGAATGTCATACAGAATTACAATGAAGGCATCATAGACAACCTGAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGACAGCCTGGTGGACCTAGTCCCCTGGTTGAAG         ATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102544 AGACAGCCTGGTGGACCTAGTCCCCTGGTTGAAGGTG...CAGATTTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAACAAAACCCTGGAAAAATTAAAGAGCCATGTTAAAATACGAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103247 CCAACAAAACCCTGGAAAAATTAAAGAGCCATGTTAAAATACGAAATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCTGAATAAAATACTTGAAAATTACAAG         GAGAAATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103297 CTGCTGAATAAAATACTTGAAAATTACAAGGTA...CAGGAGAAATTCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAGTGACTCTATCACCAACATGCTGGACACACTGATGCAAGCCAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104165 GAGTGACTCTATCACCAACATGCTGGACACACTGATGCAAGCCAAGATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACTCAGATAATGGCAATGCTGGCCCAGATCAAGACTCAGAGCTGCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104215 ACTCAGATAATGGCAATGCTGGCCCAGATCAAGACTCAGAGCTGCTTTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GATAACCACATTCTCACCACCATAGGGGACATCTTTGGGGCTGGCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104265 GATAACCACATTCTCACCACCATAGGGGACATCTTTGGGGCTGGCGTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GACCACCACCTCTGTGGTTAAATGGACCCTGGCCTTCCTGCTGCACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104315 GACCACCACCTCTGTGGTTAAATGGACCCTGGCCTTCCTGCTGCACAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTCAG         GTGAAGAAGAAGCTCTACGAGGAGATTGACCAGAAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104365 CTCAGGTG...CAGGTGAAGAAGAAGCTCTACGAGGAGATTGACCAGAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTGGGTTTCAGCCGCACACCAACTATCAGTGACCGTAACCGTCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104718 GTGGGTTTCAGCCGCACACCAACTATCAGTGACCGTAACCGTCTCCTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCTGGAGGCCACCATCCGAGAGGTGCTTCGCCTCAGGCCCGTGGCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104768 GCTGGAGGCCACCATCCGAGAGGTGCTTCGCCTCAGGCCCGTGGCCCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGCTCATCCCCCACAAGGCCAACGTTGACTCCAG         CATCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104818 TGCTCATCCCCCACAAGGCCAACGTTGACTCCAGGTG...CAGCATCGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGTTTGCTGTGGACAAGGGCACAGAAGTTATCATCAATCTGTGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105758 GAGTTTGCTGTGGACAAGGGCACAGAAGTTATCATCAATCTGTGGGCGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCATCACAATGAGAAGGAGTGGCACCAGCCGGATCAGTTCATGCCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105808 GCATCACAATGAGAAGGAGTGGCACCAGCCGGATCAGTTCATGCCTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1244       AGCGTTTCTTGAATCCAGCGGGGACCCAGCTCATCTCACCGTCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105858 ...CAGAGCGTTTCTTGAATCCAGCGGGGACCCAGCTCATCTCACCGTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GTAAGCTATTTGCCCTTCGGAGCAGGACCTCGCTCCTGTATAGGTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106421 GTAAGCTATTTGCCCTTCGGAGCAGGACCTCGCTCCTGTATAGGTGAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCTGGCCCGCCAGGAGCTCTTCCTCATCATGGCCTGGCTGCTGCAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106471 CCTGGCCCGCCAGGAGCTCTTCCTCATCATGGCCTGGCTGCTGCAGAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCGACCTGGAGGTGCCAGATGATGGGCAGCTGCCCTCCCTGGAAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106521 TCGACCTGGAGGTGCCAGATGATGGGCAGCTGCCCTCCCTGGAAGGCATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCCAAGGTGGTCTTTCTGATCGACTCTTTCAAAGTGAAGATCAAGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106571 CCCAAGGTGGTCTTTCTGATCGACTCTTTCAAAGTGAAGATCAAGGTGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .
   1488 CCAGGCCTGGAGGGAAGCCCAGGCTGAGGGTAGCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106621 CCAGGCCTGGAGGGAAGCCCAGGCTGAGGGTAGCACC