seq1 = pF1KE2681.tfa, 1098 bp
seq2 = pF1KE2681/gi568815587r_62732955.tfa (gi568815587r:62732955_62939570), 206616 bp

>pF1KE2681 1098
>gi568815587r:62732955_62939570 (Chr11)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-171  (100143-100249)   100% ->
172-293  (100336-100457)   100% ->
294-369  (103535-103610)   100% ->
370-516  (103730-103876)   99% ->
517-618  (104039-104140)   100% ->
619-719  (105044-105144)   100% ->
720-775  (105240-105295)   100% ->
776-921  (105634-105779)   100% ->
922-1098  (106440-106616)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGATCTTGAAAG         GGGTAAATCTTCAGCGAAAACAGGCGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGATCTTGAAAGGTG...CAGGGGTAAATCTTCAGCGAAAACAGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 CGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTGTTGGGGCACCGGCGGCGAGACCCAG         ATGCTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100220 CTGTGTTGGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGGTG...CAGATGCTGGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGATGGCATATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100347 CTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGATGGCATATTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100397 AGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGCCGACGG         CACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100447 CAGGCCGACGGGTA...CAGCACCCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103565 TCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCAGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    370      CTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103615 ..CAGCTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGTAGGATGCGCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103775 GACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTTTTCAGGGCCAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 103825 GAAGATATGGGACCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTGTTCAGGGCCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AC         GTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103875 ACGTG...CAGGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCATCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104078 GACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGGGTACCACCAG         GTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104128 AGGGTACCACCAGGTA...TAGGTCCGTGTTTATGATCCAGCATCCCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105072 AGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGACCCTCACTCCGGGAGGCAA         CTCAGTGATTGTGGGAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105122 ATGACCCTCACTCCGGGAGGCAAGTG...CAGCTCAGTGATTGTGGGAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105258 CACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGCAAGGTG...TAGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105637 GTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105687 TGCCACCCTTCAAAGCCTCTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105737 GAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATAAGGTA...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    922   GATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106438 AGGATGAGCCCCAAGAGCCTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106488 ACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCCAAGCGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106538 GCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAA

   1150     .    :    .    :    .
   1070 AGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 106588 AGAAGAAGCGGCCTGGGTCCACCAGCCCC