seq1 = pF1KE2683.tfa, 3069 bp
seq2 = pF1KE2683/gi568815593f_149630343.tfa (gi568815593f:149630343_149947555), 317213 bp

>pF1KE2683 3069
>gi568815593f:149630343_149947555 (Chr5)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-252  (190091-190264)   100% ->
253-465  (196331-196543)   100% ->
466-582  (200425-200541)   100% ->
583-1705  (202314-203436)   100% ->
1706-1742  (204332-204368)   100% ->
1743-1807  (204959-205023)   100% ->
1808-2618  (205921-206731)   100% ->
2619-2694  (209699-209774)   100% ->
2695-2816  (211914-212035)   100% ->
2817-2971  (215418-215572)   100% ->
2972-3069  (217116-217213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGGAACGACTGCGGCGCGCTGCTGGACGAAGAGCTCTCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGGAACGACTGCGGCGCGCTGCTGGACGAAGAGCTCTCCTCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTCAACTATCTCGCTGACACGCAG         GGTGGAGGGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 CTTCCTCAACTATCTCGCTGACACGCAGGTA...CAGGGTGGAGGGTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGAGGAGCAACTCTATGCTGACTTTCCAGAACTTGACCTCTCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190104 GGGAGGAGCAACTCTATGCTGACTTTCCAGAACTTGACCTCTCCCAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGCCAGCGACTTTGACTCGGCCACCTGCTTTGGGGAGCTGCAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190154 GATGCCAGCGACTTTGACTCGGCCACCTGCTTTGGGGAGCTGCAGTGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCAGAGAACTCAGAGACTGAACCCAACCAGTACAGCCCCGATGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190204 CCCAGAGAACTCAGAGACTGAACCCAACCAGTACAGCCCCGATGACTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTCTTCCAG         ATTGACAGTGAGAATGAGGCCCTCCTGGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 190254 AGCTCTTCCAGGTA...CAGATTGACAGTGAGAATGAGGCCCTCCTGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTCACCAAGACCCTGGATGACATCCCTGAAGATGACGTGGGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196361 GAGCTCACCAAGACCCTGGATGACATCCCTGAAGATGACGTGGGTCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCCTTCCCAGCCCTGGATGGTGGAGACGCTCTATCATGCACCTCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196411 TGCCTTCCCAGCCCTGGATGGTGGAGACGCTCTATCATGCACCTCAGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGCCTGCCCCCTCATCTGCACCCCCCAGCCCTGCCCCGGAGAAGCCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196461 CGCCTGCCCCCTCATCTGCACCCCCCAGCCCTGCCCCGGAGAAGCCCTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCCCAGCCCCTGAGGTGGACGAGCTCTCACTG         CTGCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 196511 GCCCCAGCCCCTGAGGTGGACGAGCTCTCACTGGTA...CAGCTGCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTCCTCCTGGCCACATCCTACCCAACATCAAGCTCTGACACCCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200433 GCTCCTCCTGGCCACATCCTACCCAACATCAAGCTCTGACACCCAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGGGACCGCCTGGCGCCAGGCAGGCCTCAGATCTAAAAGTCAACGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200483 AAGGGACCGCCTGGCGCCAGGCAGGCCTCAGATCTAAAAGTCAACGGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGTGTTAAG         GCGGACAGCACCCAAGACAAGAAGGCTCCCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 200533 TGTGTTAAGGTA...TAGGCGGACAGCACCCAAGACAAGAAGGCTCCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATGCAGTCTCAGAGCCGAAGTTGTACAGAACTACATAAGCACCTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202346 GATGCAGTCTCAGAGCCGAAGTTGTACAGAACTACATAAGCACCTCACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGGCACAGTGCTGCCTGCAGGATCGGGGTCTGCAGCCACCATGCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202396 CGGCACAGTGCTGCCTGCAGGATCGGGGTCTGCAGCCACCATGCCTCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGTCCCCGGCTCCCTGCCAAGGAGGACAAGGAGCCGGGTGAGGACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202446 AGTCCCCGGCTCCCTGCCAAGGAGGACAAGGAGCCGGGTGAGGACTGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAGCCCCCAGCCAGCTCCAGCCTCTCCCCGGGACTCCCTAGCTCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202496 GAGCCCCCAGCCAGCTCCAGCCTCTCCCCGGGACTCCCTAGCTCTGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGGCAGACCCCGGTGCCCCGGTTTCCCAGGAAGACATGCAGGCGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202546 GGGCAGACCCCGGTGCCCCGGTTTCCCAGGAAGACATGCAGGCGATGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAACTCATACGCTACATGCACACCTACTGCCTCCCCCAGAGGAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202596 CAACTCATACGCTACATGCACACCTACTGCCTCCCCCAGAGGAAGCTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCCACAGACCCCTGAGCCACTCCCCAAGGCCTGCAGCAACCCCTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202646 CCCACAGACCCCTGAGCCACTCCCCAAGGCCTGCAGCAACCCCTCCCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGGTCAGATCCCGGCCCTGGTCCCGGCACCACTCCAAAGCCTCCTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202696 AGGTCAGATCCCGGCCCTGGTCCCGGCACCACTCCAAAGCCTCCTGGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAGTTCTCCATTCTGAGGGAACTTCTGGCTCAAGACGTGCTCTGTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202746 GAGTTCTCCATTCTGAGGGAACTTCTGGCTCAAGACGTGCTCTGTGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CAGCAAACCCTACCGTCTGGCCACGCCTGTTTATGCCTCCCTCACACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202796 CAGCAAACCCTACCGTCTGGCCACGCCTGTTTATGCCTCCCTCACACCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGTCAAGGCCCAGGCCCCCCAAAGACAGTCAGGCCTCCCCTGGTCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202846 GGTCAAGGCCCAGGCCCCCCAAAGACAGTCAGGCCTCCCCTGGTCGCCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TCCTCGGTGGAGGAGGTAAGGATCGCAGCTTCACCCAAGAGCACCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202896 TCCTCGGTGGAGGAGGTAAGGATCGCAGCTTCACCCAAGAGCACCGGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CAGACCAAGCCTGCGCCCACTGCGGCTGGAGGTGAAAAGGGAGGTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202946 CAGACCAAGCCTGCGCCCACTGCGGCTGGAGGTGAAAAGGGAGGTCCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GGCCTGCCAGACTGCAGCAGCAGGAGGAGGAAGACGAGGAAGAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202996 GGCCTGCCAGACTGCAGCAGCAGGAGGAGGAAGACGAGGAAGAAGAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GAGGAAGAGGAAGAAGAAAAAGAGGAGGAGGAGGAGTGGGGCAGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203046 GAGGAAGAGGAAGAAGAAAAAGAGGAGGAGGAGGAGTGGGGCAGGAAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GCCAGGCCGAGGCCTGCCATGGACGAAGCTGGGGAGGAAGCTGGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203096 GCCAGGCCGAGGCCTGCCATGGACGAAGCTGGGGAGGAAGCTGGAGAGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CTGTGTGCCCCGTGCGGCGTTCTCGGAGACTGAACCCTGAGCTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203146 CTGTGTGCCCCGTGCGGCGTTCTCGGAGACTGAACCCTGAGCTGGGCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 TGGCTGACATTTGCAGATGAGCCGCTGGTCCCCTCGGAGCCCCAAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203196 TGGCTGACATTTGCAGATGAGCCGCTGGTCCCCTCGGAGCCCCAAGGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TCTGCCCTCACTGTGCCTGGCTCCCAAGGCCTACGACGTAGAGCGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203246 TCTGCCCTCACTGTGCCTGGCTCCCAAGGCCTACGACGTAGAGCGGGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TGGGCAGCCCCACGGACGAGGACAGTGGCCAAGACCAGCAGCTCCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203296 TGGGCAGCCCCACGGACGAGGACAGTGGCCAAGACCAGCAGCTCCTACGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GGACCCCAGATCCCTGCCCTGGAGAGCCCCTGTGAGAGTGGGTGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203346 GGACCCCAGATCCCTGCCCTGGAGAGCCCCTGTGAGAGTGGGTGTGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CATGGATGAGGACCCCAGCTGCCCGCAGCTCCCTCCCAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 203396 CATGGATGAGGACCCCAGCTGCCCGCAGCTCCCTCCCAGAGGTA...CAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 ACTCTCCCAGGTGCCTCATGCTGGCCTTGTCACAAAG         CGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 204332 ACTCTCCCAGGTGCCTCATGCTGGCCTTGTCACAAAGGTA...CAGCGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 CCAACTTTTGGCAAGAAGAGCTTTGAGCAGACCTTGACAGTGGAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204963 CCAACTTTTGGCAAGAAGAGCTTTGAGCAGACCTTGACAGTGGAGCTCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TGGCACAGCAG         GACTCACCCCACCCACCACACCACCGTACA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 205013 TGGCACAGCAGGTG...CAGGACTCACCCCACCCACCACACCACCGTACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 AGCCCACAGAGGAGGATCCCTTCAAACCAGACATCAAGCATAGTCTAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205951 AGCCCACAGAGGAGGATCCCTTCAAACCAGACATCAAGCATAGTCTAGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AAAGAAATAGCTCTCAGCCTCCCCTCCCCTGAGGGCCTCTCACTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206001 AAAGAAATAGCTCTCAGCCTCCCCTCCCCTGAGGGCCTCTCACTCAAGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 CACCCCAGGGGCTGCCCACAAGCTGCCAAAGAAGCACCCAGAGCGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206051 CACCCCAGGGGCTGCCCACAAGCTGCCAAAGAAGCACCCAGAGCGAAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 AGCTCCTGTCCCACCTGCGACATGCCACAGCCCAGCCAGCCTCCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206101 AGCTCCTGTCCCACCTGCGACATGCCACAGCCCAGCCAGCCTCCCAGGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 GGCCAGAAGCGTCCCTTCTCCTGTTCCTTTGGAGACCATGACTACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206151 GGCCAGAAGCGTCCCTTCTCCTGTTCCTTTGGAGACCATGACTACTGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 GGTGCTCCGACCAGAAGGCGTCCTGCAAAGGAAGGTGCTGAGGTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206201 GGTGCTCCGACCAGAAGGCGTCCTGCAAAGGAAGGTGCTGAGGTCCTGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 AGCCGTCTGGGGTTCACCTTGAGGACTGGCCCCAGCAGGGTGCCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206251 AGCCGTCTGGGGTTCACCTTGAGGACTGGCCCCAGCAGGGTGCCCCTTGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 GCTGAGGCACAGGCCCCTGGCAGGGAGGAAGACAGAAGCTGTGATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206301 GCTGAGGCACAGGCCCCTGGCAGGGAGGAAGACAGAAGCTGTGATGCTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 CGCCCCACCCAAGGACAGCACGCTGCTGAGAGACCATGAGATCCGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206351 CGCCCCACCCAAGGACAGCACGCTGCTGAGAGACCATGAGATCCGTGCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 GCCTCACCAAACACTTTGGGCTGCTGGAGACCGCCCTGGAGGAGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206401 GCCTCACCAAACACTTTGGGCTGCTGGAGACCGCCCTGGAGGAGGAAGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 CTGGCCTCCTGCAAGAGCCCTGAGTATGACACTGTCTTTGAAGACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206451 CTGGCCTCCTGCAAGAGCCCTGAGTATGACACTGTCTTTGAAGACAGCAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 CAGCAGCAGCGGCGAGAGCAGCTTCCTCCCAGAGGAGGAAGAGGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206501 CAGCAGCAGCGGCGAGAGCAGCTTCCTCCCAGAGGAGGAAGAGGAAGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 GGGAGGAGGAGGAGGAGGACGATGAAGAAGAGGACTCAGGGGTCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206551 GGGAGGAGGAGGAGGAGGACGATGAAGAAGAGGACTCAGGGGTCAGCCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 ACTTGCTCTGACCACTGCCCCTACCAGAGCCCACCAAGCAAGGCCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206601 ACTTGCTCTGACCACTGCCCCTACCAGAGCCCACCAAGCAAGGCCAACCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538 GCAGCTCTGTTCCCGCAGCCGCTCAAGCTCTGGCTCTTCACCCTGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206651 GCAGCTCTGTTCCCGCAGCCGCTCAAGCTCTGGCTCTTCACCCTGCCACT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2588 CCTGGTCACCAGCCACTCGAAGGAACTTCAG         ATGTGAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 206701 CCTGGTCACCAGCCACTCGAAGGAACTTCAGGTA...CAGATGTGAGAGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 AGAGGGCCGTGTTCAGACAGAACGCCAAGCATCCGGCACGCCAGGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209709 AGAGGGCCGTGTTCAGACAGAACGCCAAGCATCCGGCACGCCAGGAAGCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679 GCGGGAAAAGGCCATT         GGGGAAGGCCGCGTGGTGTACATTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 209759 GCGGGAAAAGGCCATTGTA...CAGGGGGAAGGCCGCGTGGTGTACATTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2720 AAAATCTCTCCAGCGACATGAGCTCCCGAGAGCTGAAGAGGCGCTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211939 AAAATCTCTCCAGCGACATGAGCTCCCGAGAGCTGAAGAGGCGCTTTGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770 GTGTTTGGTGAGATTGAGGAGTGCGAGGTGCTGACAAGAAATAGGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 211989 GTGTTTGGTGAGATTGAGGAGTGCGAGGTGCTGACAAGAAATAGGAGGTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2817       AGGCGAGAAGTACGGCTTCATCACCTACCGGTGTTCTGAGCACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212039 ...CAGAGGCGAGAAGTACGGCTTCATCACCTACCGGTGTTCTGAGCACG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2861 CGGCCCTCTCTTTGACAAAGGGCGCTGCCCTGAGGAAGCGCAACGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215462 CGGCCCTCTCTTTGACAAAGGGCGCTGCCCTGAGGAAGCGCAACGAGCCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2911 TCCTTCCAGCTGAGCTACGGAGGGCTCCGGCACTTCTGCTGGCCCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215512 TCCTTCCAGCTGAGCTACGGAGGGCTCCGGCACTTCTGCTGGCCCAGATA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2961 CACTGACTACG         ATTCCAATTCAGAAGAGGCCCTTCCTGCGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 215562 CACTGACTACGGTA...CAGATTCCAATTCAGAAGAGGCCCTTCCTGCGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3002 CAGGGAAAAGCAAGTATGAAGCCATGGATTTTGACAGCTTACTGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217146 CAGGGAAAAGCAAGTATGAAGCCATGGATTTTGACAGCTTACTGAAAGAG

   3150     .    :    .
   3052 GCCCAGCAGAGCCTGCAT
        ||||||||||||||||||
 217196 GCCCAGCAGAGCCTGCAT